84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_01211 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_01211  RibD/RibG domain-containing protein  100 
 
 		 216 aa  433  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.889166  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0109  ribD/ribG-like  91.2 
 
 		 216 aa  377  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01221  RibD/RibG domain-containing protein  90.28 
 
 		 216 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01181  RibD/RibG domain-containing protein  70.7 
 
 		 220 aa  311  4.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2343  putative riboflavin-specific deaminase  33.18 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01771  RibD/RibG domain-containing protein  39.72 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.159904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1474  pyrimidine reductase  39.25 
 
 		 225 aa  152  4e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01211  RibD/RibG domain-containing protein  38.1 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.450714 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0348  putative riboflavin-specific deaminase  32.41 
 
 		 232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02071  RibD/RibG domain-containing protein  32.58 
 
 		 238 aa  126  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0544  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.74 
 
 		 230 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0561  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.84 
 
 		 230 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1576  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.97 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.210301 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0803  bifunctional deaminase-reductase-like  31.36 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.51 
 
 		 228 aa  92.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1186  putative riboflavin-specific deaminase  30.65 
 
 		 232 aa  71.2  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.107743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4689  bifunctional deaminase-reductase domain protein  23.5 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.192028  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0416  2, 5-diamino-6-hydroxy-4-(5-phosphoribosylamino)pyrimidine 1-reductase  26.67 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2812  2, 5-diamino-6-hydroxy-4-(5-phosphoribosylamino)pyrimidine 1-reductase  29.78 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.453884  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1874  riboflavin biosynthesis protein RibD  23.03 
 
 		 353 aa  58.2  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1352  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  24.89 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0644907 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1050  diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase / 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  25.11 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.411969  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1867  riboflavin biosynthesis protein RibD  23.26 
 
 		 353 aa  55.5  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1890  riboflavin biosynthesis protein RibD  23.91 
 
 		 366 aa  55.1  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.22105  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0659  bifunctional RNAse/5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  24.19 
 
 		 357 aa  54.3  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3078  2, 5-diamino-6-hydroxy-4-(5-phosphoribosylamino)pyrimidine 1-reductase  22.22 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.62381  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0593  bifunctional RNAse/5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  23.91 
 
 		 360 aa  53.9  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.075481  normal  0.240855 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4050  riboflavin biosynthesis protein RibD  26.04 
 
 		 384 aa  53.1  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0944  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase / diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase  23.63 
 
 		 366 aa  52.8  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0230  bifunctional RNAse/5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  23.37 
 
 		 360 aa  51.6  0.000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0251  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.16 
 
 		 255 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.04862  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0822  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase / diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase  25 
 
 		 344 aa  49.7  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000926899  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1674  deaminase-reductase domain-containing protein  24.61 
 
 		 288 aa  49.7  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1231  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  22.28 
 
 		 222 aa  49.7  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1325  bifunctional RNAse/5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  24.21 
 
 		 360 aa  49.3  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.264081  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0843  riboflavin biosynthesis protein RibD  22.73 
 
 		 363 aa  48.9  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0300  riboflavin biosynthesis protein RibD  22.65 
 
 		 383 aa  48.5  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.820157 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16841  putative diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase and 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  24.46 
 
 		 350 aa  48.9  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1122  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  23.2 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.858422 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13081  putative diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase and 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  24.72 
 
 		 365 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.397448 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1173  bifunctional deaminase-reductase-like protein  22.47 
 
 		 283 aa  48.1  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2239  riboflavin biosynthesis protein RibD  23.98 
 
 		 361 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.925938  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1542  dihydrofolate reductase region  27.52 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1688  riboflavin biosynthesis protein RibD  21.62 
 
 		 369 aa  47  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0831  diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase / 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  23.91 
 
 		 364 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3599  5-amino-6-(5- phosphoribosylamino)uracilreductase  22.53 
 
 		 319 aa  46.6  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00922872 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0937  2, 5-diamino-6-(5-phosphoribosylamino)pyrimidin-4(3H)-one reductase  25.14 
 
 		 225 aa  46.2  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0807982 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14870  pyrimidine reductase-like protein  23.5 
 
 		 263 aa  46.6  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2359  deaminase-reductase domain-containing protein  22.16 
 
 		 243 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0853596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5200  2,5-diamino-6-hydroxy-4-(5- phosphoribosylamino)pyrimidine 1-reductase  20.56 
 
 		 220 aa  46.2  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.63994  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3354  deaminase-reductase domain-containing protein  36.36 
 
 		 181 aa  45.4  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08530  diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase;5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  26.34 
 
 		 371 aa  45.4  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0385  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  22.91 
 
 		 217 aa  45.4  0.0007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.216591 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1313  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  24.04 
 
 		 231 aa  45.1  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3090  riboflavin biosynthesis protein RibD  18.78 
 
 		 370 aa  44.7  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.645676  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1187  riboflavin biosynthesis protein RibD  21.39 
 
 		 386 aa  44.3  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.379971  normal  0.943234 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0804  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  22.95 
 
 		 226 aa  44.3  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.301306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1596  riboflavin biosynthesis protein RibD  19.02 
 
 		 367 aa  44.3  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000393826  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1742  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  21.62 
 
 		 217 aa  44.3  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0665302 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0660  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  24.19 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00276533  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3555  riboflavin biosynthesis protein RibD  20.79 
 
 		 377 aa  45.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.49964  normal  0.644656 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0936  riboflavin biosynthesis protein RibD  20.32 
 
 		 371 aa  43.5  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0753  riboflavin biosynthesis protein RibD  17.47 
 
 		 366 aa  43.9  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.986595 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4752  hypothetical protein  21.66 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14641  putative diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase and 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  26.4 
 
 		 364 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.865552  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14501  putative diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase and 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  24.77 
 
 		 364 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1962  deaminase-reductase domain-containing protein  25.35 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2731  riboflavin biosynthesis protein RibD  24.58 
 
 		 401 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0020  riboflavin biosynthesis protein RibD  22.68 
 
 		 360 aa  43.5  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0543  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  22.07 
 
 		 220 aa  43.1  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0940433  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3461  riboflavin biosynthesis protein RibD  20.6 
 
 		 401 aa  42.7  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4321  bifunctional deaminase-reductase-like  22.97 
 
 		 172 aa  42.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11438  bifunctional riboflavin biosynthesis protein ribG: diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase + 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino) uracil reductase  23.65 
 
 		 339 aa  42.7  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00260487  normal  0.1412 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25 
 
 		 176 aa  42.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1274  diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase / 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  22.75 
 
 		 366 aa  42.7  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.308593  normal  0.319876 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1025  bifunctional diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase/5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  18.23 
 
 		 378 aa  42.4  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1072  bifunctional diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase/5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  19.67 
 
 		 369 aa  42.7  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.790808  hitchhiker  0.000447237 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1823  riboflavin biosynthesis protein RibD  22.35 
 
 		 347 aa  42.4  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.748712  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1858  riboflavin biosynthesis protein RibD  22.35 
 
 		 347 aa  42.4  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3024  riboflavin biosynthesis protein RibD  21.11 
 
 		 369 aa  42  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1328  riboflavin biosynthesis protein RibD  22.29 
 
 		 347 aa  42  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.03575  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3190  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase / diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase  23 
 
 		 366 aa  42  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.469708 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2578  2, 5-diamino-6-(5-phosphoribosylamino)pyrimidin-4(3H)-one reductase  18.38 
 
 		 230 aa  41.6  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0026  dihydrofolate reductase region  30.3 
 
 		 176 aa  41.6  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000208627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>