More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1855 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1855  cold-shock DNA-binding domain protein  100 
 
 
64 aa  129  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2850  cold-shock DNA-binding domain protein  93.75 
 
 
65 aa  124  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0339  cold-shock DNA-binding domain protein  89.06 
 
 
64 aa  116  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.219193 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3545  cold-shock DNA-binding domain protein  89.06 
 
 
64 aa  116  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0430  cold-shock DNA-binding domain protein  88.89 
 
 
64 aa  116  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1326  cold-shock DNA-binding domain protein  89.06 
 
 
64 aa  116  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.706189  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0661  cold-shock DNA-binding domain protein  90.48 
 
 
64 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.90481  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0647  cold-shock DNA-binding domain protein  88.89 
 
 
69 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2592  cold-shock DNA-binding domain protein  85.94 
 
 
64 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00103043  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0301  cold-shock DNA-binding domain protein  85.71 
 
 
64 aa  115  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2129  cold-shock DNA-binding domain protein  85.71 
 
 
64 aa  115  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1421  cold-shock DNA-binding domain protein  88.89 
 
 
64 aa  114  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0554  cold-shock DNA-binding domain protein  87.3 
 
 
64 aa  114  5e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0048  cold-shock DNA-binding domain protein  84.38 
 
 
64 aa  113  6.9999999999999995e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.152198  hitchhiker  0.00109076 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1986  cold-shock DNA-binding domain protein  84.13 
 
 
64 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.320623 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1312  cold-shock DNA-binding domain protein  82.54 
 
 
64 aa  110  5e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.632587 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1585  cold-shock DNA-binding domain protein  84.13 
 
 
64 aa  109  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1550  cold-shock DNA-binding domain protein  80.95 
 
 
64 aa  107  6e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1549  cold-shock DNA-binding domain protein  79.37 
 
 
64 aa  105  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1630  cold-shock DNA-binding domain protein  80.88 
 
 
68 aa  103  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.686511  normal  0.327142 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2827  cold-shock DNA-binding domain protein  84.13 
 
 
64 aa  96.3  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.433406  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0386  cold-shock DNA-binding domain protein  75 
 
 
78 aa  94.7  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.659141  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2828  cold-shock DNA-binding domain protein  79.37 
 
 
64 aa  92  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.272905  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3576  cold-shock DNA-binding domain protein  80.95 
 
 
64 aa  92  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2053  cold-shock DNA-binding domain protein  53.12 
 
 
67 aa  71.2  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.203977  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1440  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  43.94 
 
 
67 aa  67.4  0.00000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1131  cold-shock DNA-binding domain protein  51.56 
 
 
67 aa  67.4  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.294478 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0493  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.45 
 
 
66 aa  67.4  0.00000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.156279  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6014  cold-shock DNA-binding protein family protein  46.88 
 
 
67 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1055  cold-shock DNA-binding protein family protein  50 
 
 
67 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.481948  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0368  cold-shock DNA-binding domain protein  50 
 
 
68 aa  65.1  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  2.16983e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0252  cold-shock DNA-binding protein family protein  46.97 
 
 
67 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.994476  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0262  cold-shock DNA-binding domain protein  46.97 
 
 
67 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07120  cold-shock DNA-binding protein family  51.56 
 
 
67 aa  65.1  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.976007  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1251  cold-shock DNA-binding domain protein  43.94 
 
 
67 aa  65.5  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.791861  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0273  cold-shock DNA-binding domain protein  46.97 
 
 
67 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2466  cold shock-like transcription regulator protein  46.88 
 
 
67 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.4868  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0172  cold-shock DNA-binding domain protein  46.15 
 
 
67 aa  64.3  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000163048  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6028  cold-shock DNA-binding protein family protein  45.31 
 
 
67 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4276  cold-shock DNA-binding domain protein  44.62 
 
 
67 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1267  cold-shock DNA-binding domain protein  49.23 
 
 
67 aa  64.3  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.922504  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4386  cold-shock DNA-binding domain protein  44.62 
 
 
67 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2140  cold-shock DNA-binding protein family protein  43.94 
 
 
67 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000000648799  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2503  cold-shock DNA-binding protein family protein  46.88 
 
 
68 aa  63.9  0.0000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000079429  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2494  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  46.88 
 
 
67 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.170049  decreased coverage  0.000196654 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0521  Cold-shock protein DNA-binding protein  50 
 
 
79 aa  63.5  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.49245  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0273  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  44.78 
 
 
67 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.355642 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3637  putative cold-shock DNA-binding domain protein  48.44 
 
 
67 aa  63.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2681  cold-shock DNA-binding domain protein  46.88 
 
