55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1596 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1596  SNARE associated Golgi protein-like protein  100 
 
 		 229 aa  422  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1435  SNARE associated Golgi protein  31.06 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000156702  decreased coverage  0.000261969 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2037  SNARE associated Golgi protein-like protein  33.33 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0013  hypothetical protein  30.26 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1800  SNARE associated Golgi protein  32.26 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2075  DedA family protein  27.59 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190236  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1617  DedA-like protein  33.56 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.538877 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1842  hypothetical protein  28.46 
 
 		 249 aa  50.1  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01721  conserved inner membrane protein  26.85 
 
 		 235 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01709  hypothetical protein  26.85 
 
 		 235 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3177  SNARE associated Golgi protein  25.28 
 
 		 221 aa  49.3  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1975  hypothetical protein  26.85 
 
 		 235 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1880  SNARE associated Golgi protein  26.85 
 
 		 235 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124953 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2001  hypothetical protein  27.13 
 
 		 235 aa  48.9  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1836  hypothetical protein  26.85 
 
 		 235 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1438  hypothetical protein  26.85 
 
 		 235 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.319111  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1890  SNARE associated Golgi protein-like protein  26.85 
 
 		 235 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.028896  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1825  hypothetical protein  34.56 
 
 		 145 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2511  SNARE associated Golgi protein-related protein  36 
 
 		 264 aa  48.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240937  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1852  hypothetical protein  34.17 
 
 		 145 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0647  SNARE associated Golgi protein-related protein  24.66 
 
 		 251 aa  47  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1869  alkaline phosphatase  28.95 
 
 		 200 aa  47.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0559  DedA family protein  27.61 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0543  DedA family protein  27.61 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0828  membrane protein, DedA family  31.75 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0540  hypothetical protein  34.83 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2471  hypothetical protein  26.17 
 
 		 235 aa  47  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2552  SNARE associated Golgi protein  31.85 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0229  hypothetical protein  36.27 
 
 		 143 aa  46.2  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18330  uncharacterized membrane-associated protein  33.33 
 
 		 230 aa  46.2  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1606  membrane protein-like protein  32.88 
 
 		 416 aa  45.8  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  32.47 
 
 		 213 aa  45.4  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2202  hypothetical protein  33.82 
 
 		 145 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5166  membrane protein  35.09 
 
 		 146 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04261  hypothetical protein  27.14 
 
 		 249 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3535  hypothetical protein  33.82 
 
 		 145 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1042  SNARE associated Golgi protein  29.84 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.406672 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1711  hypothetical protein  27.14 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.427303  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0668  SNARE associated Golgi protein  27.34 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000171663  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  38.24 
 
 		 268 aa  43.9  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  36.11 
 
 		 237 aa  43.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  34.31 
 
 		 198 aa  43.5  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2261  SNARE associated Golgi protein  25.77 
 
 		 267 aa  43.5  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000842977  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2268  hypothetical protein  28.16 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0807  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.63 
 
 		 664 aa  42.7  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.568795  normal  0.843348 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1181  hypothetical protein  33.08 
 
 		 229 aa  43.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.339336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  36.11 
 
 		 237 aa  43.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0684  membrane protein-like protein  33.33 
 
 		 145 aa  43.1  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3865  SNARE associated Golgi protein  24.85 
 
 		 237 aa  42.7  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0500  SNARE associated Golgi protein  34.83 
 
 		 205 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249861  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0537  DedA family protein  34.17 
 
 		 211 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1364  phospholipase D/transphosphatidylase  31.82 
 
 		 226 aa  42.7  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03691  hypothetical protein  26.51 
 
 		 246 aa  42.4  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  26.73 
 
 		 219 aa  42  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1483  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.15 
 
 		 207 aa  41.6  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>