More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_24481 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_24481  thioredoxin-like protein TxlA  100 
 
 
188 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0274  thioredoxin-like protein TxlA  59.16 
 
 
191 aa  229  2e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2070  thioredoxin-like protein TxlA  56.02 
 
 
185 aa  206  2e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03201  thioredoxin-like protein TxlA  46.28 
 
 
189 aa  182  3e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1608  thioredoxin-like protein TxlA  45.41 
 
 
189 aa  181  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02671  thioredoxin-like protein TxlA  42.86 
 
 
188 aa  154  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02751  thioredoxin-like protein TxlA  35.21 
 
 
182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02651  thioredoxin-like protein TxlA  35.37 
 
 
153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.472056  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3340  Thioredoxin domain protein  36.75 
 
 
182 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02641  thioredoxin-like protein TxlA  31.97 
 
 
156 aa  106  2e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0244  thioredoxin-like protein TxlA  39.18 
 
 
181 aa  106  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_8114  predicted protein  42.06 
 
 
128 aa  105  6e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0624968 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3611  thioredoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
196 aa  104  9e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1504  thioredoxin domain-containing protein  31.69 
 
 
193 aa  102  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.519816 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0338  thioredoxin-related  29.89 
 
 
192 aa  101  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.484295 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1263  Thioredoxin domain protein  33.53 
 
 
189 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316864  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2128  thioredoxin  37.23 
 
 
191 aa  99.8  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.587927  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2340  thioredoxin domain protein  34.27 
 
 
188 aa  99.4  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2289  Thioredoxin domain protein  34.27 
 
 
188 aa  99.4  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45450  predicted protein  31.91 
 
 
355 aa  69.7  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0305  protein-disulfide reductase  37.14 
 
 
611 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.069977 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3476  protein-disulfide reductase  36.17 
 
 
617 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.842688 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  29.52 
 
 
109 aa  63.2  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  27.59 
 
 
133 aa  63.2  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0296  protein-disulfide reductase  36.19 
 
 
611 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.58017  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0861  Thioredoxin domain  35.24 
 
 
104 aa  63.2  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  33.96 
 
 
108 aa  62.4  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0636  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.63 
 
 
466 aa  62.4  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.619274 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2921  Protein-disulfide reductase  38.96 
 
 
604 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000351714 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  29.52 
 
 
110 aa  62  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  29.52 
 
 
110 aa  62  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  28.57 
 
 
110 aa  62  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2990  thiol:disulfide interchange transmembrane protein  39.47 
 
 
608 aa  61.6  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03717  thioredoxin  36.26 
 
 
113 aa  61.6  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0356  protein-disulfide reductase  34.04 
 
 
615 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.456746 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  33.96 
 
 
110 aa  61.2  0.000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  34.31 
 
 
108 aa  60.8  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01200  thioredoxin (trx), putative  30.19 
 
 
138 aa  60.8  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0954839  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  33.7 
 
 
107 aa  60.5  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2114  thioredoxin family protein  25.81 
 
 
159 aa  60.5  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.14615  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4110  thioredoxin  33.33 
 
 
108 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.465308  hitchhiker  0.0000724164 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5983  thioredoxin  32.67 
 
 
108 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  28.85 
 
 
108 aa  60.5  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  31.25 
 
 
108 aa  60.5  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69200  thioredoxin  32.67 
 
 
108 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3268  Protein-disulfide reductase  38.1 
 
 
605 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0181869 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2602  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  31.53 
 
 
627 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3747  thiol:disulfide interchange protein DsbD  31.53 
 
 
627 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.14193  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  32.38 
 
 
108 aa  60.1  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3140  putative thiol:disulfide interchange protein DsbD  31.53 
 
 
627 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3507  putative thiol:disulfide interchange protein DsbD  31.53 
 
 
627 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.456139  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1953  putative thiol:disulfide interchange protein DsbD  31.53 
 
 
627 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.684775  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3717  thiol:disulfide interchange protein, putative  31.53 
 
 
627 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0308  thioredoxin  28.7 
 
 
108 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717076  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2730  protein-disulfide reductase  39.19 
 
 
615 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1719  thioredoxin  36.84 
 
 
102 aa  60.1  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00129431  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0377  protein-disulfide reductase  39.19 
 
 
615 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1854  thioredoxin  35.05 
 
 
102 aa  59.3  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0862  thioredoxin  35.16 
 
 
102 aa  58.9  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.48028  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  31.82 
 
 
109 aa  58.9  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  32.38 
 
 
109 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  32.38 
 
 
109 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  32.38 
 
 
109 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  32.38 
 
 
109 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  32.38 
 
 
109 aa  58.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  32.38 
 
 
109 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  32.38 
 
 
109 aa  58.5  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  32.38 
 
 
109 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  32.38 
 
 
109 aa  58.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  32.38 
 
 
109 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  32.38 
 
 
109 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  32.38 
 
 
109 aa  58.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  32.38 
 
 
109 aa  58.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  32.38 
 
 
109 aa  58.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  32.38 
 
 
109 aa  58.2  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  31.19 
 
 
107 aa  58.2  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  33.64 
 
 
108 aa  58.5  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1185  Thioredoxin domain  37.8 
 
 
125 aa  58.2  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3775  thiol:disulfide interchange protein, putative  31.53 
 
 
627 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  33.64 
 
 
108 aa  58.5  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  26.42 
 
 
109 aa  58.5  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  28.3 
 
 
108 aa  58.5  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  33.64 
 
 
108 aa  58.5  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  32.38 
 
 
108 aa  58.5  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  33.64 
 
 
108 aa  58.5  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  28.57 
 
 
108 aa  58.2  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0460  thioredoxin  34.58 
 
 
108 aa  58.2  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.810082  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  33.01 
 
 
108 aa  57.8  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0398  thioredoxin  32.38 
 
 
108 aa  57.8  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  33 
 
 
119 aa  58.2  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0626  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.19 
 
 
471 aa  58.2  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.690861  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  29.36 
 
 
104 aa  58.2  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0591  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region/thioredoxin-related  30.91 
 
 
471 aa  57.8  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.945166  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  34.52 
 
 
107 aa  57.8  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0694  thioredoxin  31.76 
 
 
106 aa  57.8  0.00000009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0278  protein-disulfide reductase  34.04 
 
 
614 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.108061 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  33.64 
 
 
108 aa  57  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0036  thioredoxin  29.47 
 
 
108 aa  57.4  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0705575 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  34.48 
 
 
108 aa  57.4  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  30.77 
 
 
108 aa  57.4  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0310601 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>