More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3121 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_0928  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  83 
 
 		 447 aa  731    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3121  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  100 
 
 		 447 aa  899    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1974  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  68.77 
 
 		 414 aa  555  1e-157  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0918709 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2074  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  65.37 
 
 		 451 aa  532  1e-150  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.139696  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2507  RimK domain protein ATP-grasp  52.31 
 
 		 449 aa  422  1e-117  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.451743 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0158  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.71 
 
 		 295 aa  106  9e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.314526  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0692  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.55 
 
 		 296 aa  102  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.136634  hitchhiker  0.0000298511 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1118  alpha-L-glutamate ligase  34.8 
 
 		 292 aa  100  6e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.36995  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1747  alpha-L-glutamate ligase  31.51 
 
 		 299 aa  98.2  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1761  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.71 
 
 		 296 aa  92.8  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0723  alpha-L-glutamate ligase  32.41 
 
 		 299 aa  90.9  4e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.349493 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0328  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.24 
 
 		 294 aa  90.5  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.88 
 
 		 324 aa  89.7  9e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1502  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.62 
 
 		 291 aa  89.4  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2302  alpha-L-glutamate ligase  40 
 
 		 292 aa  87.8  3e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0136928 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2616  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.87 
 
 		 294 aa  88.2  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2074  alpha-L-glutamate ligase  28.47 
 
 		 292 aa  88.2  3e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0012  alpha-L-glutamate ligase  32.04 
 
 		 329 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2254  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  37.2 
 
 		 314 aa  87  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1691  SSU ribosomal protein S6P modification protein  37.68 
 
 		 314 aa  87  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0318  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.16 
 
 		 288 aa  87  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1276  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.18 
 
 		 310 aa  87  6e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2113  alpha-L-glutamate ligase  36.71 
 
 		 340 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795675  normal  0.0912587 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0182  alpha-L-glutamate ligase  29.11 
 
 		 292 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0564  alpha-L-glutamate ligase  27.09 
 
 		 293 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.194605  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1944  alpha-L-glutamate ligase  31.4 
 
 		 292 aa  85.5  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1580  alpha-L-glutamate ligase  27.75 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3203  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.88 
 
 		 329 aa  84  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398244  normal  0.0345991 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02450  Glutathione synthase  26.04 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23180  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.95 
 
 		 411 aa  84  0.000000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0847  alpha-L-glutamate ligase  27.91 
 
 		 269 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal  0.189578 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0721  alpha-L-glutamate ligase  37.39 
 
 		 292 aa  82.4  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.609176 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0874  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.58 
 
 		 292 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205884  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0316  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.24 
 
 		 282 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6087  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.34 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0628  alpha-L-glutamate ligase  28.77 
 
 		 300 aa  81.6  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1687  S6 modification enzyme RimK  31.96 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0011  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.21 
 
 		 327 aa  82.4  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1729  alpha-L-glutamate ligase  28.17 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0506  SSU ribosomal protein S6P modification protein  33.5 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3274  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.3 
 
 		 300 aa  82  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6289  lysine biosynthesis enzyme LysX  34.98 
 
 		 293 aa  81.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.1 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6485  alpha-L-glutamate ligase  30.45 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3661  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.09 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0924  ribosomal protein S6 modification protein  31.88 
 
 		 300 aa  80.9  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2165  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  37.2 
 
 		 314 aa  80.5  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1366  ribosomal protein S6 modification protein  31.88 
 
 		 300 aa  80.9  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  29.7 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1832  alpha-L-glutamate ligase  33.96 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2103  ribosomal protein S6 modification protein  39.83 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2167  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.96 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.538668  normal  0.206065 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0151  alpha-L-glutamate ligase  35.45 
 
 		 293 aa  79.3  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0259  S6 modification enzyme RimK  30.04 
 
 		 307 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2024  alpha-L-glutamate ligase  38.98 
 
 		 301 aa  79.3  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.095015  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00857  ribosomal protein S6 modification protein  31.4 
 
 		 300 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2790  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.4 
 
 		 300 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0011  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.5 
 
 		 327 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.532418  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0955  ribosomal protein S6 modification protein  31.4 
 
 		 300 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1744  alpha-L-glutamate ligase  27.08 
 
 		 331 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2744  ribosomal protein S6 modification protein  31.4 
 
 		 300 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.155924 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0763  alpha-L-glutamate ligase  47.73 
 
 		 299 aa  79  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.708688  normal  0.325873 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00863  hypothetical protein  31.4 
 
 		 300 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0772  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.62 
 
 		 312 aa  78.6  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.788078 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1006  ribosomal protein S6 modification protein  31.4 
 
 		 300 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.195269 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1999  ribosomal protein S6 modification protein, putative  28.5 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000304708  normal  0.227031 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1783  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.49 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.0099597  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0481  hypothetical protein  31.9 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0457  hypothetical protein  31.9 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0011  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.85 
 
 		 327 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1295  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.84 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00562119 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  39.17 
 
 		 282 aa  77.4  0.0000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2200  ribosomal protein S6 modification protein, putative  28.44 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1549  S6 modification enzyme RimK  29.32 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2061  S6 modification enzyme RimK  31.79 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000579629  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2480  ribosomal protein S6 modification protein  31.63 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0604  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  37.5 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1791  ribosomal protein S6 modification protein  29.69 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0545  alpha-L-glutamate ligase  37.38 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0619  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  37.5 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.875829  normal  0.913535 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00716  ribosomal protein S6 modification protein  30.29 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02302  ribosomal protein S6 modification protein  28.48 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0386  ribosomal protein S6 modification protein  29.69 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.786331  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0449  S6 modification enzyme RimK  30.65 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2724  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.41 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0438  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.37 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00025755 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3597  lysine biosynthesis enzyme LysX  29.63 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.109467 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0546  ribosomal protein S6 modification protein  37.38 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0686  SSU ribosomal protein S6P modification protein  30.62 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000259145  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0879  ribosomal protein S6 modification protein  31.4 
 
 		 300 aa  77  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2195  alpha-L-glutamate ligase  27.16 
 
 		 336 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0177868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21920  RimK-like protein  33.74 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0852539  normal  0.847097 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0912  alpha-L-glutamate ligase  28.24 
 
 		 271 aa  76.6  0.0000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.966867  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0760  ribosomal protein S6 modification protein  30.89 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00088888  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3160  ribosomal protein S6 modification protein  41.58 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1009  ribosomal protein S6 modification protein  30.92 
 
 		 300 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2039  SSU ribosomal protein S6P modification protein  30.73 
 
 		 299 aa  75.9  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.014544 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0980  ribosomal protein S6 modification protein  30.92 
 
 		 300 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0524519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  32.99 
 
 		 267 aa  75.9  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2405  alpha-L-glutamate ligase  27.53 
 
 		 338 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0279362  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>