More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3069 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3069  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 586 aa  1173    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0109625  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1004  peptidoglycan glycosyltransferase  43.22 
 
 		 638 aa  421  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.855584  normal  0.147704 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2932  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.03 
 
 		 702 aa  402  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00757517  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1401  peptidoglycan glycosyltransferase  40.31 
 
 		 727 aa  399  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677151  normal  0.0298794 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1409  peptidoglycan glycosyltransferase  42.88 
 
 		 670 aa  394  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00741927  normal  0.017677 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1104  peptidoglycan glycosyltransferase  41.21 
 
 		 653 aa  386  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0520917  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2864  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.03 
 
 		 583 aa  378  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3205  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.24 
 
 		 635 aa  364  3e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0996816  normal  0.0272319 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5104  peptidoglycan glycosyltransferase  41 
 
 		 839 aa  360  6e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0680145  normal  0.0778516 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0890  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.99 
 
 		 655 aa  358  1.9999999999999998e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.641188  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3268  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.07 
 
 		 607 aa  349  8e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0424379  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10750  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  39.32 
 
 		 581 aa  347  4e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0761789  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1656  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.31 
 
 		 682 aa  344  2.9999999999999997e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.151204 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2665  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.69 
 
 		 677 aa  330  5.0000000000000004e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22860  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  37.79 
 
 		 754 aa  327  4.0000000000000003e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.499812  normal  0.0374839 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1278  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.92 
 
 		 618 aa  322  9.999999999999999e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.907115  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3444  peptidoglycan glycosyltransferase  38.06 
 
 		 716 aa  321  3e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00730132  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3218  penicillin-binding protein, transpeptidase  36.51 
 
 		 716 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0525983 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1068  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.7 
 
 		 579 aa  313  3.9999999999999997e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.724517 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16620  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  36.21 
 
 		 663 aa  312  1e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.422305  normal  0.0185219 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1565  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.16 
 
 		 600 aa  308  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2982  peptidoglycan glycosyltransferase  36.59 
 
 		 635 aa  301  2e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265942  normal  0.116719 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3023  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.66 
 
 		 634 aa  296  7e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0205906  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3529  peptidoglycan glycosyltransferase  35.91 
 
 		 652 aa  293  8e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0960605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3262  peptidoglycan glycosyltransferase  35.44 
 
 		 642 aa  290  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258403  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3273  peptidoglycan glycosyltransferase  35.44 
 
 		 642 aa  290  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.709571  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3324  peptidoglycan glycosyltransferase  35.44 
 
 		 642 aa  290  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0881195  normal  0.041689 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1564  peptidoglycan glycosyltransferase  34.84 
 
 		 600 aa  290  7e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.924242  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1590  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.79 
 
 		 692 aa  289  1e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150258  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24950  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  33.45 
 
 		 637 aa  288  2.9999999999999996e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.439069  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12193  penicillin-binding membrane protein pbpB  35.61 
 
 		 679 aa  286  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.98253e-20  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5772  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.47 
 
 		 635 aa  280  6e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  35.6 
 
 		 657 aa  270  4e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2100  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.41 
 
 		 568 aa  265  1e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000215244 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  35.69 
 
 		 657 aa  264  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  32.63 
 
 		 711 aa  264  3e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  33.39 
 
 		 708 aa  263  4.999999999999999e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13660  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  34.31 
 
 		 608 aa  263  6e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00924315  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0175  cell division protein  32.45 
 
 		 600 aa  262  1e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2652  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.78 
 
 		 654 aa  259  1e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3930  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.8 
 
 		 570 aa  257  3e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000459011  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  35.39 
 
 		 583 aa  256  6e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1107  penicillin-binding protein, transpeptidase domain protein  31.94 
 
 		 613 aa  256  7e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1479  peptidoglycan synthetase FtsI  33.04 
 
