More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3419 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4076  dihydroxy-acid dehydratase  75.13 
 
 		 575 aa  850    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1852  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2389  dihydroxy-acid dehydratase  77.54 
 
 		 570 aa  857    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1548  dihydroxy-acid dehydratase  63.75 
 
 		 567 aa  708    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0456866  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10650  dihydroxyacid dehydratase  79.36 
 
 		 582 aa  896    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0955511 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4952  dihydroxy-acid dehydratase  74.23 
 
 		 567 aa  831    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11990  dihydroxy-acid dehydratase  73.19 
 
 		 579 aa  806    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.885522  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0486  dihydroxy-acid dehydratase  77.35 
 
 		 589 aa  862    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.113463 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2280  dihydroxy-acid dehydratase  76.32 
 
 		 572 aa  886    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000860305 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10190  dihydroxy-acid dehydratase  78.55 
 
 		 575 aa  870    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.539259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08490  dihydroxy-acid dehydratase  72.4 
 
 		 571 aa  796    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0146  dihydroxy-acid dehydratase  76.72 
 
 		 580 aa  865    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0136  dihydroxy-acid dehydratase  77.25 
 
 		 580 aa  867    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0617591 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1406  dihydroxy-acid dehydratase  80.42 
 
 		 569 aa  912    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1334  dihydroxy-acid dehydratase  78.29 
 
 		 563 aa  865    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08500  dihydroxy-acid dehydratase  76.36 
 
 		 575 aa  845    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0463604  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2540  dihydroxy-acid dehydratase  77.93 
 
 		 573 aa  899    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0297342  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0705  dihydroxy-acid dehydratase  76.43 
 
 		 558 aa  865    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3419  dihydroxy-acid dehydratase  100 
 
 		 567 aa  1138    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0155  dihydroxy-acid dehydratase  76.72 
 
 		 580 aa  865    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.826193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1711  dihydroxy-acid dehydratase  76.33 
 
 		 571 aa  843    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.835753  normal  0.93934 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0173  dihydroxy-acid dehydratase  80.71 
 
 		 565 aa  895    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2526  dihydroxy-acid dehydratase  78.03 
 
 		 573 aa  862    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1134  dihydroxy-acid dehydratase  80.5 
 
 		 570 aa  909    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0498657  hitchhiker  0.00011132 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2082  dihydroxy-acid dehydratase  56.47 
 
 		 562 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1109  dihydroxy-acid dehydratase  56.76 
 
 		 564 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0346  dihydroxy-acid dehydratase  55.68 
 
 		 557 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0886  dihydroxy-acid dehydratase  54.43 
 
 		 558 aa  598  1e-170  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0368  dihydroxy-acid dehydratase  53.33 
 
 		 563 aa  591  1e-168  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1673  dihydroxy-acid dehydratase  55.04 
 
 		 557 aa  594  1e-168  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379644  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0023  dihydroxy-acid dehydratase  52.79 
 
 		 563 aa  591  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.393007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3121  dihydroxy-acid dehydratase  54.23 
 
 		 561 aa  589  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2999  dihydroxy-acid dehydratase  54.23 
 
 		 561 aa  588  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1370  dihydroxy-acid dehydratase  54.86 
 
 		 557 aa  585  1e-166  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0019  dihydroxy-acid dehydratase  53.51 
 
 		 561 aa  586  1e-166  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0847  dihydroxy-acid dehydratase  53.82 
 
 		 567 aa  588  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0511705 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0062  dihydroxy-acid dehydratase  52.61 
 
 		 562 aa  580  1e-164  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0624  dihydroxy-acid dehydratase  52.94 
 
 		 580 aa  581  1e-164  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2821  dihydroxy-acid dehydratase  52.43 
 
 		 561 aa  580  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00495915 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1240  dihydroxy-acid dehydratase  53.62 
 
 		 564 aa  575  1.0000000000000001e-163  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.325015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2116  dihydroxy-acid dehydratase  55.23 
 
 		 558 aa  575  1.0000000000000001e-163  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.296352  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3155  dihydroxy-acid dehydratase  51.71 
 
 		 559 aa  572  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1222  dihydroxy-acid dehydratase  52.79 
 
 		 557 aa  574  1.0000000000000001e-162  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.640338  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09881  dihydroxy-acid dehydratase  52.07 
 
 		 556 aa  572  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.457791  normal  0.235349 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08091  dihydroxy-acid dehydratase  50.54 
 
 		 559 aa  573  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.287074  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1221  dihydroxy-acid dehydratase  53.42 
 
 		 561 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.240035 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08361  dihydroxy-acid dehydratase  50.99 
 
 		 557 aa  572  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2979  dihydroxy-acid dehydratase  51.53 
 
 		 559 aa  569  1e-161  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.633648  hitchhiker  0.000413857 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0711  dihydroxy-acid dehydratase  52.16 
 
 		 557 aa  570  1e-161  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16921  dihydroxy-acid dehydratase  52.25 
 
 		 556 aa  568  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.438934 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1758  dihydroxy-acid dehydratase  52.51 
 
 		 563 aa  568  1e-161  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.771853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08121  dihydroxy-acid dehydratase  51.35 
 
