More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2056 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_2056  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
256 aa  505  9.999999999999999e-143  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.412786  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0378  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.25 
 
 
269 aa  301  9e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.75 
 
 
268 aa  206  4e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.24033  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2086  ABC-type sulfate transport system, permease component  41.53 
 
 
282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00102691  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.44 
 
 
255 aa  187  1e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0526  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.83 
 
 
272 aa  185  8e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0056  tungstate/molybdate transport system permease protein  38.81 
 
 
280 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.27 
 
 
260 aa  181  7e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.607907  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.24 
 
 
325 aa  179  2.9999999999999997e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.343545  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.39 
 
 
255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1023  tungstate/molybdate transport system permease protein  38.62 
 
 
269 aa  170  2e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.154984  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.46 
 
 
271 aa  168  9e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000135254  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3463  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.62 
 
 
275 aa  154  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00996182  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.21 
 
 
254 aa  152  5e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0650  NifC-like ABC-type porter  34.03 
 
 
270 aa  142  4e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0108436  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1320  NifC-like ABC-type porter  33.2 
 
 
287 aa  137  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0891  NifC-like ABC-type porter  30.71 
 
 
273 aa  132  7.999999999999999e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.966064  normal  0.181406 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0211  NifC-like ABC-type porter  34.04 
 
 
288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.86371  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3448  NifC-like ABC-type porter  32.85 
 
 
269 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.28 
 
 
305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.565856  normal  0.919623 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.78 
 
 
269 aa  125  5e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632399  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1979  NifC-like ABC-type porter  31.69 
 
 
263 aa  124  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1823  NifC-like ABC-type porter  34.38 
 
 
263 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1021  NifC-like ABC-type porter  35.24 
 
 
279 aa  122  4e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.884483  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0327  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.13 
 
 
273 aa  121  9e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249986  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2651  NifC-like ABC-type porter  32.18 
 
 
279 aa  121  9e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1527  NifC-like ABC-type porter  27.53 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00122012 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1886  NifC-like ABC-type porter  28.51 
 
 
265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1654  NifC-like ABC-type porter  29.84 
 
 
279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4019  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  32.81 
 
 
275 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.392742  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1445  NifC-like ABC-type porter  27.53 
 
 
266 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0385  NifC-like ABC-type porter  27.13 
 
 
266 aa  119  7e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1226  NifC-like ABC-type porter  34.12 
 
 
273 aa  119  7e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000058663 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2558  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.64 
 
 
293 aa  118  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000169531  normal  0.108126 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2546  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.48 
 
 
282 aa  118  9e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.914305 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0793  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.44 
 
 
279 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2821  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.79 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000164471  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1377  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  32.16 
 
 
275 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0257  NifC-like ABC-type porter  29.38 
 
 
270 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0506  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.15 
 
 
292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0300  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.99 
 
 
274 aa  115  6e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05726  molybdate ABC transporter permease protein  32.71 
 
 
229 aa  115  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2689  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  35.23 
 
 
269 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.549789 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1618  NifC-like ABC-type porter  34.88 
 
 
266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.156172  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3756  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  30.8 
 
 
277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2900  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.57 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1736  NifC-like ABC-type porter  32.24 
 
 
270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4088  polysaccharide export protein  31.25 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.101815 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.25 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2207  NifC-like ABC-type porter  34.81 
 
 
272 aa  113  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1134  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.7 
 
 
293 aa  113  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0664  molybdate ABC transporter permease protein  33.65 
 
 
232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1949  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.04 
 
 
259 aa  112  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2377  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  31.8 
 
 
297 aa  109  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.687907 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1397  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  31.89 
 
 
275 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.718342  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1583  NifC-like ABC-type porter  31.42 
 
 
257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.583953  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1405  NifC-like ABC-type porter  32.29 
 
 
268 aa  109  5e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.158337  normal  0.495211 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2039  NifC-like ABC-type porter  32.85 
 
 
267 aa  108  9.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1970  sulphate transport system permease protein 2:Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  29.73 
 
 
318 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.750184  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1389  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  28.83 
 
 
294 aa  107  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3445  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.27 
 
 
223 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3985  molybdate ABC transporter permease  34.59 
 
 
338 aa  107  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108268  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000118  molybdenum transport system permease protein ModB  30.84 
 
 
228 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.479773  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1376  sulfate ABC transporter permease protein CysT  31.4 
 
 
282 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3698  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.08 
 
 
226 aa  107  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1424  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
213 aa  106  4e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.139435  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1553  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  28.76 
 
 
277 aa  106  4e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1072  ABC sulfate/thiosulfate transporter, inner membrane subunit CysT  28.51 
 
 
294 aa  105  5e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.465814  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3064  molybdate ABC transporter permease protein  31.94 
 
 
228 aa  105  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3860  sulfate/molybdate ABC transporter inner membrane protein  29.02 
 
 
277 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.384915  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4180  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.02 
 
 
277 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.456448  normal  0.122933 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0121  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.6 
 
 
288 aa  105  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0105  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  27.8 
 
 
288 aa  105  8e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2478  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.17 
 
 
235 aa  104  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0972  molybdate ABC transporter permease protein  36.47 
 
 
231 aa  104  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9030  ABC-type molybdate transport system permease component-like protein  35.86 
 
 
282 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466307  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0797  molybdate ABC transporter permease protein  32.24 
 
 
240 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0548556  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02517  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  29.88 
 
 
270 aa  104  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820221  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0108  sulfate ABC transporter, permease protein  27.8 
 
 
288 aa  104  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.368477  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1667  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.92 
 
 
221 aa  104  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1270  molybdate ABC transporter permease protein  31.02 
 
 
229 aa  103  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3864  molybdate ABC transporter permease protein  30.7 
 
 
245 aa  103  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3452  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30.6 
 
 
294 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.902492 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1208  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.75 
 
 
221 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3332  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  33.33 
 
 
296 aa  103  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.845298  normal  0.297479 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0829  molybdate ABC transporter permease protein  31.31 
 
 
240 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0480615  normal  0.653671 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2788  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.88 
 
 
233 aa  103  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1855  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.25 
 
 
273 aa  102  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.174317  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1332  NifC-like ABC-type porter  24.65 
 
 
264 aa  102  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.77649  normal  0.0142467 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2733  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.42 
 
 
282 aa  102  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.160119 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5844  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  27.07 
 
 
285 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.443331  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5392  sulfate ABC transporter permease protein CysT  29.76 
 
 
285 aa  102  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.783844  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0742  molybdate ABC transporter permease protein  31.63 
 
 
245 aa  102  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00539611 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2960  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.95 
 
 
295 aa  102  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3355  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  31.46 
 
 
274 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.583255 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0781  molybdate ABC transporter permease protein  36.36 
 
 
229 aa  102  7e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205051  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2009  NifC-like ABC-type porter  28.51 
 
 
271 aa  102  7e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.744846  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3539  molybdate ABC transporter permease protein  31.78 
 
 
240 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.393524  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2747  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  31.46 
 
 
274 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2177  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.03 
 
 
226 aa  101  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000048117 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>