More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_34264 on replicon NC_009357
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009357  OSTLU_34264  predicted protein  100 
 
 
597 aa  1219    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159227  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_2182  predicted protein  41.71 
 
 
360 aa  277  4e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01210  conserved hypothetical protein  44.62 
 
 
669 aa  256  6e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01215  Myosin-related protein homolog MlpA Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVC7]  33.03 
 
 
544 aa  224  4e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00107626  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42327  predicted protein  41.4 
 
 
443 aa  208  3e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.812568  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28889  predicted protein  36.67 
 
 
521 aa  207  4e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.691875  normal  0.346364 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30716  nuclear/nucleolar GTP-binding protein 2  31.18 
 
 
534 aa  190  7e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0409155  normal  0.593065 
 
 
-
 
NC_006686  CND05640  conserved hypothetical protein  34 
 
 
717 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01666  nucleolar GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08930)  33.33 
 
 
560 aa  168  2.9999999999999998e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25133  predicted protein  30.13 
 
 
562 aa  162  1e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03480  GTP-binding protein, putative  29.68 
 
 
642 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.866446  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2161  GTP-binding protein, HSR1-related  32.64 
 
 
268 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_2179  predicted protein  30.28 
 
 
378 aa  134  6e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.805213  decreased coverage  0.000732595 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77411  predicted protein  29.54 
 
 
653 aa  129  1.0000000000000001e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1194  GTP-binding protein HSR1-related  32.07 
 
 
379 aa  124  4e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0021  GTP-binding protein, HSR1-related  31.9 
 
 
261 aa  123  9e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02263  ribosome biogenesis GTPase Lsg1, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06510)  27.7 
 
 
650 aa  119  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.722478  normal  0.600285 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0017  GTP-binding protein HSR1-related  31.32 
 
 
259 aa  117  6.9999999999999995e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.437741 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1049  small GTP-binding protein  30.11 
 
 
256 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0648076 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0579  GTP-binding protein HSR1-related  27.62 
 
 
388 aa  114  7.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.133242 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0259  GTP-binding protein YlqF  28.16 
 
 
384 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1339  GTP-binding protein HSR1-related  27.62 
 
 
374 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0824  GTP-binding protein, HSR1-related  29.48 
 
 
261 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0645  GTP-binding protein HSR1-related  27.71 
 
 
374 aa  106  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.112449  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2401  GTP-binding protein HSR1-related  29.79 
 
 
292 aa  99  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00457359  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1931  GTP-binding protein YlqF  31.76 
 
 
265 aa  98.6  3e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1645  GTP-binding protein HSR1-related protein  29.21 
 
 
267 aa  95.1  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0965414  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1409  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  32.27 
 
 
271 aa  94.7  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.421311  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2508  ribosomal biogenesis GTPase  30.5 
 
 
312 aa  94.7  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2638  ribosomal biogenesis GTPase  30.14 
 
 
312 aa  94.4  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00454653  normal  0.052608 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07360  GTP-binding protein HSR1-related  25.7 
 
 
282 aa  94.4  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000017476  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1054  ribosomal biogenesis GTPase  29.76 
 
 
315 aa  94  7e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2029  ribosomal biogenesis GTPase  28.83 
 
 
312 aa  93.6  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.831437  normal  0.492608 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0158  GTP-binding protein HSR1-related  27.49 
 
 
262 aa  91.7  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.844156  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0160  GTP-binding protein, HSR1-related  27.49 
 
 
262 aa  91.7  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.210718  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0059  GTP-binding protein HSR1-related  32.96 
 
 
260 aa  90.9  6e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.800533  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1490  GTP-binding protein  26.64 
 
 
278 aa  90.1  9e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000659617  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0811  ribosomal biogenesis GTPase  27.82 
 
 
287 aa  90.1  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00749287  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1204  GTP-binding  27.66 
 
 
305 aa  89.7  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185511  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06087  ribosomal biogenesis GTPase  26.99 
 
 
314 aa  89  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1993  ribosomal biogenesis GTPase  29.12 
 
 
314 aa  89  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0543739  normal  0.136959 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0827  GTP-binding protein HSR1-related  28.68 
 
 
266 aa  87.8  5e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01470  GTP-binding protein, putative  31.32 
 
 
743 aa  87.4  6e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0973  GTP-binding protein YlqF  29.01 
 
 
270 aa  87.4  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000216329  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3753  GTP1/OBG protein  29.96 
 
 
276 aa  87  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336118  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0663  ribosomal biogenesis GTPase  25.75 
 
 
279 aa  87  9e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.5554  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1589  ribosomal biogenesis GTPase  27.76 
 
 
313 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1095  ribosomal biogenesis GTPase  27.21 
 
 
283 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00065113  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19438  predicted protein  25.28 
 
 
529 aa  85.9  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0420618  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2395  ribosomal biogenesis GTPase  29.41 
 
