133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2139 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_2139  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  100 
 
 		 456 aa  948    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04990  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  48.14 
 
 		 466 aa  433  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0663  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  42.67 
 
 		 464 aa  398  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3762  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  44 
 
 		 462 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12101  normal  0.44256 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3221  deoxyribodipyrimidine photolyase  43.61 
 
 		 448 aa  372  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.147791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0725  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  42.7 
 
 		 455 aa  370  1e-101  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3129  DNA photolyase, FAD-binding  43.2 
 
 		 468 aa  363  4e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2754  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  42.6 
 
 		 467 aa  360  3e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.853539 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2531  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  43.02 
 
 		 467 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.695435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6363  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  41.56 
 
 		 465 aa  350  3e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111638 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3500  DNA photolyase FAD-binding protein  42.95 
 
 		 453 aa  348  1e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2459  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  42.35 
 
 		 467 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0155  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  42.04 
 
 		 476 aa  332  8e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_45715  predicted protein  37.5 
 
 		 467 aa  319  7.999999999999999e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.380145  normal  0.059566 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0876  DNA photolyase, class 2  40.87 
 
 		 459 aa  318  1e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4497  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  38.16 
 
 		 446 aa  318  1e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.112755  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1961  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  38.65 
 
 		 468 aa  312  6.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.351083  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0767  deoxyribodipyrimidine photolyase  39.18 
 
 		 451 aa  308  9e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.268516 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2012  deoxyribodipyrimidine photolyase  39.37 
 
 		 450 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0527  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  38.88 
 
 		 462 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1321  deoxyribodipyrimidine photolyase  38.73 
 
 		 469 aa  301  2e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.533615  normal  0.0703748 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1775  deoxyribodipyrimidine photolyase  38.18 
 
 		 447 aa  296  5e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00154316  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0179  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  36.97 
 
 		 487 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0522  DNA photolyase, class 2  34.77 
 
 		 495 aa  278  2e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.372488 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2693  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.58 
 
 		 449 aa  278  2e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2829  deoxyribodipyrimidine photolyase, putative  35.47 
 
 		 461 aa  276  4e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.242896  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2851  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.65 
 
 		 473 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1936  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.47 
 
 		 494 aa  270  5e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0415  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.85 
 
 		 452 aa  261  1e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3226  DNA photolyase FAD-binding  33.62 
 
 		 486 aa  253  6e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575372  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30886  predicted protein  37.28 
 
 		 506 aa  249  7e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.25268 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3125  DNA photolyase FAD-binding  32.98 
 
 		 486 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.848481  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3028  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  33.4 
 
 		 490 aa  246  4e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2716  deoxyribodipyrimidine photolyase  34.71 
 
 		 490 aa  246  6e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4973  DNA photolyase FAD-binding protein  32.98 
 
 		 496 aa  242  9e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41733  predicted protein  35.53 
 
 		 477 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908244  normal  0.188048 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36787  predicted protein  35.53 
 
 		 477 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00684152  hitchhiker  0.00249943 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3007  DNA photolyase FAD-binding  32.37 
 
 		 493 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.742505 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1430  DNA photolyase FAD-binding protein  31.63 
 
 		 493 aa  232  1e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  31.67 
 
 		 843 aa  224  3e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_51952  class II CPD photolyase  31.4 
 
 		 511 aa  223  4e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1907  DNA photolyase, class 2  40 
 
 		 104 aa  68.2  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49165  predicted protein  20.97 
 
 		 495 aa  66.6  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.69324  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1759  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  31.29 
 
 		 454 aa  59.7  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0257219  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1441  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  23.78 
 
 		 474 aa  58.9  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.511514  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4411  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  22.41 
 
 		 487 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00088119  normal  0.0752784 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2256  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  28.4 
 
 		 479 aa  57  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.786952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2179  deoxyribodipyrimidine photolyase  25.95 
 
 		 481 aa  56.2  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1364  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.05 
 
 		 473 aa  56.2  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3098  deoxyribodipyrimidine photolyase  23.2 
 
