87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0138 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0138  lysophospholipase L1 and related esterase  100 
 
 
327 aa  662    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0220  lipolytic enzyme, G-D-S-L  78.29 
 
 
327 aa  514  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4910  lipolytic enzyme, G-D-S-L  59.56 
 
 
329 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5252  lipolytic protein G-D-S-L family  64.75 
 
 
322 aa  363  2e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0901  lipolytic enzyme, G-D-S-L  64.89 
 
 
303 aa  363  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0767  putative esterase/acetylhydrolase  57.23 
 
 
379 aa  361  1e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0045869  hitchhiker  0.00361745 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0790  lipolytic protein  61.07 
 
 
318 aa  348  6e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0841274  normal  0.111603 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3316  GDSL family lipase  41.67 
 
 
286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.17173  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3640  lipolytic protein G-D-S-L family  41.67 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.876075 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3516  lipolytic protein G-D-S-L family  41.67 
 
 
275 aa  146  5e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0079  lipolytic protein G-D-S-L family  42.47 
 
 
279 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848092  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2090  GDSL family lipase  41.18 
 
 
277 aa  132  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0380541 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3079  GDSL family lipase  36.45 
 
 
269 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1996  GDSL family lipase  39.02 
 
 
238 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4554  lipolytic protein G-D-S-L family  35.63 
 
 
267 aa  126  6e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4183  GDSL family lipase  33.92 
 
 
267 aa  125  7e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4697  lipolytic protein G-D-S-L family  33.48 
 
 
267 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2189  GDSL family lipase  35.41 
 
 
250 aa  108  9.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00786475  normal  0.715805 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4911  hypothetical protein  31.16 
 
 
254 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.797649 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2227  lipolytic protein G-D-S-L family  33.98 
 
 
285 aa  100  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.452033 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0766  hypothetical protein  29.82 
 
 
252 aa  95.1  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0644448  hitchhiker  0.00367044 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1136  lipolytic protein G-D-S-L family  34.31 
 
 
221 aa  94.7  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.527097  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2374  hypothetical protein  29.15 
 
 
276 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.511198  hitchhiker  0.00086593 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5253  hypothetical protein  29.31 
 
 
259 aa  93.2  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.209286  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5560  hypothetical protein  30.91 
 
 
289 aa  92  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515693  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0988  hypothetical protein  28 
 
 
328 aa  89.4  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.552823  normal  0.477663 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0951  hypothetical protein  28 
 
 
327 aa  89.4  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5410  hypothetical protein  29.24 
 
 
288 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465683  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0929  hypothetical protein  29.02 
 
 
270 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.352041 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0789  hypothetical protein  28.84 
 
 
259 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161897  normal  0.103899 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3748  GDSL family lipase  33.33 
 
 
300 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0900  hypothetical protein  29.86 
 
 
259 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0137  hypothetical protein  28.75 
 
 
253 aa  82  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0221  hypothetical protein  29.06 
 
 
253 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0394  GDSL family lipase  28.5 
 
 
204 aa  64.7  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00216683  hitchhiker  0.0000338179 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1523  lipolytic protein G-D-S-L family  30.43 
 
 
220 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  29.02 
 
 
223 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1154  lipolytic protein  26.96 
 
 
213 aa  58.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  28.5 
 
 
223 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1759  GDSL family lipase  31.85 
 
 
213 aa  55.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740812  normal  0.107758 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1745  GDSL family lipase  35.78 
 
 
242 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0864047  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2149  putative lipase  37.61 
 
 
203 aa  53.5  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.208079 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0825  lipolytic protein G-D-S-L family  33.33 
 
 
216 aa  52.4  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000789426  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000168  arylesterase precursor  25.83 
 
 
200 aa  52.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.943584  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0043  GDSL family lipase  28.19 
 
 
202 aa  52  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000938694  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3870  putative lipase  33.7 
 
 
239 aa  51.6  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.749883  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1302  lipolytic protein G-D-S-L family  30.22 
 
 
204 aa  51.6  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  27.21 
 
 
270 aa  50.8  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3350  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.66 
 
 
226 aa  50.8  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0097  GDSL family lipase  25 
 
 
239 aa  50.4  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.221693  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.53 
 
 
270 aa  50.1  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  31.25 
 
 
266 aa  49.7  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0553  lipolytic protein G-D-S-L family  38.1 
 
 
214 aa  48.9  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2220  lipolytic protein G-D-S-L family  27.18 
 
 
214 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05801  arylesterase  24.5 
 
 
200 aa  48.9  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2989  GDSL family lipase  29.67 
 
 
203 aa  47.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.816827  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2630  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.28 
 
 
198 aa  48.1  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0895129  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0191  GDSL family lipase  35.9 
 
 
201 aa  47.4  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1776  lipolytic protein G-D-S-L family  30.34 
 
 
240 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3734  GDSL family lipase  35.42 
 
 
207 aa  47  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00414819  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1104  platelet activating factor, putative  26.4 
 
 
204 aa  47.4  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1829  esterase  27.64 
 
 
188 aa  47  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0305538  normal  0.13667 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0430  acyl-CoA thioesterase I  33.03 
 
 
189 aa  47  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000157795  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0938  arylesterase  25 
 
 
219 aa  47  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.279693  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  35.78 
 
 
219 aa  47  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3650  lipolytic protein  30.25 
 
 
201 aa  45.8  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1015  lysophospholipase L1 or related esterase  25.64 
 
 
299 aa  45.8  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2141  GDSL family lipase  25 
 
 
189 aa  45.8  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.953926  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0686  acyl-CoA thioesterase I precursor  26.97 
 
 
206 aa  44.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0540  lipolytic protein G-D-S-L family  25 
 
 
252 aa  45.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621057  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0413  putative acyl-CoA thioesterase precursor  27.74 
 
 
240 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0650  GDSL family lipase  27.45 
 
 
219 aa  44.3  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2568  arylesterase  22.86 
 
 
195 aa  44.3  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3805  GDSL family lipase  28.38 
 
 
209 aa  43.9  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0188199 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0724  arylesterase  22.73 
 
 
215 aa  43.9  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000311622  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3602  hypothetical protein  22.46 
 
 
685 aa  43.9  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2409  arylesterase  26.11 
 
 
204 aa  43.5  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170275 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3591  hypothetical protein  25.56 
 
 
451 aa  43.5  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0183177  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1401  arylesterase  26.49 
 
 
226 aa  43.1  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1068  Arylesterase  25.81 
 
 
255 aa  43.1  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3412  arylesterase  30.25 
 
 
182 aa  43.1  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.634502  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4377  putative lipase  34.92 
 
 
238 aa  42.7  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3144  lipolytic protein G-D-S-L family  27.42 
 
 
225 aa  42.7  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3118  esterase  24.35 
 
 
188 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1931  lipolytic protein G-D-S-L family  30.51 
 
 
210 aa  42.7  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.403169 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2392  arylesterase  20.48 
 
 
199 aa  42.4  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000677217  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3205  GDSL family lipase  24.86 
 
 
201 aa  42.4  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765552  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>