More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3243 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3243  50S ribosomal protein L21P  100 
 
 
136 aa  271  2.0000000000000002e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0646  50S ribosomal protein L21  64.15 
 
 
130 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362263  normal  0.661162 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1516  50S ribosomal protein L21  67.83 
 
 
130 aa  150  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00385929  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0423  50S ribosomal protein L21  67.24 
 
 
135 aa  147  6e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.984007  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05411  50S ribosomal protein L21  52.73 
 
 
133 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15051  50S ribosomal protein L21  52.21 
 
 
146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.645106  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3466  50S ribosomal protein L21  55.22 
 
 
136 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.302782 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2127  50S ribosomal protein L21  52.29 
 
 
121 aa  123  8.000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.389677 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1442  50S ribosomal protein L21  54.9 
 
 
146 aa  122  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0546  50S ribosomal protein L21  50 
 
 
125 aa  120  7e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.797302  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15451  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 
166 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.946865  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15301  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 
146 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0915  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
139 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17711  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
139 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0269393  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2771  50S ribosomal protein L21  58.46 
 
 
123 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0693096 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13981  50S ribosomal protein L21  50 
 
 
170 aa  114  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.510472 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3346  50S ribosomal protein L21  58.46 
 
 
123 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  45.19 
 
 
105 aa  107  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1219  50S ribosomal protein L21  55.46 
 
 
127 aa  105  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  48.04 
 
 
104 aa  103  6e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 
103 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 
102 aa  97.8  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 
102 aa  97.8  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 
102 aa  97.8  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 
102 aa  96.7  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0484  ribosomal protein L21  43.27 
 
 
105 aa  96.3  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.239256  normal  0.0811402 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  45.54 
 
 
103 aa  96.3  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 
102 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 
102 aa  95.5  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 
102 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 
102 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 
102 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 
102 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 
102 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 
102 aa  95.5  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  44.12 
 
 
103 aa  95.1  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  43.56 
 
 
104 aa  95.1  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1465  50S ribosomal protein L21  36.22 
 
 
208 aa  94.7  4e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  42 
 
 
104 aa  94.7  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02720  50S ribosomal protein L21  42.31 
 
 
224 aa  94.4  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0455  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 
104 aa  94.7  4e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000169225  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1192  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 
102 aa  94  6e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000108547  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 
102 aa  93.2  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 
103 aa  93.2  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  43 
 
 
103 aa  93.2  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  41 
 
 
114 aa  93.2  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35695  predicted protein  44 
 
 
103 aa  92  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00157313  normal  0.015942 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  43 
 
 
132 aa  91.3  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020004  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  46.08 
 
 
102 aa  91.3  4e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1107  ribosomal protein L21  44.76 
 
 
134 aa  90.5  6e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212125  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  43.14 
 
 
104 aa  90.5  7e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000133447  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1325  50S ribosomal protein L21  43.81 
 
 
132 aa  90.1  8e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000243577  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1370  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 
104 aa  90.5  8e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000286753  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  39.6 
 
 
131 aa  89.4  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1326  50S ribosomal protein L21P  44.66 
 
 
99 aa  90.1  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000107304  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  42.57 
 
 
103 aa  89  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 
103 aa  89.4  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0957  50S ribosomal protein L21P  45 
 
 
100 aa  89  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000239901  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  41 
 
 
103 aa  88.6  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1036  50S ribosomal protein L21  41.35 
 
 
106 aa  88.2  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0850957  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
102 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4884  ribosomal protein L21  44 
 
 
103 aa  88.2  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.125132  normal  0.112158 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1452  ribosomal protein L21  45.1 
 
 
103 aa  87.4  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000000564167  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 
103 aa  87.8  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1136  50S ribosomal protein L21  41.9 
 
 
134 aa  87.8  5e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000463579  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3917  ribosomal protein L21  40.2 
 
 
103 aa  87.8  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  39.6 
 
 
103 aa  87.4  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1336  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 
104 aa  87.4  6e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100172  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 
104 aa  87.4  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0891  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 
103 aa  87  8e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0723214 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  42.57 
 
 
102 aa  86.7  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1350  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 
104 aa  86.7  9e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0226901  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0107  50S ribosomal protein L21  40 
 
 
103 aa  86.7  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2246  ribosomal protein L21  42.57 
 
 
103 aa  86.3  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000579103  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  40.59 
 
 
103 aa  86.3  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 
103 aa  86.3  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0418  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 
103 aa  86.3  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3072  50S ribosomal protein L21  44 
 
 
103 aa  85.9  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000583134  unclonable  0.0000000178409 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3005  50S ribosomal protein L21  41.94 
 
 
124 aa  85.9  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4218  ribosomal protein L21  40.59 
 
 
103 aa  85.5  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  45 
 
 
102 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0179  ribosomal protein L21  43.56 
 
 
102 aa  85.5  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000183343  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  42.57 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0511  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 
103 aa  84.7  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0526818 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 
104 aa  85.1  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1180  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 
104 aa  85.1  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00135426  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3283  50S ribosomal protein L21  40 
 
 
125 aa  84.7  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1211  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 
102 aa  84.3  5e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000816286  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 
103 aa  84.3  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  40 
 
 
103 aa  84  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  40 
 
 
103 aa  83.6  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  40 
 
 
103 aa  83.6  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  40 
 
 
103 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0285  50S ribosomal protein L21  41 
 
 
103 aa  83.6  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.253807  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0462  50S ribosomal protein L21  41 
 
 
103 aa  83.6  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00315446 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1281  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 
105 aa  83.2  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00406184  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  41.58 
 
 
149 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  37 
 
 
103 aa  82  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  37 
 
 
103 aa  82  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>