82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0093 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0093  transport-associated protein  100 
 
 		 119 aa  245  1e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.419766  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  37.5 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  36.7 
 
 		 192 aa  67.4  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2078  transport-associated  31.9 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.278114  normal  0.920711 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0073  transport-associated  41.43 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0674  transport-associated  32.08 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1501  transport-associated protein  31.37 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1094  transport-associated  34.12 
 
 		 171 aa  57.4  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0950  transport-associated  34.12 
 
 		 171 aa  57.4  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.239728  normal  0.788848 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  42.25 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3849  transport-associated  31.13 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000819027 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  40.85 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0477  transport-associated  33.66 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0874  transport-associated  36.23 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  38.81 
 
 		 204 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  38.81 
 
 		 204 aa  53.9  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  38.81 
 
 		 204 aa  53.9  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2251  transport-associated  35.29 
 
 		 103 aa  53.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  40.58 
 
 		 204 aa  53.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  38.24 
 
 		 205 aa  53.5  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  32.5 
 
 		 218 aa  52.4  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1805  transport-associated protein  30.56 
 
 		 106 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2673  transport-associated  34.78 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178392 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4004  transport-associated  38.03 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.38345  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3867  transport-associated  37.68 
 
 		 104 aa  51.6  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2837  transport-associated  37.68 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.47962  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3514  transport-associated  37.68 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2047  transport-associated protein  32.26 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2909  putative lipoprotein  40 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.434819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0916  transport-associated  33.01 
 
 		 104 aa  50.4  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0278  periplasmic or secreted lipoprotein  34.78 
 
 		 103 aa  50.4  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.406104  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0063  transport-associated  31.25 
 
 		 110 aa  50.4  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37402  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3015  transport-associated  37.14 
 
 		 230 aa  50.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2407  transport-associated protein  32.61 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00333473  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  38.24 
 
 		 205 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  38.24 
 
 		 205 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  38.24 
 
 		 205 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  38.24 
 
 		 205 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  38.24 
 
 		 205 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5898  transport-associated  27.88 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1119  transport-associated  34.26 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777172 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1642  putative periplasmic protein  32.39 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34760  Phospholipid-binding domain-containing protein  38.96 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0915  transport-associated  34.29 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.629645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3465  periplasmic protein  36.99 
 
 		 202 aa  48.9  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  36.23 
 
 		 201 aa  48.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  38.81 
 
 		 201 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  36.23 
 
 		 201 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  36.23 
 
 		 201 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  36.23 
 
 		 201 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  36.23 
 
 		 201 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  36.23 
 
 		 201 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  36.23 
 
 		 201 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  38.81 
 
 		 201 aa  47  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2048  transport-associated  24.3 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2343  transport-associated  38.03 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259537  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1939  phospholipid-binding domain-containing protein  24.3 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315443  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2319  phospholipid-binding domain-containing protein  24.3 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0875  transport-associated  36.23 
 
 		 104 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.647487  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2170  transport-associated  27.43 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.395466  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2175  osmotically inducible periplasmic protein  33.82 
 
 		 166 aa  45.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.17152  normal  0.224433 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1033  transport-associated  26.67 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.232129  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0589  phospholipid-binding domain-containing protein  23.21 
 
 		 183 aa  43.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1671  transport-associated  29.03 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3244  transport-associated  32.84 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.688311  normal  0.631575 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0826  transport-associated  35.62 
 
 		 245 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2542  transport-associated protein  28.12 
 
 		 105 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000702242 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0305  hypothetical protein  32.46 
 
 		 190 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0106896  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3785  hypothetical protein  29.82 
 
 		 191 aa  41.6  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00453791  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3297  transport-associated  32.39 
 
 		 201 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.173268  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3587  transport-associated  34.21 
 
 		 191 aa  41.6  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2052  transport-associated protein  29.85 
 
 		 139 aa  41.2  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6897  transport-associated  37.31 
 
 		 217 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2185  transport-associated  32.86 
 
 		 255 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2261  transport-associated  35.59 
 
 		 282 aa  41.2  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2719  putative phospholipid-binding protein  34.67 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3022  transport-associated  31.88 
 
 		 158 aa  40.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  0.200341 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0932  transport-associated  33 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0311  hypothetical protein  32.17 
 
 		 190 aa  40.8  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.716428  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3627  hypothetical protein  31.78 
 
 		 190 aa  40.4  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4115  transport-associated  34.72 
 
 		 166 aa  40.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0177  transport-associated  31.82 
 
 		 276 aa  40.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>