More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2374 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2374  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
304 aa  616  1e-175  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.18 
 
 
272 aa  371  1e-102  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.210545  normal  0.706839 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.53 
 
 
261 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1466  ABC polyamine transporter, inner membrane subunit  29.11 
 
 
300 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0507128  normal  0.124115 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.11 
 
 
294 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.85 
 
 
266 aa  100  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0439251  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.67 
 
 
268 aa  99.8  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0939917  normal  0.176342 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4044  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.87 
 
 
261 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0830657  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5852  molybdenum ABC transporter permease  34.36 
 
 
261 aa  98.6  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.581419  normal  0.526214 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0385  NifC-like ABC-type porter  33.62 
 
 
266 aa  97.8  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
300 aa  95.9  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760179  normal  0.495505 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1445  NifC-like ABC-type porter  32.77 
 
 
266 aa  95.9  7e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.14 
 
 
261 aa  95.5  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104135  normal  0.640499 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1527  NifC-like ABC-type porter  32.77 
 
 
266 aa  95.1  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00122012 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.61 
 
 
265 aa  94.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.840186 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1618  NifC-like ABC-type porter  32.86 
 
 
266 aa  94.7  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.156172  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4842  putative ABC transporter inner membrane protein  29.08 
 
 
291 aa  92  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.860771  normal  0.0587965 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1457  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.9 
 
 
265 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0255754 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1503  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.05 
 
 
312 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282781  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1793  ABC transporter permease  30.39 
 
 
265 aa  89  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.849444  normal  0.0352963 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1416  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.05 
 
 
265 aa  89  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420576  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0113  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  27.6 
 
 
272 aa  88.2  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0992518  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.16 
 
 
298 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731426  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28 
 
 
263 aa  89  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.512625  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0103  putative spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  27.6 
 
 
272 aa  88.2  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.310677  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0488  ABC transporter, permease protein  37.91 
 
 
264 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4693  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.91 
 
 
264 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.4 
 
 
263 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.037786  normal  0.544332 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4199  ABC spermidine/putrescine transporter, innermembrane subunit  28.8 
 
 
263 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.853944  normal  0.687216 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.67 
 
 
298 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3075  ABC transporter, permease protein  34.64 
 
 
243 aa  86.7  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1415  ABC transporter, permease protein  35.1 
 
 
366 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146328  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1408  ABC transporter, permease protein  35.1 
 
 
366 aa  86.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.907459  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0497  ABC transporter, permease protein  35.1 
 
 
362 aa  86.7  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.675032  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1211  ABC transporter, permease protein  35.1 
 
 
362 aa  86.7  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.197633  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0656  ABC transporter, permease protein  35.1 
 
 
362 aa  86.7  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1541  ABC transporter, permease protein  35.1 
 
 
347 aa  86.3  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4341  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  34.64 
 
 
298 aa  85.9  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.801561  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2833  ABC transporter, permease protein  35.1 
 
 
410 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0920075  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.92 
 
 
551 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.48 
 
 
298 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.64 
 
 
300 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177447  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0751  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.76 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1232  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.76 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.162755  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.88 
 
 
267 aa  82.4  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1424  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.28 
 
 
213 aa  82.4  0.000000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.139435  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.8 
 
 
262 aa  81.6  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0387101  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6717  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  31.98 
 
 
280 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00799546  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3314  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.59 
 
 
262 aa  81.6  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147455  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1647  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.2 
 
 
262 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.29435 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1979  NifC-like ABC-type porter  30.05 
 
 
263 aa  80.1  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1030  binding-protein-dependent transport system,inner membrane component  25.62 
 
 
262 aa  79.7  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.24 
 
 
587 aa  77.8  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.432532 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0378  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.19 
 
 
269 aa  76.6  0.0000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3799  ornithine carbamoyltransferase  28.38 
 
 
260 aa  76.3  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2950  ABC transporter  26.15 
 
 
283 aa  76.3  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.507448  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.84 
 
 
259 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.898841  normal  0.263608 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.2 
 
 
262 aa  75.1  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.467922  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.02 
 
 
281 aa  75.5  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.360283  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3448  NifC-like ABC-type porter  32.53 
 
 
269 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2056  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.22 
 
 
256 aa  74.3  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.412786  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000664  putative permease of ABC transporter  26.86 
 
 
262 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0084  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.16 
 
 
272 aa  74.3  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0395984  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.65 
 
 
259 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2207  NifC-like ABC-type porter  30.11 
 
 
272 aa  73.2  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.57 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.17 
 
 
264 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381273  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1822  putative ABC transporter, permease protein  25.84 
 
 
282 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131569  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.7 
 
 
264 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.676109 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0820  ABC transporter, permease protein  25.84 
 
 
282 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1111  ABC transporter, permease protein  25.84 
 
 
282 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2084  ABC transporter, permease protein  25.84 
 
 
282 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.217938  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0748  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter inner membrane protein  25.7 
 
 
264 aa  72  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.467059  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.07 
 
 
260 aa  71.6  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.97 
 
 
576 aa  72  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.57335  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.26 
 
 
259 aa  71.2  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0257  NifC-like ABC-type porter  29.44 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1603  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  26.36 
 
 
265 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0185701 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1784  putative ABC transport system, membrane protein  25.84 
 
 
282 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0352  ABC transporter, permease protein  25.84 
 
 
282 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.734925  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.78 
 
 
262 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0446  ABC transporter, permease protein  25.84 
 
 
282 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.66 
 
 
579 aa  70.5  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.236914  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3881  polyamine ABC transporter, permease protein, putative  27.8 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.606059  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0327  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  29.38 
 
 
273 aa  70.1  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249986  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2805  ornithine carbamoyltransferase  25.87 
 
 
276 aa  70.1  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.465458  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0300  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  30 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2639  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.23 
 
 
262 aa  69.7  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420335  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1886  NifC-like ABC-type porter  27.81 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0754  ABC transporter, permease protein  24.45 
 
 
259 aa  69.3  0.00000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.855137  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3161  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
259 aa  69.3  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5055  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.69 
 
 
264 aa  69.3  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.429894 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1872  ABC transporter permease  26.04 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1583  NifC-like ABC-type porter  28.38 
 
 
257 aa  69.3  0.00000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.583953  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0831  ABC transporter, permease protein  24.45 
 
 
259 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.318596  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.31 
 
 
669 aa  68.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1009  ornithine carbamoyltransferase  23.75 
 
 
266 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0103  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.83 
 
 
275 aa  68.2  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3073  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.99 
 
 
284 aa  68.9  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.446798  normal  0.0908777 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2022  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.54 
 
 
299 aa  68.2  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.612103 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>