 		 556 aa  568  1e-161  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0180  dihydroxy-acid dehydratase  51.35 
 
 		 556 aa  568  1e-161  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1260  dihydroxy-acid dehydratase  52.79 
 
 		 557 aa  569  1e-161  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.77083  normal  0.952172 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0782  dihydroxy-acid dehydratase  50.99 
 
 		 557 aa  571  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.729892  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0324  dihydroxy-acid dehydratase  52.77 
 
 		 571 aa  569  1e-161  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08341  dihydroxy-acid dehydratase  50.63 
 
 		 557 aa  568  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.924218  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2114  dihydroxy-acid dehydratase  51.98 
 
 		 578 aa  567  1e-160  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1954  dihydroxy-acid dehydratase  53.33 
 
 		 576 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1347  dihydroxy-acid dehydratase  51.69 
 
 		 577 aa  563  1.0000000000000001e-159  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0142863 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1909  dihydroxy-acid dehydratase  52.97 
 
 		 576 aa  561  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.832097 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2230  dihydroxy-acid dehydratase  53.33 
 
 		 576 aa  561  1e-158  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.941332 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2924  dihydroxy-acid dehydratase  52.79 
 
 		 576 aa  556  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3109  dihydroxy-acid dehydratase  52.38 
 
 		 573 aa  555  1e-157  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1247  dihydroxy-acid dehydratase  55.16 
 
 		 595 aa  556  1e-157  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.853909 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0179  dihydroxy-acid dehydratase  51.71 
 
 		 565 aa  557  1e-157  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0680  dihydroxy-acid dehydratase  50 
 
 		 564 aa  552  1e-156  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.106773  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1170  dihydroxy-acid dehydratase  50 
 
 		 563 aa  554  1e-156  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.385024 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2347  dihydroxy-acid dehydratase  51.25 
 
 		 579 aa  554  1e-156  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2664  dihydroxy-acid dehydratase  53.97 
 
 		 570 aa  554  1e-156  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705889  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3010  dihydroxy-acid dehydratase  50.99 
 
 		 576 aa  549  1e-155  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496774 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0832  dihydroxy-acid dehydratase  50.72 
 
 		 557 aa  548  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.204756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3131  dihydroxy-acid dehydratase  52.98 
 
 		 576 aa  550  1e-155  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.696259  normal  0.295178 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0848  dihydroxy-acid dehydratase  50 
 
 		 558 aa  545  1e-154  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0103963  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2052  dihydroxy-acid dehydratase  49.47 
 
 		 564 aa  545  1e-154  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1553  dihydroxy-acid dehydratase  53.32 
 
 		 563 aa  548  1e-154  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143997  normal  0.944928 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3020  dihydroxy-acid dehydratase  52.04 
 
 		 574 aa  542  1e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.942743 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1387  dihydroxy-acid dehydratase  50.18 
 
 		 560 aa  544  1e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.63064  normal  0.987031 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2412  dihydroxy-acid dehydratase  50.36 
 
 		 557 aa  539  9.999999999999999e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0639  dihydroxy-acid dehydratase  49.91 
 
 		 557 aa  539  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0827  dihydroxy-acid dehydratase  49.82 
 
 		 557 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2530  dihydroxy-acid dehydratase  49.46 
 
 		 564 aa  540  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3634  dihydroxy-acid dehydratase  49.64 
 
 		 557 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.886517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2804  dihydroxy-acid dehydratase  49.37 
 
 		 557 aa  540  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416197  normal  0.582651 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1326  dihydroxy-acid dehydratase  51.08 
 
 		 566 aa  541  9.999999999999999e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.303836  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2511  dihydroxy-acid dehydratase  50.18 
 
 		 557 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2676  dihydroxy-acid dehydratase  50.18 
 
 		 557 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.531561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0988  dihydroxy-acid dehydratase  49.82 
 
 		 557 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1180  dihydroxy-acid dehydratase  50 
 
 		 557 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5793  dihydroxy-acid dehydratase  49.82 
 
 		 557 aa  535  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.351546 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2379  dihydroxy-acid dehydratase  49.64 
 
 		 557 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0129  dihydroxy-acid dehydratase  51.62 
 
 		 577 aa  535  1e-151  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1851  dihydroxy-acid dehydratase  50.36 
 
 		 557 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5368  dihydroxy-acid dehydratase  52.79 
 
 		 577 aa  535  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0341444  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2462  dihydroxy-acid dehydratase  50.36 
 
 		 557 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.345339  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2467  dihydroxy-acid dehydratase  50.36 
 
 		 557 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.43029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2952  dihydroxy-acid dehydratase  49.82 
 
 		 557 aa  534  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0058068  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1647  dihydroxy-acid dehydratase  49.82 
 
 		 557 aa  534  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.332058  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1020  dihydroxy-acid dehydratase  49.82 
 
 		 557 aa  534  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0472909  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2806  dihydroxy-acid dehydratase  51.72 
 
 		 574 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.852293 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5056  dihydroxy-acid dehydratase  52.61 
 
 		 577 aa  533  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.644776  hitchhiker  0.0033961 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>