 
67 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114675  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3093  cold-shock DNA-binding protein family protein  45.31 
 
 
72 aa  63.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.475725  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2588  cold-shock DNA-binding domain protein  46.88 
 
 
67 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.110334  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2246  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  43.75 
 
 
67 aa  63.5  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000157436  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1274  cold-shock DNA-binding protein family protein  46.88 
 
 
67 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5230  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  46.88 
 
 
67 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244858  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2426  cold-shock DNA-binding domain protein  50 
 
 
67 aa  63.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386206  normal  0.184038 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5269  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  46.88 
 
 
67 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0859722 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4269  cold-shock DNA-binding protein family protein  48.44 
 
 
67 aa  63.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2965  cold-shock DNA-binding domain protein  44.62 
 
 
68 aa  62  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000138264 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2951  cold-shock DNA-binding protein family protein  43.75 
 
 
77 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.15288  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01731  hypothetical protein  44.62 
 
 
68 aa  62.4  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6907  cold-shock DNA-binding domain protein  43.75 
 
 
67 aa  62  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240211  normal  0.394944 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1049  cold-shock DNA-binding domain protein  48.44 
 
 
67 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1466  cold-shock DNA-binding domain protein  48.44 
 
 
67 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00122582  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0573  Cold-shock protein DNA-binding protein  46.88 
 
 
67 aa  61.6  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0103  cold-shock DNA-binding domain protein  48.44 
 
 
67 aa  62  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0988  cold-shock DNA-binding protein family protein  48.44 
 
 
67 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2129  cold-shock DNA-binding domain protein  50 
 
 
69 aa  61.6  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0306  cold shock domain-contain protein  45.16 
 
 
70 aa  61.6  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.751232  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1045  cold-shock DNA-binding domain protein  48.44 
 
 
67 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.396466  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000590  cold shock protein CspA  46.03 
 
 
69 aa  61.6  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00446829  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4117  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  46.88 
 
 
67 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.327381  normal  0.21845 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0073  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  48.44 
 
 
67 aa  62  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.621224  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1053  cold shock-like transcription regulator protein  43.75 
 
 
67 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.470883  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1750  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.31 
 
 
67 aa  61.6  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0957427  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1465  cold-shock DNA-binding domain protein  45.31 
 
 
67 aa  61.6  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.000499386  normal  0.887495 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0855  cold-shock DNA-binding protein family protein  43.75 
 
 
68 aa  61.6  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.563444  normal  0.445485 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3948  cold-shock DNA-binding domain protein  46.15 
 
 
67 aa  61.6  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4798  cold-shock DNA-binding protein family protein  45.31 
 
 
67 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1392  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.31 
 
 
67 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.124556  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0472  cold-shock DNA-binding protein family protein  46.88 
 
 
67 aa  61.6  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.16014  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3292  cold-shock DNA-binding domain protein  46.88 
 
 
67 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.0070619  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4884  cold-shock DNA-binding protein family protein  45.31 
 
 
67 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.71911  normal  0.101787 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5398  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.31 
 
 
67 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.262283  normal  0.0908383 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0641  cold-shock DNA-binding domain protein  46.88 
 
 
67 aa  61.6  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5184  cold-shock DNA-binding protein family protein  45.31 
 
 
67 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427326 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1189  cold shock protein CspE  44.44 
 
 
69 aa  61.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5227  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  46.88 
 
 
67 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.54507  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3366  cold-shock DNA-binding domain protein  46.88 
 
 
67 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2221  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  44.78 
 
 
66 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000348612  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0567  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  42.19 
 
 
68 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.0000000000101913  hitchhiker  0.000143899 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2894  cold-shock DNA-binding protein family protein  45.31 
 
 
69 aa  60.8  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.620309 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1111  cold shock transcriptional regulator CspA  45.16 
 
 
70 aa  60.8  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0174  cold-shock DNA-binding protein family protein  43.94 
 
 
65 aa  60.8  0.000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000215085  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4566  putative cold-shock DNA-binding domain protein  46.15 
 
 
67 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.0641574 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0387  cold-shock DNA-binding domain protein  48.44 
 
 
67 aa  60.8  0.000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000327706  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1740  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  44.62 
 
 
70 aa  60.5  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.183326  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2295  cold-shock DNA-binding protein family protein  46.15 
 
 
67 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.904352  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3214  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  46.97 
 
 
67 aa  60.5  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0979697  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2342  cold-shock DNA-binding protein family protein  46.15 
 
 
67 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2334  cold-shock DNA-binding protein family protein  46.15 
 
 
67 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.213577  normal  0.0207687 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>