More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3374 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3374  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 414 aa  833    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.105417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4310  LacI family transcription regulator  46.24 
 
 		 369 aa  323  4e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4311  LacI family transcription regulator  45.92 
 
 		 370 aa  315  7e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3203  LacI family transcription regulator  44.07 
 
 		 375 aa  295  1e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0127391  normal  0.898845 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4277  LacI family transcription regulator  34.19 
 
 		 343 aa  197  3e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4284  LacI family transcription regulator  37.22 
 
 		 351 aa  196  7e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0520  LacI family transcription regulator  34.96 
 
 		 357 aa  170  4e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3108  transcriptional regulators-like protein  34.99 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0737433 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1384  LacI family transcription regulator  30.38 
 
 		 367 aa  155  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.934353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0521  LacI family transcription regulator  33.61 
 
 		 364 aa  150  4e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1990  LacI family transcription regulator  29.77 
 
 		 341 aa  140  4.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0741894 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4267  LacI family transcription regulator  29.28 
 
 		 330 aa  134  3.9999999999999996e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4343  LacI family transcription regulator  28.45 
 
 		 346 aa  119  9e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.905515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1018  LacI family transcription regulator  27.53 
 
 		 365 aa  119  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1357  LacI family transcription regulator  28.93 
 
 		 357 aa  114  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4286  LacI family transcription regulator  28.02 
 
 		 347 aa  87.8  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2594  transcriptional regulator, LacI family  29.9 
 
 		 339 aa  75.9  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4539  transcriptional regulator, LacI family  32.32 
 
 		 350 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5117  transcriptional regulator, LacI family  28.77 
 
 		 320 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.603639  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1537  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.64 
 
 		 343 aa  62.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  30.96 
 
 		 353 aa  61.6  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0371  transcriptional regulator, LacI family  26.83 
 
 		 339 aa  60.8  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.802173 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2559  alanine racemase  25.96 
 
 		 358 aa  60.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  30.05 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01740  transcriptional regulator  28.7 
 
 		 355 aa  59.7  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.42091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0417  LacI family transcription regulator  26.55 
 
 		 354 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0870  LacI family transcription regulator  27.71 
 
 		 328 aa  59.3  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  23.58 
 
 		 338 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5761  transcriptional regulator, LacI family  31.06 
 
 		 363 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.230872  normal  0.079116 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8123  transcriptional regulator, LacI family  45.33 
 
 		 358 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0592322  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4797  LacI family transcription regulator  27.75 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.184791  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.78 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0627  transcriptional regulator, LacI family  27.86 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.958953 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3611  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.33 
 
 		 345 aa  57.8  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4733  transcriptional regulator, LacI family  30.35 
 
 		 341 aa  57.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.396374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0385  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.48 
 
 		 354 aa  57  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0495  transcriptional regulator, LacI family  26.46 
 
 		 335 aa  57  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.448967  normal  0.778992 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1067  transcriptional regulator, LacI family  52.73 
 
 		 349 aa  57  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0326258  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3227  LacI family transcription regulator  28.79 
 
 		 362 aa  57  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0927  LacI family transcription regulator  28.72 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0647  transcriptional regulator, LacI family  46.38 
 
 		 357 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2715  LacI family transcription regulator  28.5 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.246761  hitchhiker  0.00173955 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0909  LacI family transcription regulator  42.67 
 
 		 338 aa  56.2  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0778  LacI family transcription regulator  29.41 
 
 		 349 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  hitchhiker  0.00400248 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0752  LacI family transcription regulator  46.67 
 
 		 331 aa  55.1  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.477484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2083  LacI family transcription regulator  30.65 
 
 		 339 aa  55.5  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2515  transcriptional regulator, LacI family  35.96 
 
 		 357 aa  55.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185479  hitchhiker  0.0043298 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4680  LacI family transcription regulator  28.31 
 
 		 336 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0406203  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0131  transcriptional regulator, LacI family  30.54 
 
 		 343 aa  55.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6174  transcriptional regulator, LacI-family  38.32 
 
 		 349 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1374  transcriptional regulator, LacI family  26.6 
 
 		 357 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.748872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0989  transcriptional regulator, LacI family  35.51 
 
