More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1998 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1998  Signal transduction histidine kinase  100 
 
 
694 aa  1407    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.689731  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2672  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.22 
 
 
659 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0528368  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2399  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.59 
 
 
694 aa  513  1e-144  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0198  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  46.89 
 
 
693 aa  495  9.999999999999999e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.828483 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1618  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.57 
 
 
712 aa  476  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1598  histidine kinase  38.87 
 
 
689 aa  459  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0158  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.16 
 
 
684 aa  459  9.999999999999999e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1534  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.48 
 
 
688 aa  461  9.999999999999999e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.887236  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2437  sensor histidine kinase  37.07 
 
 
704 aa  456  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166276  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2497  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.52 
 
 
688 aa  457  1e-127  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0703  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.86 
 
 
703 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0750  signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 
680 aa  401  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3103  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 
688 aa  367  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5031  sensor histidine kinase  36.94 
 
 
677 aa  339  9.999999999999999e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0429  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 
690 aa  325  2e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0815441 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3296  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 
672 aa  320  7e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.593293  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03285  sensor histidine kinase  32.9 
 
 
675 aa  318  2e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 
711 aa  297  5e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0949  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 
706 aa  268  2e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.317535  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3440  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 
708 aa  246  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.184047  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2957  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 
697 aa  231  4e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.445047  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1993  histidine kinase  29.67 
 
 
696 aa  211  4e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.124604  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1806  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 
690 aa  211  5e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2444  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 
695 aa  206  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1941  sensor histidine kinase  29.22 
 
 
677 aa  188  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2439  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 
690 aa  188  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2196  histidine kinase  28.73 
 
 
684 aa  188  4e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2325  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.86 
 
 
681 aa  184  6e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.136199  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3043  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 
678 aa  169  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.546021  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0661  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 
686 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0849  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.27 
 
 
701 aa  144  7e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.732792  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 
544 aa  103  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 
581 aa  97.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0671901  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4457  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 
661 aa  94  9e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3374  two-component sensor kinase CbrA  26.72 
 
 
1000 aa  92  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.694338  normal  0.111505 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3487  histidine kinase  29.96 
 
 
581 aa  90.1  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0451928  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3342  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.32 
 
 
581 aa  89.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0336288  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4312  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 
591 aa  89.7  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3021  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.58 
 
 
812 aa  89.7  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.510865  normal  0.160517 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.06 
 
 
581 aa  87.4  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0109  histidine kinase  27.62 
 
 
461 aa  87  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000786251 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4448  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 
589 aa  85.1  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2364  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.12 
 
 
646 aa  85.1  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.765238  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0696  histidine kinase  28.45 
 
 
248 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0073771  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5544  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
420 aa  83.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5223  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.33 
 
 
722 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2718  histidine kinase  27.37 
 
 
623 aa  83.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2081  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.27 
 
 
899 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4467  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 
589 aa  83.2  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0773722  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3835  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 
386 aa  82  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.14 
 
 
703 aa  81.6  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3550  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 
386 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.732563  normal  0.10133 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1935  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 
386 aa  82  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487493  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2633  histidine kinase  28.24 
 
 
566 aa  81.6  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.77 
 
 
1057 aa  80.9  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.5 
 
 
725 aa  80.9  0.00000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4107  PAS sensor protein  27.27 
 
 
587 aa  80.9  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0206968  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2019  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.72 
 
 
1016 aa  80.5  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.25506  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0097  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27 
 
 
720 aa  80.5  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0867  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.12 
 
 
905 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.768776  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4177  histidine kinase  26.53 
 
 
620 aa  80.1  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.661658  normal  0.571454 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4475  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.27 
 
 
587 aa  80.5  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3114  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.66 
 
 
644 aa  79.7  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.582192  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2979  histidine kinase  26.95 
 
 
622 aa  79.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0797138 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4147  ATP-binding region ATPase domain protein  22.39 
 
 
1230 aa  78.6  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.175374 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3433  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  28.34 
 
 
503 aa  78.6  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.812028  normal  0.0364545 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 
1519 aa  79  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0865128  normal  0.147126 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1511  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.14 
 
 
575 aa  79  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4105  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.37 
 
 
888 aa  79  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  27.44 
 
 
1710 aa  79  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.18 
 
 
809 aa  79  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0581395 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4196  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.91 
 
 
693 aa  78.2  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4825  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.43 
 
 
582 aa  78.2  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.924426 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0063  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.61 
 
 
837 aa  77.8  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1983  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.13 
 
 
847 aa  77.8  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.138459 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0733  histidine kinase  26.09 
 
 
1347 aa  77.4  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.52 
 
 
874 aa  77.4  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0139218  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1684  histidine kinase  30.07 
 
 
701 aa  77.8  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1053  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.96 
 
 
1059 aa  77.8  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111783  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4846  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.15 
 
 
701 aa  77.4  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.110474 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1733  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 
594 aa  77.4  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2124  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.72 
 
 
857 aa  77  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104313  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3794  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.75 
 
 
708 aa  77.4  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.475023 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3849  ATP-binding region ATPase domain protein  26.92 
 
 
483 aa  77.4  0.0000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3364  histidine kinase  29.57 
 
 
249 aa  77  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0903  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  28.47 
 
 
898 aa  76.6  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.345455  normal  0.909605 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0505  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 
498 aa  77  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3514  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 
494 aa  77  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2240  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.12 
 
 
672 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5060  histidine kinase  26.82 
 
 
467 aa  76.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0718016  normal  0.845094 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3521  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.32 
 
 
1022 aa  76.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0941  sensor histidine kinase, putative  26.03 
 
 
248 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1319  sensor histidine kinase  29.11 
 
 
367 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3651  GAF sensor hybrid histidine kinase  26.42 
 
 
727 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.125923 
 
 
-
 
NC_004310  BR1039  sensory box histidine kinase/response regulator  27.72 
 
 
945 aa  76.3  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2256  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.97 
 
 
727 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.903593 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4588  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.52 
 
 
585 aa  76.6  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179057  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3259  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 
622 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.157895  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3408  histidine kinase  29.18 
 
 
573 aa  76.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0068838  normal  0.336005 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1094  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.52 
 
 
364 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>