More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_05411 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_05411  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 133 aa  273  7e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2127  50S ribosomal protein L21  80.17 
 
 		 121 aa  196  9e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.389677 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0546  50S ribosomal protein L21  80 
 
 		 125 aa  191  3e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.797302  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0915  50S ribosomal protein L21  79.44 
 
 		 139 aa  183  7e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17711  50S ribosomal protein L21  79.44 
 
 		 139 aa  183  7e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0269393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13981  50S ribosomal protein L21  67.27 
 
 		 170 aa  160  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.510472 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1442  50S ribosomal protein L21  66.36 
 
 		 146 aa  152  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15451  50S ribosomal protein L21  67.96 
 
 		 166 aa  150  8e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.946865  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15051  50S ribosomal protein L21  65.05 
 
 		 146 aa  147  6e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.645106  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15301  50S ribosomal protein L21  66.99 
 
 		 146 aa  147  7e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0646  50S ribosomal protein L21  55.56 
 
 		 130 aa  134  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362263  normal  0.661162 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1219  50S ribosomal protein L21  57.27 
 
 		 127 aa  104  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1516  50S ribosomal protein L21  49.09 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00385929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2771  50S ribosomal protein L21  56.88 
 
 		 123 aa  100  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0693096 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3346  50S ribosomal protein L21  56.88 
 
 		 123 aa  100  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3243  50S ribosomal protein L21P  52.73 
 
 		 136 aa  96.3  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0423  50S ribosomal protein L21  47.27 
 
 		 135 aa  94  6e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.984007  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02720  50S ribosomal protein L21  42.86 
 
 		 224 aa  92.8  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3466  50S ribosomal protein L21  50.91 
 
 		 136 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.302782 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  39.22 
 
 		 104 aa  90.1  8e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1465  50S ribosomal protein L21  41.9 
 
 		 208 aa  86.7  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 104 aa  86.3  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  37.14 
 
 		 105 aa  85.1  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2481  ribosomal protein L21  41.35 
 
 		 105 aa  84.7  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.726202  normal  0.224153 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0179  ribosomal protein L21  40.2 
 
 		 102 aa  84.3  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000183343  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4884  ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  84  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.125132  normal  0.112158 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35695  predicted protein  41.58 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00157313  normal  0.015942 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 114 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 102 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 102 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 102 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 		 102 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1624  ribosomal protein L21  39.81 
 
 		 103 aa  80.5  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.511326 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1107  ribosomal protein L21  35.51 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212125  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  38.24 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1281  50S ribosomal protein L21  40.38 
 
 		 105 aa  79  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00406184  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  37.25 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 102 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  37.25 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1325  50S ribosomal protein L21  34.58 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000243577  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  38.24 
 
 		 102 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  38.24 
 
 		 102 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  38.24 
 
 		 102 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  38.24 
 
 		 102 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  38.24 
 
 		 102 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  38.24 
 
 		 102 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  38.24 
 
 		 102 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3461  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  39.05 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.2589  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1136  50S ribosomal protein L21  34.58 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000463579  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1724  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  38.24 
 
 		 102 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  33.66 
 
 		 105 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4193  50S ribosomal protein L21  33.66 
 
 		 105 aa  77.4  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1545  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1118  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00565538  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0107  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  76.6  0.00000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  34.31 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1036  50S ribosomal protein L21  33.65 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0850957  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  35.64 
 
 		 102 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  31.68 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0997  50S ribosomal protein L21  37.25 
 
 		 104 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0418  50S ribosomal protein L21  32.35 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  39.81 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0090  ribosomal protein L21  36.89 
 
 		 104 aa  75.1  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0253014 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  32.67 
 
 		 104 aa  75.1  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3639  50S ribosomal protein L21  35.85 
 
 		 106 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.211161  normal  0.460303 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  32.35 
 
 		 102 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0891  50S ribosomal protein L21  34.95 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0723214 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3283  50S ribosomal protein L21  32.67 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3189  50S ribosomal protein L21  34.31 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1573  50S ribosomal protein L21  36.27 
 
 		 103 aa  74.3  0.0000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.337451  normal  0.754011 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  36.27 
 
 		 100 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1755  50S ribosomal protein L21  36.27 
 
 		 103 aa  74.3  0.0000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.092624  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  34.65 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1751  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  74.3  0.0000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000842566  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3005  50S ribosomal protein L21  32.67 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0895  50S ribosomal protein L21  37.25 
 
 		 103 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000281262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3125  50S ribosomal protein L21  37.25 
 
 		 103 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000193081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  36.27 
 
 		 103 aa  73.6  0.0000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2228  50S ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 101 aa  73.6  0.0000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  34.31 
 
 		 102 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4512  ribosomal protein L21  36.27 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  35.29 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3652  50S ribosomal protein L21  37.25 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  36.27 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3089  50S ribosomal protein L21  37.25 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3219  50S ribosomal protein L21  37.25 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000450477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4723  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 105 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3072  50S ribosomal protein L21  34.65 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000583134  unclonable  0.0000000178409 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2670  50S ribosomal protein L21  32.77 
 
 		 123 aa  72  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000122926  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1180  50S ribosomal protein L21  32.69 
 
 		 104 aa  72.4  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00135426  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  35.64 
 
 		 156 aa  72  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000031212  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>