More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3466 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3466  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 136 aa  278  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.302782 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0646  50S ribosomal protein L21  56.3 
 
 		 130 aa  160  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362263  normal  0.661162 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1516  50S ribosomal protein L21  64.84 
 
 		 130 aa  153  9e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00385929  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0423  50S ribosomal protein L21  66.67 
 
 		 135 aa  150  4e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.984007  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3346  50S ribosomal protein L21  72.48 
 
 		 123 aa  141  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2771  50S ribosomal protein L21  72.48 
 
 		 123 aa  141  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0693096 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05411  50S ribosomal protein L21  50.91 
 
 		 133 aa  124  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0546  50S ribosomal protein L21  51.38 
 
 		 125 aa  123  1e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.797302  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3243  50S ribosomal protein L21P  62.83 
 
 		 136 aa  122  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13981  50S ribosomal protein L21  44.92 
 
 		 170 aa  120  9e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.510472 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2127  50S ribosomal protein L21  50.93 
 
 		 121 aa  118  3e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.389677 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0915  50S ribosomal protein L21  44.72 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17711  50S ribosomal protein L21  44.72 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0269393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1442  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 146 aa  111  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15051  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.645106  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1219  50S ribosomal protein L21  54.69 
 
 		 127 aa  108  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15451  50S ribosomal protein L21  48 
 
 		 166 aa  107  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.946865  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15301  50S ribosomal protein L21  48 
 
 		 146 aa  107  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  50.96 
 
 		 105 aa  105  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 102 aa  100  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 102 aa  100  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 102 aa  100  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 103 aa  98.6  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  52.48 
 
 		 102 aa  99  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  52.48 
 
 		 102 aa  99  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  52.48 
 
 		 102 aa  99  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  52.48 
 
 		 102 aa  99  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  52.48 
 
 		 102 aa  99  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  52.48 
 
 		 102 aa  99  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  52.48 
 
 		 102 aa  99  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  52.48 
 
 		 102 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0484  ribosomal protein L21  44.23 
 
 		 105 aa  97.4  5e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.239256  normal  0.0811402 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 103 aa  94.4  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  94  7e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 104 aa  92.8  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35695  predicted protein  48 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00157313  normal  0.015942 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1118  50S ribosomal protein L21  45 
 
 		 146 aa  91.7  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00565538  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0455  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 104 aa  91.3  4e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000169225  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  49 
 
 		 103 aa  90.9  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  47 
 
 		 114 aa  90.5  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  44 
 
 		 104 aa  90.1  9e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1370  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000286753  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 102 aa  89  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1107  ribosomal protein L21  39.23 
 
 		 134 aa  88.6  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212125  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1325  50S ribosomal protein L21  38.46 
 
 		 132 aa  87.8  4e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000243577  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  43 
 
 		 104 aa  88.2  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1136  50S ribosomal protein L21  36.92 
 
 		 134 aa  87.4  6e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000463579  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 102 aa  86.7  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0462  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00315446 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0285  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.253807  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1452  ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000000564167  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1180  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00135426  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2246  ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  84.3  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000579103  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0418  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  84.3  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  41.58 
 
 		 103 aa  84.3  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1036  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 106 aa  84  6e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0850957  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 102 aa  83.6  8e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4218  ribosomal protein L21  42 
 
 		 103 aa  83.6  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  40 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  41 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1281  50S ribosomal protein L21  43 
 
 		 105 aa  83.2  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00406184  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0839  50S ribosomal protein L21  44 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0751  50S ribosomal protein L21  44 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510595 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4884  ribosomal protein L21  44 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.125132  normal  0.112158 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0720  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456821  normal  0.0127169 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0688  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1305  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3526  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248668  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2523  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.444595  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1192  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 102 aa  82  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000108547  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0509  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00322629  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3258  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3666  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000619372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1815  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0720  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1140  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0099  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000205057  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0446  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3490  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761621  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0484  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00989792  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  42 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0581  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000178483  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0551  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000001032  normal  0.0263071 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0511  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526818 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2802  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000188755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  43 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1320  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0375246  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4497  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 104 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  41 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  40 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  41 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020004  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  40 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  41 
 
 		 103 aa  81.3  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3917  ribosomal protein L21  41 
 
 		 103 aa  81.3  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  40 
 
 		 103 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  40 
 
 		 103 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>