More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1709 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1709  signal recognition particle-docking protein FtsY  100 
 
 		 319 aa  640    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148725 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2659  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.76 
 
 		 389 aa  272  7e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319125  hitchhiker  0.000261917 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4065  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.74 
 
 		 452 aa  267  2e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2372  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.85 
 
 		 320 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.62 
 
 		 453 aa  265  5.999999999999999e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3877  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.86 
 
 		 432 aa  264  1e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0093  cell division protein FtsY  45.22 
 
 		 471 aa  263  2e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0099  cell division protein FtsY  45.08 
 
 		 495 aa  263  3e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.86 
 
 		 405 aa  263  4e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5161  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.84 
 
 		 510 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1934  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  44.59 
 
 		 362 aa  262  4.999999999999999e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.249425  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5111  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.67 
 
 		 494 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4751  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  45.54 
 
 		 505 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.974367  normal  0.0527316 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0427  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.68 
 
 		 513 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4984  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.52 
 
 		 497 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1555  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.03 
 
 		 295 aa  259  3e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0354  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.67 
 
 		 514 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2460  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.27 
 
 		 326 aa  259  4e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2989  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.6 
 
 		 501 aa  258  7e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2724  hypothetical protein  45.43 
 
 		 355 aa  258  9e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0151  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.96 
 
 		 317 aa  257  1e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1714  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.91 
 
 		 304 aa  258  1e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0632932  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03537  signal recognition particle GTPase  42.81 
 
 		 541 aa  257  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2597  hypothetical protein  45.43 
 
 		 355 aa  257  2e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3840  cell division protein FtsY  45.54 
 
 		 491 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3763  cell division protein FtsY  45.54 
 
 		 491 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3773  cell division protein FtsY  45.54 
 
 		 491 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3883  cell division protein FtsY  45.54 
 
 		 491 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.629527  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0133  cytochrome oxidase assembly family protein/cell division protein FtsY  45.4 
 
 		 671 aa  256  3e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.167728  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3946  cell division protein FtsY  45.08 
 
 		 497 aa  256  3e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3747  cell division protein FtsY  45.08 
 
 		 512 aa  256  3e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03313  fused Signal Recognition Particle (SRP) receptor: membrane binding protein/conserved protein  45.08 
 
 		 498 aa  256  4e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0252  cell division protein FtsY  45.22 
 
 		 498 aa  256  4e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3663  cell division protein FtsY  45.22 
 
 		 498 aa  256  4e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03266  hypothetical protein  45.08 
 
 		 498 aa  256  4e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0251  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.08 
 
 		 497 aa  256  5e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3868  cell division protein FtsY  45.54 
 
 		 511 aa  256  5e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.046763  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4784  cell division protein FtsY  45.22 
 
 		 498 aa  256  5e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0221  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.86 
 
 		 535 aa  255  8e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359451  normal  0.0478806 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3942  cell division protein FtsY  45.22 
 
 		 491 aa  255  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.643003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3606  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.44 
 
 		 561 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0577  cell division protein  45.86 
 
 		 553 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3410  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.79 
 
 		 473 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.457129 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0239  cell division protein FtsY  45.86 
 
 		 541 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0752366  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3979  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.86 
 
 		 523 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3858  cell division protein FtsY  45.08 
 
 		 497 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3505  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.54 
 
 		 487 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000471575  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3944  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.51 
 
 		 485 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000907128  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4411  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.69 
 
 		 437 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3090  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.23 
 
 		 320 aa  252  6e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.417307  normal  0.0202062 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0289  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.22 
 
 		 482 aa  252  7e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000644129  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3223  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.71 
 
 		 483 aa  252  7e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000124674 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0382  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.79 
 
 		 304 aa  252  7e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0029967  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3468  cell division protein FtsY  44.13 
 
 		 563 aa  251  1e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00185267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4175  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.47 
 
 		 475 aa  250  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0143973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48100  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.94 
 
 		 451 aa  250  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0287334  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1132  cell division protein FtsY  43.49 
 
 		 350 aa  250  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3980  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.13 
 
 		 643 aa  250  3e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176908  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0334  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.81 
 
 		 382 aa  249  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1184  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.03 
 
 		 312 aa  249  3e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000333894  normal  0.0338709 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3336  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.49 
 
 		 320 aa  249  3e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2374  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.73 
 
 		 387 aa  249  3e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000224512  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5337  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.84 
 
 		 515 aa  249  5e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4295  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.95 
 
 		 540 aa  249  5e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00341336  normal  0.0288649 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.52 
 
 		 373 aa  249  5e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0275  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.85 
 
 		 587 aa  249  5e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.125713  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0171  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.95 
 
 		 621 aa  249  5e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116132  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00280  signal recognition particle GTPase  45.37 
 
 		 408 aa  249  5e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4164  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.95 
 
 		 611 aa  249  6e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00648424  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4094  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.95 
 
 		 615 aa  249  6e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000394743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3972  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.22 
 
 		 562 aa  248  7e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00124798  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0157  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.72 
 
 		 481 aa  248  9e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2753  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.3 
 
 		 316 aa  248  9e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2373  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.3 
 
 		 343 aa  248  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.119612  hitchhiker  0.000783963 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0201  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.95 
 
 		 491 aa  248  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00197589  decreased coverage  0.000000348094 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2988  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.65 
 
 		 329 aa  248  1e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.289168  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0219  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.59 
 
 		 540 aa  247  2e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3496  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.85 
 
 		 342 aa  247  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000989715  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4586  cell division protein FtsY  44.9 
 
 		 510 aa  246  3e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1096  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.54 
 
 		 340 aa  246  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0138862  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3847  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.63 
 
 		 584 aa  246  4e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00993758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0375  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.9 
 
 		 315 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.854188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3597  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.99 
 
 		 375 aa  244  9e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549182  normal  0.0916898 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5338  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.37 
 
 		 466 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.870799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0413  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.32 
 
 		 529 aa  244  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.571496  normal  0.495384 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0468  signal recognition particle receptor FtsY  46.03 
 
 		 447 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1001  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.45 
 
 		 397 aa  244  9.999999999999999e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000041577  hitchhiker  0.00000536863 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0414  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.86 
 
 		 447 aa  244  9.999999999999999e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2903  cell division protein FtsY  44.73 
 
 		 410 aa  244  9.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.297557  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.81 
 
 		 528 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.352146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2845  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.69 
 
 		 493 aa  243  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.634202 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0651  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.46 
 
 		 320 aa  243  3e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4069  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.49 
 
 		 533 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.605645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04900  signal recognition particle receptor FtsY  45.71 
 
 		 451 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.653255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0170  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.44 
 
 		 347 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.200798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1176  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.59 
 
 		 351 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.216853  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4980  signal recognition particle-docking protein FtsY  43 
 
 		 317 aa  243  3.9999999999999997e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0207  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.35 
 
 		 315 aa  242  5e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368358  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0517  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.72 
 
 		 315 aa  242  6e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2723  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.32 
 
 		 488 aa  242  7e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>