More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_10261 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_09181  putative modulator of DNA gyrase  79.51 
 
 
450 aa  752    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10271  putative modulator of DNA gyrase  96.67 
 
 
450 aa  886    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.229888  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0958  putative modulator of DNA gyrase  92.89 
 
 
450 aa  859    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10261  putative modulator of DNA gyrase  100 
 
 
450 aa  914    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14411  putative modulator of DNA gyrase  55.56 
 
 
461 aa  545  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1308  modulator of DNA gyrase  54.67 
 
 
456 aa  534  1e-150  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1167  modulator of DNA gyrase  55.56 
 
 
455 aa  531  1e-149  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.975255  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10471  putative modulator of DNA gyrase  56.94 
 
 
462 aa  511  1e-144  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0348305  hitchhiker  0.00321513 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0365  putative modulator of DNA gyrase  56.48 
 
 
462 aa  509  1e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09231  putative modulator of DNA gyrase  54.57 
 
 
459 aa  492  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.276659  hitchhiker  0.00000210119 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1289  putative modulator of DNA gyrase  46.62 
 
 
446 aa  426  1e-118  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.387477 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1475  DNA gyrase modulator peptidase U62  46.56 
 
 
453 aa  411  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2764  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  46.12 
 
 
446 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1348  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  44.77 
 
 
446 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4625  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  44.22 
 
 
444 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2178  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  46.89 
 
 
446 aa  398  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2130  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  46.67 
 
 
446 aa  395  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0200  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.55 
 
 
435 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.06513  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1709  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.18 
 
 
441 aa  116  7.999999999999999e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06836  peptidase  22.69 
 
 
447 aa  116  8.999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000861  predicted Zn-dependent protease  23.15 
 
 
447 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000133704  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0661  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26 
 
 
445 aa  113  6e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0326  TldD/PmbA family protein  30.22 
 
 
449 aa  113  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0202  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.45 
 
 
435 aa  113  9e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0734503  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0324  TldD/PmbA family protein  29.91 
 
 
449 aa  113  9e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1030  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.6 
 
 
442 aa  109  9.000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0352  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.84 
 
 
452 aa  103  7e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.678191  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1049  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.54 
 
 
457 aa  100  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000445588  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0071  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.24 
 
 
447 aa  99  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.208063  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2696  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.93 
 
 
462 aa  96.3  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.781892  normal  0.389793 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1541  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.74 
 
 
450 aa  96.3  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0734056 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2382  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.63 
 
 
438 aa  94.4  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0057  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.54 
 
 
435 aa  93.6  7e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1482  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.22 
 
 
442 aa  93.2  8e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000528913  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1002  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.62 
 
 
447 aa  93.2  9e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0543  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.11 
 
 
446 aa  87.8  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3721  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.04 
 
 
459 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000190523  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2060  pmbA protein, putative  20.95 
 
 
446 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.525901  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0294  microcin-processing peptidase 1  28.23 
 
 
448 aa  80.9  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4112  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.26 
 
 
465 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3740  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.41 
 
 
460 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1709  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.89 
 
 
445 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0311479  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1234  pmbA protein  26.93 
 
 
444 aa  79.7  0.0000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2442  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  21.35 
 
 
446 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4760  microcin-processing peptidase 1  23.11 
 
 
460 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.447651  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1165  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.29 
 
 
444 aa  79  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.860051  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1164  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.62 
 
 
470 aa  78.6  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2115  peptidase PmbA  23.57 
 
 
447 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0947  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  19.96 
 
 
445 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.250758  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0631  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.1 
 
 
468 aa  77.8  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1014  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.79 
 
 
438 aa  77.4  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00863088  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002397  PmbA protein  23.2 
 
 
447 aa  77.4  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3343  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.25 
 
 
453 aa  77.4  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433792  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0753  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.24 
 
 
448 aa  77  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0158404 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0600  pmbA protein  23.24 
 
 
448 aa  77  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04103  predicted peptidase required for the maturation and secretion of the antibiotic peptide MccB17  21.88 
 
 
450 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04067  hypothetical protein  21.88 
 
 
450 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.853589  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1984  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.1 
 
 
457 aa  76.6  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.189239  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3759  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.12 
 
 
450 aa  76.6  0.0000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4805  peptidase PmbA  22.12 
 
 
446 aa  76.6  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4488  peptidase PmbA  22.12 
 
 
446 aa  76.6  0.0000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4849  peptidase PmbA  22.12 
 
 
446 aa  76.6  0.0000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5754  peptidase PmbA  22.12 
 
 
446 aa  76.6  0.0000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1145  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.09 
 
 
420 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1232  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.17 
 
 
433 aa  75.1  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1687  putative Zn-dependent protease, pmbA-like protein  23.59 
 
 
464 aa  75.1  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.85577 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3776  peptidase PmbA  21.88 
 
 
450 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1132  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.73 
 
 
441 aa  75.5  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0798905  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3631  microcin-processing peptidase 1  22.45 
 
 
447 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0492  peptidase PmbA  24.61 
 
 
447 aa  74.7  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.855998  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  20.63 
 
 
446 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000351423 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2639  microcin-processing peptidase 1  25.6 
 
 
473 aa  74.7  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.818625  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3455  microcin-processing peptidase 1  22.45 
 
 
447 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0495  microcin-processing peptidase 1  22.22 
 
 
447 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4384  peptidase PmbA  22.04 
 
 
446 aa  74.3  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4713  peptidase PmbA  21.65 
 
 
450 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0275  peptidase PmbA  21.79 
 
 
446 aa  74.3  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4551  pmbA protein  24.46 
 
 
453 aa  73.6  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0050  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.57 
 
 
420 aa  73.6  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03671  peptidase PmbA  22.56 
 
 
447 aa  72.8  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1852  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.51 
 
 
465 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.405759  decreased coverage  0.000697877 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2232  microcin-processing peptidase 1  22.2 
 
 
446 aa  72.8  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.352601  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0413  microcin-processing peptidase 1  19.25 
 
 
452 aa  72.4  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0570132  normal  0.116989 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0267  peptidase PmbA  22.59 
 
 
446 aa  72  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4078  pmba protein  21.38 
 
 
447 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0310  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.32 
 
 
446 aa  70.5  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0108287 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0533  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  21.77 
 
 
461 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0512  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  21.77 
 
 
461 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4708  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.4 
 
 
465 aa  70.5  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2148  microcin-processing peptidase 1  22.2 
 
 
446 aa  70.1  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.293206  normal  0.258287 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0781  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  21.18 
 
 
456 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212486  normal  0.0539475 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0482  PmbA protein  22.85 
 
 
453 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.325985 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0538  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.3 
 
 
447 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0044  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.89 
 
 
442 aa  69.3  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3805  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.3 
 
 
461 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1346  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.51 
 
 
465 aa  69.7  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200432  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0650  pmbA protein  26.1 
 
 
448 aa  69.7  0.0000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.501682  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0422  peptidase PmbA  21.5 
 
 
450 aa  69.3  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0490  peptidase PmbA  21.58 
 
 
446 aa  68.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0426  peptidase PmbA  21.58 
 
 
446 aa  68.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>