 		 342 aa  54.7  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0870  alanine racemase  31.13 
 
 		 351 aa  54.7  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0351  transcriptional regulator, LacI family  41.56 
 
 		 367 aa  54.7  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4844  transcriptional regulator, LacI family  22.19 
 
 		 344 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0280353  hitchhiker  0.000467686 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03674  transcriptional regulator LacI family  27.49 
 
 		 342 aa  54.3  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0352  transcriptional regulator, LacI family  28.28 
 
 		 347 aa  54.3  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00162695  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  28.14 
 
 		 339 aa  53.9  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00229  putative GalR repressor of contiguous operon, likely to bind a galactoside  43.33 
 
 		 351 aa  53.5  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2170  LacI family transcription regulator  27.59 
 
 		 366 aa  53.9  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.626121  normal  0.28501 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1755  LacI family transcription regulator  35 
 
 		 360 aa  53.5  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.998653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1870  LacI family transcription regulator  42.03 
 
 		 342 aa  53.5  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075643 
 
 
-
 
NC_004310  BR2049  LacI family transcription regulator  28.28 
 
 		 352 aa  53.5  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.586342  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3304  LacI family transcription regulator  28.71 
 
 		 335 aa  53.5  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  24.14 
 
 		 333 aa  53.1  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2535  regulatory protein, LacI  28.37 
 
 		 328 aa  53.1  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.228599  normal  0.605091 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.14 
 
 		 333 aa  53.1  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3970  LacI family transcription regulator  26.3 
 
 		 348 aa  53.1  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2947  regulatory protein LacI  33.33 
 
 		 359 aa  53.1  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407921  normal  0.301474 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7655  LacI family transcription regulator  27.07 
 
 		 332 aa  53.1  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.254104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06900  transcriptional regulator, LacI family  27.65 
 
 		 339 aa  53.1  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0974  putative sugar-binding protein  48.98 
 
 		 340 aa  53.1  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2798  LacI family transcription regulator  50.85 
 
 		 346 aa  53.1  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614982 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2503  transcriptional regulator, LacI family  39.81 
 
 		 337 aa  53.1  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4333  transcriptional regulator, LacI family  25.51 
 
 		 340 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1554  LacI family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 344 aa  52.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1438  transcriptional regulator, LacI family  40.35 
 
 		 337 aa  52.4  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2892  transcriptional regulator, LacI family  28.57 
 
 		 340 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.207309  normal  0.956989 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1333  transcriptional regulator, LacI family  27.55 
 
 		 347 aa  52.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00834702  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0047  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.14 
 
 		 356 aa  52.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.108972 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3568  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.71 
 
 		 339 aa  52.8  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0325  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.85 
 
 		 335 aa  52.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  26.78 
 
 		 338 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3659  transcriptional regulator, LacI family  36.11 
 
 		 343 aa  52.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02412  transcriptional regulator  45.07 
 
 		 343 aa  52.8  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3720  transcriptional regulator, LacI family  31.55 
 
 		 335 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2244  LacI family transcription regulator  50 
 
 		 351 aa  51.6  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3394  transcriptional regulator  27.98 
 
 		 361 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330741 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2290  transcriptional regulator, LacI family  34.02 
 
 		 344 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.950174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1772  transcriptional regulator, LacI family protein  48.98 
 
 		 345 aa  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.297999  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0229  LacI family transcription regulator  45.16 
 
 		 358 aa  52.4  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.720422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16200  transcriptional regulator, LacI family  24.75 
 
 		 336 aa  52.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00346268  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3918  LacI family transcription regulator  29.48 
 
 		 341 aa  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4438  transcriptional regulator, LacI family  34.65 
 
 		 342 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3513  LacI family transcription regulator  44.64 
 
 		 338 aa  52  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.98216  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3460  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.43 
 
 		 344 aa  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.105579  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2376  transcriptional regulator, LacI family  29.86 
 
 		 352 aa  52  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2002  transcriptional regulator, LacI family  50 
 
 		 348 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000460258 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2461  LacI family transcription regulator  50 
 
 		 351 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0661891  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2356  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  50 
 
 		 348 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>