86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3239 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3239  glutaredoxin  100 
 
 
87 aa  181  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0851867  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4052  glutaredoxin  71.95 
 
 
88 aa  136  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2449  hypothetical protein  59.21 
 
 
79 aa  100  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2075  glutaredoxin  59.21 
 
 
79 aa  100  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2583  glutaredoxin  50 
 
 
84 aa  86.3  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12420  glutaredoxin-like protein  36.51 
 
 
82 aa  53.1  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2340  glutaredoxin  35.53 
 
 
78 aa  51.2  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340679  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  42.37 
 
 
81 aa  50.8  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0034  glutaredoxin-like protein, YruB-family  32.39 
 
 
81 aa  50.8  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  37.31 
 
 
92 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2334  YruB family glutaredoxin-like protein  40.32 
 
 
194 aa  48.9  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573032  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0332  glutaredoxin  40.68 
 
 
86 aa  48.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877113  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0505  glutaredoxin-like protein, YruB-family  32.93 
 
 
175 aa  48.5  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1344  YruB family glutaredoxin-like protein  32.81 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458905  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1323  YruB family glutaredoxin-like protein  32.81 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0672581  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2812  glutaredoxin family protein  34.07 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0889237  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0179  glutaredoxin  32.91 
 
 
86 aa  47  0.00008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0552  YruB family glutaredoxin-like protein  34.92 
 
 
80 aa  47  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0640  putative glutaredoxin  37.7 
 
 
75 aa  47  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189959  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1460  glutaredoxin  34.62 
 
 
88 aa  47  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  37.5 
 
 
88 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3284  glutaredoxin  38.57 
 
 
88 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1427  YruB family glutaredoxin-like protein  38.1 
 
 
80 aa  46.2  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00494984  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  45.83 
 
 
86 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  35.38 
 
 
80 aa  45.8  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  38.46 
 
 
88 aa  45.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  34.92 
 
 
76 aa  44.7  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1085  transcriptional regulator Spx  42.86 
 
 
131 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1347  transcriptional regulator Spx  42.86 
 
 
131 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0109883  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1109  transcriptional regulator Spx  42.86 
 
 
131 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1091  transcriptional regulator Spx  42.86 
 
 
131 aa  43.9  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1242  transcriptional regulator Spx  42.86 
 
 
131 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4100  transcriptional regulator Spx  42.86 
 
 
131 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1270  transcriptional regulator Spx  42.86 
 
 
131 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1200  transcriptional regulator Spx  42.86 
 
 
131 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104222  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0904  transcriptional regulator Spx  42.86 
 
 
131 aa  43.9  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.873656  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  34.57 
 
 
384 aa  43.9  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1309  transcriptional regulator Spx  42.86 
 
 
131 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516979  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  36.92 
 
 
82 aa  43.5  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1777  YruB family glutaredoxin-like protein  31.75 
 
 
80 aa  43.5  0.0009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110535  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0536  glutaredoxin 3  39.06 
 
 
87 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4179  putative glutaredoxin 3  39.06 
 
 
87 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3507  glutaredoxin-3  41.18 
 
 
85 aa  42.7  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.838286 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1038  glutaredoxin-like protein  32.35 
 
 
83 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0808  glutaredoxin 3  32.91 
 
 
87 aa  43.5  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  31.75 
 
 
80 aa  43.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  34.92 
 
 
80 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4375  glutaredoxin-like protein NrdH  31.94 
 
 
73 aa  42  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1618  transcriptional regulator Spx  42.86 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2903  glutaredoxin GrxC  41.27 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.844851  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0521  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  31.94 
 
 
73 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.317341  normal  0.144081 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0252  glutaredoxin GrxC  38.81 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1737  glutaredoxin GrxC  33.72 
 
 
87 aa  42.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0513723  normal  0.163963 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1555  glutaredoxin  33.72 
 
 
87 aa  42.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000316577  normal  0.150299 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1097  transcriptional regulator Spx  40.48 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0763  transcriptional regulator Spx  42.86 
 
 
132 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3721  glutaredoxin-like protein NrdH  29.33 
 
 
78 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75993  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1119  glutaredoxin-like protein NrdH  25 
 
 
78 aa  41.2  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.556674  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4923  glutaredoxin-like protein NrdH  28.21 
 
 
80 aa  41.2  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1065  glutaredoxin-related protein NrdH  25 
 
 
78 aa  41.2  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0223724  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2064  glutaredoxin  31.82 
 
 
78 aa  41.6  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3540  glutaredoxin-related protein NrdH  25 
 
 
78 aa  41.2  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00255736  hitchhiker  0.0090017 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2230  glutaredoxin  43.59 
 
 
87 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.381794  normal  0.448349 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0213  glutaredoxin  37.5 
 
 
118 aa  40.8  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.989623  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  34.38 
 
 
116 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0865  glutaredoxin  21.82 
 
 
81 aa  40.8  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.765785  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1876  glutaredoxin 3  36.51 
 
 
88 aa  40.8  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0230  glutaredoxin 3  38.81 
 
 
85 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.53184  hitchhiker  0.00238728 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0556  glutaredoxin  47.83 
 
 
77 aa  40.8  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0146434  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0211  glutaredoxin 3  38.81 
 
 
85 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.154177 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1807  glutaredoxin 3  36.51 
 
 
88 aa  40.8  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.433283  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1155  glutaredoxin family protein  30.77 
 
 
123 aa  40.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.698901  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  40 
 
 
85 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  40 
 
 
85 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  36.51 
 
 
81 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0253  glutaredoxin-like protein  37.5 
 
 
76 aa  40.4  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1063  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  27.78 
 
 
72 aa  40.4  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000290515  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0113  glutaredoxin  30.51 
 
 
87 aa  40.4  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4139  glutaredoxin 3  34.92 
 
 
82 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0702  transcriptional regulator Spx  42.86 
 
 
132 aa  40.4  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0071  glutaredoxin 3  34.92 
 
 
82 aa  40.4  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0077  glutaredoxin 3  34.92 
 
 
82 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  40 
 
 
85 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3153  glutaredoxin-like protein  32.39 
 
 
84 aa  40.4  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00125974  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5740  glutaredoxin  38.46 
 
 
81 aa  40  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574566  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0306  glutaredoxin GrxC  37.31 
 
 
85 aa  40  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>