259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1842 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1842  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  494  1e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2037  SNARE associated Golgi protein-like protein  35.92 
 
 
235 aa  153  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0559  DedA family protein  27.88 
 
 
231 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0543  DedA family protein  27.88 
 
 
231 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2829  hypothetical protein  32 
 
 
252 aa  102  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1617  DedA-like protein  29.77 
 
 
234 aa  101  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.538877 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2471  hypothetical protein  24.55 
 
 
235 aa  98.6  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01721  conserved inner membrane protein  24.55 
 
 
235 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01709  hypothetical protein  24.55 
 
 
235 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1880  SNARE associated Golgi protein  24.55 
 
 
235 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124953 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1438  hypothetical protein  24.55 
 
 
235 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.319111  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1975  hypothetical protein  24.55 
 
 
235 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1890  SNARE associated Golgi protein-like protein  24.55 
 
 
235 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.028896  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1836  hypothetical protein  24.55 
 
 
235 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2001  hypothetical protein  24.55 
 
 
235 aa  95.9  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0647  SNARE associated Golgi protein-related protein  25.56 
 
 
251 aa  95.1  9e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  27.62 
 
 
229 aa  94  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0746  hypothetical protein  28.5 
 
 
239 aa  92  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.528389 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1525  hypothetical protein  27.33 
 
 
194 aa  82.8  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3865  SNARE associated Golgi protein  23.56 
 
 
237 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3291  hypothetical protein  23.38 
 
 
240 aa  70.9  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1595  SNARE associated Golgi protein  24.58 
 
 
234 aa  70.5  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.734861  hitchhiker  0.00926155 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4044  SNARE associated Golgi protein  28.8 
 
 
220 aa  68.9  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.786736  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2340  hypothetical protein  24.69 
 
 
226 aa  68.9  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290858  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3768  SNARE associated Golgi protein  28.8 
 
 
220 aa  68.9  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.543637 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1893  hypothetical protein  28.39 
 
 
224 aa  68.2  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3139  SNARE associated Golgi protein  25.15 
 
 
234 aa  65.5  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4020  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.74 
 
 
211 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  0.0663531 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5151  hypothetical protein  26.43 
 
 
227 aa  62  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.41653 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  23.71 
 
 
320 aa  62  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  26.7 
 
 
735 aa  62  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0012  SNARE associated Golgi protein  29.66 
 
 
159 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.566831  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2261  SNARE associated Golgi protein  23.84 
 
 
267 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000842977  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0716  hypothetical protein  27.33 
 
 
160 aa  58.9  0.00000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.25 
 
 
701 aa  58.9  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  25.51 
 
 
236 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  25 
 
 
236 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  31.97 
 
 
224 aa  57.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0873  SNARE associated Golgi protein  23.35 
 
 
236 aa  57.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000105314  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  25 
 
 
236 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  25 
 
 
236 aa  57  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  25 
 
 
236 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1602  hypothetical protein  24.56 
 
 
231 aa  57  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  29.38 
 
 
215 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  27.97 
 
 
714 aa  57  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  25 
 
 
236 aa  57  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  25 
 
 
236 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  29.75 
 
 
217 aa  56.6  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0156  SNARE associated Golgi protein  27.27 
 
 
160 aa  56.2  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal  0.0291058 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1746  SNARE associated Golgi protein  27.97 
 
 
160 aa  55.8  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.535585  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0481  hypothetical protein  22.91 
 
 
253 aa  56.2  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000679806  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  27.93 
 
 
218 aa  55.8  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  25 
 
 
236 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1998  hypothetical protein  26.71 
 
 
192 aa  55.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.831633  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  27.72 
 
 
217 aa  54.7  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1181  hypothetical protein  23.18 
 
 
229 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.339336  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2300  hypothetical protein  24.46 
 
 
187 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215162  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  26.63 
 
 
229 aa  53.9  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  25.73 
 
 
217 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3057  SNARE associated Golgi protein  24.66 
 
 
226 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000000815606  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  28.75 
 
 
212 aa  53.5  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  28.14 
 
 
227 aa  53.5  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0273  hypothetical protein  26.71 
 
 
215 aa  53.1  0.000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.294063  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03520  hypothetical protein  24.71 
 
 
272 aa  53.1  0.000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.130294 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5227  hypothetical protein  23.19 
 
 
220 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2018  hypothetical protein  26.61 
 
 
245 aa  52.8  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5607  hypothetical protein  23.19 
 
 
220 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.352858  normal  0.394132 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5315  hypothetical protein  23.19 
 
 
220 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  29.45 
 
 
214 aa  52.4  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  28.26 
 
 
724 aa  52.4  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  25.42 
 
 
242 aa  52.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  28.12 
 
 
215 aa  52.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1364  phospholipase D/transphosphatidylase  28.35 
 
 
226 aa  52.4  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209731  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  28.21 
 
 
714 aa  52.4  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2849  dedA family protein  28.48 
 
 
201 aa  52  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192016 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0994  DedA family protein  28.24 
 
 
214 aa  52  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00874601  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2872  dedA family protein  29.75 
 
 
201 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0269075  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  24.87 
 
 
735 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  28.31 
 
 
250 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  23.08 
 
 
623 aa  51.6  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0661  DedA family transmembrane protein  27.68 
 
 
257 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0686  SNARE associated Golgi protein  27.68 
 
 
257 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.47961  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2110  hypothetical protein  23.84 
 
 
234 aa  50.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2652  dedA family protein  27.85 
 
 
201 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000160491  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2603  DedA family protein  27.85 
 
 
201 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000431988  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1596  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.46 
 
 
229 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2842  DedA family protein  27.85 
 
 
201 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580613  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0013  hypothetical protein  27.86 
 
 
235 aa  50.8  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1038  SNARE associated Golgi protein  26.17 
 
 
197 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0192759  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  27.27 
 
 
221 aa  50.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1483  SNARE associated Golgi protein  26.98 
 
 
246 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.183252 
 
 
-
 
NC_002936  DET0048  hypothetical protein  25.19 
 
 
203 aa  50.4  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0254936  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0914  hypothetical protein  28.26 
 
 
203 aa  50.4  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2646  SNARE associated Golgi protein  27.22 
 
 
218 aa  50.4  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00131391  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_48  hypothetical protein  28.47 
 
 
212 aa  50.1  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00550063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2571  DedA family protein  27.04 
 
 
201 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.501826  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  27.19 
 
 
717 aa  49.7  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1053  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.57 
 
 
222 aa  50.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1030  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.86 
 
 
203 aa  50.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  24 
 
 
264 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>