More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_15301 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_15301  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 146 aa  289  8e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15451  50S ribosomal protein L21  93.15 
 
 		 166 aa  236  1e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.946865  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1442  50S ribosomal protein L21  91.1 
 
 		 146 aa  234  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15051  50S ribosomal protein L21  83.97 
 
 		 146 aa  211  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.645106  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0915  50S ribosomal protein L21  55.56 
 
 		 139 aa  155  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17711  50S ribosomal protein L21  55.56 
 
 		 139 aa  155  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0269393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13981  50S ribosomal protein L21  57.66 
 
 		 170 aa  154  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.510472 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0546  50S ribosomal protein L21  53.66 
 
 		 125 aa  151  2.9999999999999998e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.797302  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05411  50S ribosomal protein L21  64.55 
 
 		 133 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2127  50S ribosomal protein L21  59.29 
 
 		 121 aa  148  3e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.389677 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0646  50S ribosomal protein L21  49.11 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362263  normal  0.661162 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1219  50S ribosomal protein L21  48.84 
 
 		 127 aa  99.8  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1516  50S ribosomal protein L21  42.97 
 
 		 130 aa  98.2  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00385929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  88.6  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0423  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 135 aa  89.4  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.984007  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3243  50S ribosomal protein L21P  52.94 
 
 		 136 aa  89  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02720  50S ribosomal protein L21  38.39 
 
 		 224 aa  87.8  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3346  50S ribosomal protein L21  51.89 
 
 		 123 aa  87  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2771  50S ribosomal protein L21  51.89 
 
 		 123 aa  87  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0693096 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  38.83 
 
 		 104 aa  86.3  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1136  50S ribosomal protein L21  34.51 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000463579  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1465  50S ribosomal protein L21  35.94 
 
 		 208 aa  84.7  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  35.92 
 
 		 105 aa  84.3  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  35.29 
 
 		 104 aa  84  7e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  36.07 
 
 		 149 aa  83.6  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1107  ribosomal protein L21  33.63 
 
 		 134 aa  83.6  9e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212125  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_002936  DET1325  50S ribosomal protein L21  32.74 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000243577  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 102 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  40.38 
 
 		 103 aa  80.5  0.000000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1281  50S ribosomal protein L21  35.92 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00406184  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1036  50S ribosomal protein L21  40 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0850957  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0089  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 102 aa  78.6  0.00000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.199465  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0129  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 102 aa  78.6  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35695  predicted protein  39.6 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00157313  normal  0.015942 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  33.66 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0098  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 102 aa  77.8  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  34.95 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  33.66 
 
 		 132 aa  77.4  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020004  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1751  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000842566  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0090  ribosomal protein L21  39.05 
 
 		 104 aa  77  0.00000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0253014 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 102 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3033  ribosomal protein L21  36.54 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1118  50S ribosomal protein L21  36.27 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00565538  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3466  50S ribosomal protein L21  48 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.302782 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 102 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 102 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  34.65 
 
 		 102 aa  75.5  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0309  50S ribosomal protein L21  26.56 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.848766  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1724  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 104 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  36.89 
 
 		 104 aa  75.1  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0107  50S ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  34.65 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0525  ribosomal protein L21  34.65 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2246  ribosomal protein L21  32.35 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000579103  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0997  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  34.31 
 
 		 103 aa  73.9  0.0000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1538  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 102 aa  73.9  0.0000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1545  50S ribosomal protein L21  35.64 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0852  50S ribosomal protein L21  33.66 
 
 		 103 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265275  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1624  ribosomal protein L21  35.92 
 
 		 103 aa  73.9  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.511326 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1192  50S ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 102 aa  73.9  0.0000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000108547  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 102 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 102 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 102 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 102 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1004  50S ribosomal protein L21  33.66 
 
 		 103 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000156676  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 102 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 102 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 102 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 102 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 102 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1483  ribosomal protein L21  35.29 
 
 		 103 aa  73.6  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2228  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 101 aa  72.8  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0502  ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 102 aa  72  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0183  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 102 aa  72.8  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  28.43 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0954  50S ribosomal protein L21  33.66 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.361102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1113  ribosomal protein L21  33.33 
 
 		 118 aa  72  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.582987  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  31.37 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  33.33 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000031212  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3072  50S ribosomal protein L21  34.31 
 
 		 103 aa  71.6  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000583134  unclonable  0.0000000178409 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  31.68 
 
 		 103 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0869  50S ribosomal protein L21  32.67 
 
 		 103 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000245664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0179  ribosomal protein L21  35.64 
 
 		 102 aa  72  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000183343  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3639  50S ribosomal protein L21  33.02 
 
 		 106 aa  72  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.211161  normal  0.460303 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0891  50S ribosomal protein L21  34.95 
 
 		 103 aa  71.6  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0723214 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  30.39 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1069  50S ribosomal protein L21  33.66 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000190707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0967  50S ribosomal protein L21  33.66 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000186548  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3323  50S ribosomal protein L21  33.66 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000033092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1036  50S ribosomal protein L21  33.66 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168941  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0957  50S ribosomal protein L21P  37 
 
 		 100 aa  71.2  0.000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000239901  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  33.33 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>