103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4036 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4036  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  279  7.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513536  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2296  hypothetical protein  72.54 
 
 
144 aa  206  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0939818  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4312  hypothetical protein  70.34 
 
 
145 aa  201  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2587  hypothetical protein  67.63 
 
 
143 aa  187  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46521  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3491  protein of unknown function DUF6 transmembrane  68.35 
 
 
143 aa  187  4e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3006  hypothetical protein  71.83 
 
 
143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0319253 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4041  hypothetical protein  71.83 
 
 
143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.579736 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4976  hypothetical protein  71.83 
 
 
143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.379016  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7598  hypothetical protein  60.43 
 
 
145 aa  169  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.182206 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1879  hypothetical protein  58.99 
 
 
142 aa  166  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.452757  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1410  integral membrane protein  58.99 
 
 
140 aa  165  2e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1304  hypothetical protein  57.55 
 
 
142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1266  hypothetical protein  57.55 
 
 
141 aa  162  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5645  hypothetical protein  55.71 
 
 
146 aa  155  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0436305 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3005  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.12 
 
 
145 aa  146  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0103  hypothetical protein  56.94 
 
 
144 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0476  hypothetical protein  56.83 
 
 
146 aa  141  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4058  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.47 
 
 
145 aa  141  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4563  hypothetical protein  53.96 
 
 
145 aa  136  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  58.04 
 
 
145 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.429085  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1565  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.74 
 
 
146 aa  135  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0762  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.45 
 
 
145 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.363429  normal  0.0593189 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4283  hypothetical protein  60.47 
 
 
145 aa  134  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0785264 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0839  hypothetical protein  51.45 
 
 
145 aa  133  9e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.168462  normal  0.579461 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0799  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.45 
 
 
145 aa  133  9e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0780249  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1234  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.27 
 
 
138 aa  130  6e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1399  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  51.82 
 
 
153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.126576  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2739  hypothetical protein  45.52 
 
 
138 aa  126  8.000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00174572  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6234  hypothetical protein  59.71 
 
 
142 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1757  hypothetical protein  61.11 
 
 
141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0344568  normal  0.0517722 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1494  hypothetical protein  45.52 
 
 
137 aa  124  5e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.140947  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.18 
 
 
138 aa  124  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0533623  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.25 
 
 
137 aa  120  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0513046  normal  0.349029 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2889  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.49 
 
 
137 aa  120  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.853447  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71880  hypothetical protein  59.71 
 
 
142 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0514  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.07 
 
 
144 aa  118  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000118881  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2870  hypothetical protein  41.18 
 
 
293 aa  114  6e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000020222  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4487  hypothetical protein  51.52 
 
 
145 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6961  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.75 
 
 
137 aa  106  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.915321  normal  0.0744442 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1213  hypothetical protein  44.78 
 
 
142 aa  104  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00065013  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3118  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.03 
 
 
142 aa  104  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0186  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.57 
 
 
287 aa  101  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405902  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6733  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.31 
 
 
137 aa  100  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.613409 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.65 
 
 
137 aa  100  9e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1078  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.17 
 
 
137 aa  99.8  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1170  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.41 
 
 
141 aa  98.2  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1628  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.42 
 
 
143 aa  97.8  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000213352  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0403  hypothetical protein  41.43 
 
 
142 aa  93.6  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0531  EamA family protein  40.71 
 
 
142 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0404  EamA family protein  40.71 
 
 
142 aa  92.8  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0395  DMT family permease  40.71 
 
 
142 aa  92.8  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0391  DMT family permease  40.71 
 
 
142 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0416  eama family protein  40.71 
 
 
142 aa  92.8  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0532  transporter, EamA family  40.71 
 
 
142 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0462  transporter, EamA family  40.71 
 
 
142 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0396  hypothetical protein  40 
 
 
142 aa  92.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0481  transporter, EamA family  40.71 
 
 
142 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4842  transporter, EamA family  40.71 
 
 
142 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1192  hypothetical protein  40.15 
 
 
139 aa  87.4  7e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1124  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.54 
 
 
142 aa  84.3  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00709741  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1101  integral membrane protein  41.04 
 
 
142 aa  83.6  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000297409  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3577  hypothetical protein  41.04 
 
 
142 aa  83.6  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.019406  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1154  hypothetical protein  40.3 
 
 
142 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.104519  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40 
 
 
142 aa  79.3  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0568  hypothetical protein  31.75 
 
 
147 aa  73.6  0.0000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.134019  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.58 
 
 
160 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  29.85 
 
 
300 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1831  hypothetical protein  38.16 
 
 
356 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0404  hypothetical protein  38.16 
 
 
327 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.92172  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0899  hypothetical protein  29.79 
 
 
125 aa  47.4  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2134  hypothetical protein  38.16 
 
 
354 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0818  hypothetical protein  38.16 
 
 
354 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  29.85 
 
 
289 aa  47  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  29.85 
 
 
300 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1474  hypothetical protein  38.16 
 
 
277 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0501  hypothetical protein  38.16 
 
 
277 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.777031  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0183  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.43 
 
 
298 aa  47  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  38.71 
 
 
310 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  29.1 
 
 
300 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3366  hypothetical protein  34.15 
 
 
278 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  29.1 
 
 
302 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  40.35 
 
 
306 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2290  hypothetical protein  34.18 
 
 
275 aa  43.9  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.825928 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1359  hypothetical protein  26.72 
 
 
159 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00345  permease  30.3 
 
 
304 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.65 
 
 
284 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.797294  normal  0.0204425 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4978  hypothetical protein  22.88 
 
 
305 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0286  hypothetical protein  32.89 
 
 
293 aa  42  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2117  hypothetical protein  41.38 
 
 
292 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107207  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3975  hypothetical protein  23.73 
 
 
312 aa  42.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  30.08 
 
 
303 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1323  hypothetical protein  26.43 
 
 
291 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000201955  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.07 
 
 
309 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  36.07 
 
 
345 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  26.95 
 
 
311 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0384  hypothetical protein  29.81 
 
 
302 aa  40.4  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.128804  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00423  predicted permease, DMT superfamily protein  33.33 
 
 
294 aa  40.8  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  28.36 
 
 
302 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  28.36 
 
 
302 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>