 		 487 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.383524  normal  0.0341678 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4270  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.95 
 
 		 473 aa  54.7  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.397965  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1262  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.73 
 
 		 463 aa  54.3  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.103305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4932  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  27.67 
 
 		 481 aa  54.3  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1562  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.45 
 
 		 471 aa  54.3  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.51951  normal  0.490223 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02016  DNA photolyase  26.83 
 
 		 474 aa  53.9  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0782959  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0820  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.1 
 
 		 469 aa  53.5  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.627339 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6186  cryptochrome, DASH family  23.94 
 
 		 487 aa  53.5  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2235  cryptochrome, DASH family  22.67 
 
 		 483 aa  52.8  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.14399  normal  0.570848 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1215  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.82 
 
 		 477 aa  53.1  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.300983  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4333  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.62 
 
 		 435 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.652268 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3446  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  22.71 
 
 		 491 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.998107  normal  0.118354 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1880  DNA photolyase  29.22 
 
 		 483 aa  51.2  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2469  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.11 
 
 		 475 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000205711 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2919  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  30.07 
 
 		 478 aa  51.2  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.219923 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0811  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.67 
 
 		 475 aa  50.8  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0700  cryptochrome, DASH family  22.81 
 
 		 488 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0266  hypothetical protein  29.22 
 
 		 471 aa  50.4  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0271  hypothetical protein  29.22 
 
 		 471 aa  50.1  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0430  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  22.98 
 
 		 541 aa  50.1  0.00008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0729  cryptochrome, DASH family  22.81 
 
 		 488 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.264496  normal  0.107921 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4086  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.5 
 
 		 449 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.703366  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1615  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.85 
 
 		 471 aa  49.7  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1613  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.37 
 
 		 425 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1394  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.92 
 
 		 483 aa  49.7  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1252  deoxyribodipyrimidine photolyase  24.07 
 
 		 476 aa  48.9  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0460072  normal  0.903658 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04795  photolyase  27.81 
 
 		 472 aa  49.3  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.722935  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3589  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.4 
 
 		 483 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0377  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.94 
 
 		 486 aa  48.5  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0870  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  20.17 
 
 		 479 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.040956 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2677  deoxyribodipyrimidine photolyase  26.88 
 
 		 486 aa  48.5  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0339  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  23.31 
 
 		 484 aa  48.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10630  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  22.52 
 
 		 450 aa  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0877345 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1272  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.73 
 
 		 434 aa  47.8  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2800  deoxyribodipyrimidine photolyase  26.88 
 
 		 486 aa  47.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2376  deoxyribodipyrimidine photolyase  26.88 
 
 		 486 aa  47.4  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2734  deoxyribodipyrimidine photolyase  26.88 
 
 		 486 aa  47.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.913993  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1691  deoxyribodipyrimidine photolyase  26.88 
 
 		 486 aa  47.4  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.647987  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0439  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  23.94 
 
 		 435 aa  47.4  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0636  deoxyribodipyrimidine photolyase  26.88 
 
 		 497 aa  47  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2911  deoxyribodipyrimidine photolyase  26.88 
 
 		 534 aa  47  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.152719  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1268a  deoxyribodipyrimidine photolyase  28.29 
 
 		 452 aa  47  0.0007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.432586  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2924  deoxyribodipyrimidine photolyase  28.48 
 
 		 476 aa  47  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0465  deoxyribodipyrimidine photolyase  23.87 
 
 		 541 aa  47  0.0008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0998  deoxyribodipyrimidine photolyase  24.67 
 
 		 457 aa  47  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.50142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3112  deoxyribodipyrimidine photolyase  29.11 
 
 		 492 aa  46.2  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.671492  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2747  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  27.1 
 
 		 474 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00995843  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0915  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.77 
 
 		 477 aa  46.2  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1309  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  30 
 
 		 499 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5899  deoxyribodipyrimidine photolyase  27.88 
 
 		 519 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0769953  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3068  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  30 
 
 		 500 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>