85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_36787 on replicon NC_009375
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009375  OSTLU_36787  predicted protein  100 
 
 		 477 aa  978    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00684152  hitchhiker  0.00249943 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41733  predicted protein  100 
 
 		 477 aa  978    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908244  normal  0.188048 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30886  predicted protein  48.5 
 
 		 506 aa  424  1e-117  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.25268 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0767  deoxyribodipyrimidine photolyase  45.25 
 
 		 451 aa  373  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.268516 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1961  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  44.71 
 
 		 468 aa  363  5.0000000000000005e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.351083  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0527  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  42.55 
 
 		 462 aa  360  3e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0876  DNA photolyase, class 2  44.59 
 
 		 459 aa  360  3e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0522  DNA photolyase, class 2  43.23 
 
 		 495 aa  355  6.999999999999999e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.372488 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1321  deoxyribodipyrimidine photolyase  45.6 
 
 		 469 aa  355  1e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.533615  normal  0.0703748 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2829  deoxyribodipyrimidine photolyase, putative  45.6 
 
 		 461 aa  354  2e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.242896  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2012  deoxyribodipyrimidine photolyase  45.52 
 
 		 450 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_51952  class II CPD photolyase  41.9 
 
 		 511 aa  336  7e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0179  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  43.79 
 
 		 487 aa  330  3e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1775  deoxyribodipyrimidine photolyase  42.92 
 
 		 447 aa  329  8e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00154316  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0415  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  42.38 
 
 		 452 aa  311  2e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2693  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.74 
 
 		 449 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2851  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  40.22 
 
 		 473 aa  294  3e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1936  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  41.31 
 
 		 494 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04990  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.17 
 
 		 466 aa  276  4e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4497  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  36.12 
 
 		 446 aa  269  1e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.112755  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0725  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.4 
 
 		 455 aa  268  2e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3500  DNA photolyase FAD-binding protein  35.71 
 
 		 453 aa  263  4e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3129  DNA photolyase, FAD-binding  39.15 
 
 		 468 aa  254  2.0000000000000002e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3221  deoxyribodipyrimidine photolyase  36.16 
 
 		 448 aa  246  6e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.147791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2139  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.53 
 
 		 456 aa  241  2e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0663  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  36.3 
 
 		 464 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3762  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.41 
 
 		 462 aa  225  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12101  normal  0.44256 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6363  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.39 
 
 		 465 aa  218  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111638 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0155  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.91 
 
 		 476 aa  218  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2716  deoxyribodipyrimidine photolyase  33.68 
 
 		 490 aa  213  9e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_45715  predicted protein  33.98 
 
 		 467 aa  208  1e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.380145  normal  0.059566 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2531  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.43 
 
 		 467 aa  208  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.695435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2754  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.19 
 
 		 467 aa  208  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.853539 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2459  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.76 
 
 		 467 aa  205  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1430  DNA photolyase FAD-binding protein  30.32 
 
 		 493 aa  194  3e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3226  DNA photolyase FAD-binding  33.83 
 
 		 486 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575372  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3125  DNA photolyase FAD-binding  33.62 
 
 		 486 aa  179  8e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.848481  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3007  DNA photolyase FAD-binding  32.84 
 
 		 493 aa  170  5e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.742505 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4973  DNA photolyase FAD-binding protein  31.85 
 
 		 496 aa  164  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3028  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  31.18 
 
 		 490 aa  161  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  26.28 
 
 		 843 aa  143  8e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1562  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.84 
 
 		 471 aa  70.5  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.51951  normal  0.490223 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3098  deoxyribodipyrimidine photolyase  28.57 
 
 		 487 aa  67.4  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.383524  normal  0.0341678 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1394  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.84 
 
 		 483 aa  67.4  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49165  predicted protein  30.52 
 
 		 495 aa  63.2  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.69324  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4932  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  26.9 
 
 		 481 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4411  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.85 
 
 		 487 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00088119  normal  0.0752784 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0377  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.52 
 
 		 486 aa  57.8  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2364  deoxyribodipyrimidine photolyase  26.89 
 
 		 487 aa  57.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3356  deoxyribodipyrimidine photolyase  28.79 
 
 		 483 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.617341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1441  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  24.05 
 
 		 474 aa  55.8  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.511514  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4676  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.59 
 
 		 500 aa  55.1  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.499221 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3589  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.06 
 
 		 483 aa  55.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02016  DNA photolyase  24.14 
 
 		 474 aa  54.7  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0782959  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00387  DNA photolyase (Eurofung)  23.95 
 
 		 567 aa  54.3  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.892479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5899  deoxyribodipyrimidine photolyase  32.39 
 
 		 519 aa  54.3  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0769953  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2178  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.39 
 
 		 519 aa  54.3  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.240707  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2903  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  24.16 
 
 		 478 aa  52  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.599485  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1604  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.12 
 
 		 486 aa  51.6  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2256  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  33.54 
 
 		 479 aa  51.2  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.786952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0870  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.8 
 
 		 479 aa  50.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.040956 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1989  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  24.73 
 
 		 468 aa  50.1  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.382914  normal  0.885594 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10630  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  27.67 
 
 		 450 aa  48.5  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0877345 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0820  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24 
 
 		 469 aa  47.8  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.627339 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2919  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.43 
 
 		 478 aa  47  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.219923 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05122  deoxyribodipyrimidine photolyase  23.82 
 
 		 471 aa  47  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1262  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.8 
 
 		 463 aa  47  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.103305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0998  deoxyribodipyrimidine photolyase  32.9 
 
 		 457 aa  46.6  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.50142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2196  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.82 
 
 		 519 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2217  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.76 
 
 		 525 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.511177  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04795  photolyase  25.26 
 
 		 472 aa  46.6  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.722935  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1759  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  30.97 
 
 		 454 aa  45.8  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0257219  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2777  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  21.24 
 
 		 469 aa  45.8  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1215  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.48 
 
 		 477 aa  45.8  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.300983  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0513  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.85 
 
 		 475 aa  45.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237418 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0814  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  22.57 
 
 		 490 aa  45.1  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1444  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.87 
 
 		 483 aa  44.3  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.750444 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001252  deoxyribodipyrimidine photolyase  22.67 
 
 		 471 aa  43.9  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.553687  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0266  hypothetical protein  27.12 
 
 		 471 aa  43.9  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3446  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.74 
 
 		 491 aa  43.5  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.998107  normal  0.118354 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2318  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.64 
 
 		 476 aa  43.9  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1268a  deoxyribodipyrimidine photolyase  22.16 
 
 		 452 aa  43.9  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.432586  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2235  cryptochrome, DASH family  27.74 
 
 		 483 aa  43.5  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.14399  normal  0.570848 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0271  hypothetical protein  27.07 
 
 		 471 aa  43.5  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5488  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  31.22 
 
 		 518 aa  43.5  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>