 		 581 aa  253  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0193532  normal  0.796051 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1295  peptidoglycan synthetase FtsI  32.87 
 
 		 581 aa  253  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103537  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2037  peptidoglycan synthetase FtsI  32.87 
 
 		 581 aa  253  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00133127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1976  peptidoglycan synthetase FtsI  32.87 
 
 		 581 aa  253  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0049201  normal  0.138464 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1980  peptidoglycan synthetase FtsI  32.87 
 
 		 581 aa  253  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0756202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.63 
 
 		 662 aa  249  8e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  33.98 
 
 		 656 aa  248  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  33.51 
 
 		 586 aa  246  9e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3775  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.6 
 
 		 553 aa  245  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.061336  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.22 
 
 		 654 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  31.34 
 
 		 695 aa  243  5e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0947  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  31.67 
 
 		 553 aa  243  9e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0977  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  31.67 
 
 		 553 aa  242  1e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2416  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.74 
 
 		 584 aa  241  2e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1298  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.75 
 
 		 704 aa  241  2e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0979  peptidoglycan glycosyltransferase  31.55 
 
 		 723 aa  241  2e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  32 
 
 		 705 aa  241  2.9999999999999997e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  33.57 
 
 		 582 aa  241  4e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3525  peptidoglycan glycosyltransferase  32.05 
 
 		 586 aa  240  5e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  33.45 
 
 		 579 aa  240  5e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  32.98 
 
 		 578 aa  239  8e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1498  peptidoglycan glycosyltransferase  32.23 
 
 		 556 aa  239  9e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00439152  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  34.31 
 
 		 660 aa  239  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1015  stage V sporulation protein D  32.87 
 
 		 646 aa  239  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0669  stage V sporulation protein D  31.2 
 
 		 713 aa  238  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  33.27 
 
 		 579 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3635  peptidoglycan glycosyltransferase  32.06 
 
 		 729 aa  238  3e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  33.68 
 
 		 622 aa  238  3e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.3 
 
 		 570 aa  237  5.0000000000000005e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0212  peptidoglycan synthetase FtsI  33.74 
 
 		 594 aa  237  5.0000000000000005e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0391  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.74 
 
 		 594 aa  237  5.0000000000000005e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.206173 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  34.65 
 
 		 577 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  32.98 
 
 		 657 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  32.63 
 
 		 583 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  33.27 
 
 		 657 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4069  stage V sporulation protein D  33.04 
 
 		 682 aa  234  3e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  32.4 
 
 		 579 aa  234  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  33.51 
 
 		 740 aa  234  3e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0544  stage V sporulation protein D  30.9 
 
 		 721 aa  234  3e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.6503  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  30.43 
 
 		 587 aa  234  4.0000000000000004e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0528  stage V sporulation protein D  30.25 
 
 		 728 aa  234  5e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  32.92 
 
 		 613 aa  232  1e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2730  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.05 
 
 		 595 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2679  peptidoglycan glycosyltransferase  33.22 
 
 		 624 aa  232  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0524  peptidoglycan glycosyltransferase  32.87 
 
 		 615 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  33.09 
 
 		 613 aa  231  3e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3639  peptidoglycan synthetase FtsI  32.87 
 
 		 615 aa  231  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776215 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1112  penicillin-binding protein  33.45 
 
 		 614 aa  231  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0842  peptidoglycan synthetase FtsI  32.76 
 
 		 568 aa  231  3e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0071  peptidoglycan glycosyltransferase  32.87 
 
 		 615 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0553  peptidoglycan glycosyltransferase  32.87 
 
 		 615 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1331  peptidoglycan glycosyltransferase  32.44 
 
 		 582 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.87 
 
 		 595 aa  230  5e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3598  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.28 
 
 		 587 aa  228  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3134  peptidoglycan synthetase FtsI  33.85 
 
 		 605 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  31.85 
 
 		 552 aa  228  2e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  31.85 
 
 		 548 aa  228  2e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>