31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1281 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1281  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 154 aa  305  2.0000000000000002e-82  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0435937 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1645  ArsR family transcriptional regulator  46.9 
 
 		 166 aa  133  9e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1276  hypothetical protein  31.09 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.121315 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1674  transcriptional regulator TrmB  33.1 
 
 		 247 aa  72  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1726  transcriptional regulator, ArsR family  27.27 
 
 		 167 aa  64.7  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0364777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0583  transcriptional regulator, ArsR family  31.85 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2162  regulatory protein, ArsR  30.23 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2193  hypothetical protein  24.03 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.135571  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0760  transcriptional regulator, ArsR family  31.71 
 
 		 248 aa  62  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.357604  normal  0.170766 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2012  ArsR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0348  transcriptional regulator, ArsR family  25.68 
 
 		 176 aa  57.4  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.122504 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2080  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  26.81 
 
 		 271 aa  55.1  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0660  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 		 282 aa  53.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0375  hypothetical protein  30.36 
 
 		 273 aa  52.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.191948  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2068  transcriptional regulator, TrmB  27.5 
 
 		 285 aa  52  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0231  ArsR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 277 aa  50.4  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3377  hypothetical protein  30.53 
 
 		 254 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000923215  hitchhiker  0.00992163 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2687  transcriptional regulator, ArsR family  21.49 
 
 		 175 aa  47.8  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0234  ArsR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 248 aa  45.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0944  transcriptional regulator, ArsR family  21.09 
 
 		 219 aa  45.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0139266  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0340  regulatory protein, Crp  23.08 
 
 		 242 aa  45.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.659624  normal  0.909155 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2801  transcriptional regulator, MarR family  26.39 
 
 		 214 aa  44.7  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.90963  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2989  transcription regulator  27.62 
 
 		 204 aa  44.7  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1272  hypothetical protein  23.97 
 
 		 257 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.708188  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1756  regulatory protein, ArsR  24.8 
 
 		 267 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0605  hypothetical protein  27.43 
 
 		 208 aa  43.1  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2910  transcriptional regulator, ArsR family  25.37 
 
 		 200 aa  42  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0091  hypothetical protein  21.37 
 
 		 244 aa  42  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3361  hypothetical protein  25 
 
 		 254 aa  40.8  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000089037  normal  0.0139562 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1326  transcriptional regulator TrmB  27.87 
 
 		 171 aa  40.8  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000018018 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2379  transcriptional regulator, MarR family  23.44 
 
 		 485 aa  40.4  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>