135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_t0445 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_t0445  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0460739  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1859  tRNA-Leu  86.84 
 
 		 82 bp  71.9  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0032  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 83 bp  67.9  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10010  tRNA-Leu  95 
 
 		 83 bp  63.9  0.000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.592276  normal  0.477324 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0045  tRNA-Leu  95 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.936664  normal  0.134818 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0024  tRNA-Leu  95 
 
 		 84 bp  63.9  0.000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0003  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0048  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.624734  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0444  hypothetical protein  100 
 
 		 147 bp  60  0.00000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0319816  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1359  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 84 bp  60  0.00000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.331656  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA41  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0905521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0086  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 83 bp  60  0.00000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000208986  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  89.8 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0002  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 82 bp  58  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.318863  normal  0.56109 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0004  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 82 bp  58  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.446366  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0025  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.330204  normal  0.162761 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0237  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 88 bp  58  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000149567  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0092  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.32054  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0041  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0554879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0081  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1365  tRNA-Leu  95 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0030  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0012  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.597175 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0010  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.652167  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08460  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 81 bp  56  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0705236  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20010  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0005  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.202243  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0049  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.623993  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0014  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.20516  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0061  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.730488  normal  0.489102 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0051  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.751283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0047  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0053  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0708883  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0086  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 83 bp  56  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000003449  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0022  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000969844  normal  0.805987 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0108  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000140726  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0261  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000000661885  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0030  tRNA-Leu  86.44 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000143039  normal  0.038652 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0038    89.13 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.781557  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0032  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0029  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.316584 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0039  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0647053  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0051  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0246748  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0049  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000350278 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0044  tRNA-Leu  100 
 
 		 80 bp  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000745541  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0037  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17364  normal  0.432753 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0033  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0057  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 81 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.279564 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0022  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0224187  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0015  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.134139  normal  0.0596328 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0042  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105612  normal  0.123579 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0035  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.438975  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1580  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1615  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.622416 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0049  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.273052  hitchhiker  0.00863967 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0055  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.143811  hitchhiker  0.0000015114 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0044  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0034  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0742482  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0027  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.985368  normal  0.200865 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1877  tRNA-Leu  90 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000035739  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0079  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254468  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0046  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0049  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.172845  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0750  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0310097  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1215  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0051  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0046  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0026  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0076  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000528748  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3563  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.565082  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3566  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11710  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.35262 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1465  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0010  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000185215  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.130839  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0009  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09040  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00190056  normal  0.352495 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0009  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0016  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000907276  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0040  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000586892  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0055  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000135944  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5685  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0253862  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.285186  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0731155  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000183517  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2793  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000950853  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2796  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000297688  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0677  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2476  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00963424  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2479  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100128  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2482  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00028015  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0178  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0005  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0022  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0047  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00091084  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0013  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000293316  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0057  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.191845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5720  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>