 
313 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.806942 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1703  ribosomal biogenesis GTPase  27.27 
 
 
310 aa  85.1  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.237834  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1293  GTP-binding protein HSR1-related  26.98 
 
 
280 aa  85.1  0.000000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000027879  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2186  ribosomal biogenesis GTPase  29.07 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2263  ribosomal biogenesis GTPase  29.07 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0705  GTP-binding protein HSR1-related protein  28.57 
 
 
298 aa  84  0.000000000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3579  ribosomal biogenesis GTPase  26.62 
 
 
296 aa  84  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000271121  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0669  ribosomal biogenesis GTPase  27.27 
 
 
311 aa  83.6  0.000000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.378944  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000287  50S ribosomal subunit maturation GTPase RbgA  26.39 
 
 
314 aa  83.2  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.146408  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0186  GTP-binding protein HSR1-related protein  28.26 
 
 
285 aa  83.2  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1367  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  26.37 
 
 
292 aa  83.2  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0663  GTP-binding protein, HSR1-related  29.64 
 
 
284 aa  82.4  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.011457  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0843  GTP-binding protein HSR1-related  25.55 
 
 
271 aa  82.8  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3689  ribosomal biogenesis GTPase  26.62 
 
 
296 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0162209  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3597  ribosomal biogenesis GTPase  26.62 
 
 
296 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00124948  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2490  ribosomal biogenesis GTPase  27.55 
 
 
287 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000101626  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3976  ribosomal biogenesis GTPase  26.62 
 
 
296 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127206  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0461  ribosomal biogenesis GTPase  25.95 
 
 
314 aa  82.8  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.178573  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1203  GTP-binding protein HSR1-related  29.33 
 
 
283 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000139155  normal  0.179888 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3851  ribosomal biogenesis GTPase  26.62 
 
 
296 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1988  ribosomal biogenesis GTPase  28.72 
 
 
288 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2377  ribosomal biogenesis GTPase  30.1 
 
 
307 aa  82.4  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0169  ribosomal biogenesis GTPase  28.37 
 
 
323 aa  81.3  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000316145  normal  0.720532 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2590  ribosomal biogenesis GTPase  28.03 
 
 
313 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3885  ribosomal biogenesis GTPase  26.28 
 
 
296 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000521697  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1982  ribosomal biogenesis GTPase  30.05 
 
 
318 aa  80.9  0.00000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.360178 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1586  ribosomal biogenesis GTPase  30.37 
 
 
281 aa  81.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0128264 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0483  GTP-binding protein, HSR1-related  29.43 
 
 
258 aa  81.3  0.00000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2510  GTP-binding protein, HSR1-related  27.85 
 
 
319 aa  81.3  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal  0.0153931 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02701  ribosomal biogenesis GTPase  31.21 
 
 
287 aa  81.3  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0776649  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1350  GTP-binding protein HSR1-related  27.85 
 
 
319 aa  80.9  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0587703  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2283  ribosomal biogenesis GTPase  30.05 
 
 
318 aa  80.9  0.00000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0251974 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1561  ribosomal biogenesis GTPase  31.21 
 
 
287 aa  80.5  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1707  GTP-binding protein, HSR1-related  28.67 
 
 
277 aa  80.5  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.12169  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1307  ribosomal biogenesis GTPase  26.12 
 
 
296 aa  80.5  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615833  unclonable  1.55704e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3880  ribosomal biogenesis GTPase  25.94 
 
 
296 aa  80.5  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000579568  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3936  ribosomal biogenesis GTPase  26.16 
 
 
296 aa  80.1  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000467955  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1349  GTP-binding  27.81 
 
 
319 aa  80.1  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00974199  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3661  ribosomal biogenesis GTPase  26.62 
 
 
296 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000313796  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4647  ribosomal biogenesis GTPase  28.65 
 
 
293 aa  78.6  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.365042 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0973  GTP-binding protein HSR1-related protein  26.99 
 
 
282 aa  78.6  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000015477  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0919  ribosomal biogenesis GTPase  30.29 
 
 
284 aa  78.6  0.0000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.294572  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2487  GTP-binding protein HSR1-related  29.04 
 
 
328 aa  78.2  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000110563 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0773  GTPases  30.29 
 
 
280 aa  77.8  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.79834e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0913  GTPase  32.02 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000773459 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2474  GTP-binding protein HSR1-related  28.06 
 
 
317 aa  77.4  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.188866  normal  0.279197 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2270  GTP-binding protein  27.53 
 
 
322 aa  77  0.0000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193404  hitchhiker  0.000000344964 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0396  GTP-binding protein YlqF  28.52 
 
 
254 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.243282  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1855  ribosomal biogenesis GTPase  27.4 
 
 
313 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0763  GTP-binding protein YlqF  24.48 
 
 
291 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000221052  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1882  ribosomal biogenesis GTPase  27.4 
 
 
313 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.140157  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>