More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3600 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0518  malonyl-CoA synthase  68.94 
 
 		 509 aa  668    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0574  malonyl-CoA synthase  67.02 
 
 		 504 aa  642    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7251  malonyl-CoA synthase  67.55 
 
 		 507 aa  670    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0802  malonyl-CoA synthase  66.53 
 
 		 510 aa  651    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.756606  normal  0.0286315 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2797  malonyl-CoA synthase  84.06 
 
 		 518 aa  860    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6034  malonyl-CoA synthase  67.14 
 
 		 507 aa  665    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224104  normal  0.165563 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0836  malonyl-CoA synthase  65.78 
 
 		 510 aa  654    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.141452  normal  0.0577882 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0220  malonyl-CoA synthase  79.72 
 
 		 503 aa  804    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.601636  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0329  malonyl-CoA synthase  77.53 
 
 		 511 aa  776    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1480  malonyl-CoA synthase  65.69 
 
 		 509 aa  639    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000189244 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0245  malonyl-CoA synthase  77.58 
 
 		 504 aa  764    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0395238 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0483  malonyl-CoA synthase  80.12 
 
 		 503 aa  801    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3600  malonyl-CoA synthase  100 
 
 		 505 aa  1026    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0616  malonyl-CoA synthase  67.15 
 
 		 504 aa  639    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.562715  normal  0.268093 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0226  malonyl-CoA synthase  80.72 
 
 		 508 aa  830    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0526846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1586  malonyl-CoA synthase  66.46 
 
 		 506 aa  639    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0876  malonyl-CoA synthase  65.99 
 
 		 510 aa  656    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5138  malonyl-CoA synthase  68.34 
 
 		 510 aa  682    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809655  normal  0.695279 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1719  malonyl-CoA synthase  68.53 
 
 		 503 aa  687    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  65.93 
 
 		 504 aa  657    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3408  malonyl-CoA synthase  58.37 
 
 		 504 aa  591  1e-167  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.787784 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2999  malonyl-CoA synthase  59.49 
 
 		 506 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3834  malonyl-CoA synthase  54.98 
 
 		 504 aa  559  1e-158  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.610168  normal  0.151644 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2492  malonyl-CoA synthase  57.29 
 
 		 504 aa  555  1e-157  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.318474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3566  malonyl-CoA synthase  62.17 
 
 		 503 aa  557  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.676985  normal  0.895128 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1041  malonyl-CoA synthase  54.58 
 
 		 501 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2702  malonyl-CoA synthase  53.78 
 
 		 501 aa  536  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0670195 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2794  malonyl-CoA synthase  55.88 
 
 		 517 aa  535  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.71549  normal  0.398408 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2790  malonyl-CoA synthase  57.44 
 
 		 512 aa  535  1e-151  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2870  malonyl-CoA synthase  56.26 
 
 		 506 aa  528  1e-149  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689672  normal  0.236454 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2771  malonyl-CoA synthase  54.56 
 
 		 536 aa  528  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.594073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0422  malonyl-CoA synthase  55.17 
 
 		 526 aa  525  1e-148  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2094  malonyl-CoA synthase  54.83 
 
 		 506 aa  524  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0754737  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0996  malonyl-CoA synthase  56.22 
 
 		 519 aa  519  1e-146  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2538  malonyl-CoA synthase  53.56 
 
 		 511 aa  517  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1080  malonyl-CoA synthase  56.22 
 
 		 519 aa  518  1.0000000000000001e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0648  malonyl-CoA synthase  55.3 
 
 		 517 aa  512  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  55.74 
 
 		 501 aa  513  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1515  malonyl-CoA synthase  52.68 
 
 		 539 aa  511  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624521  normal  0.177064 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1293  malonyl-CoA synthase  54.35 
 
 		 510 aa  500  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112545 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1925  malonyl-CoA synthase  55.42 
 
 		 500 aa  498  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1101  malonyl-CoA synthase  52.65 
 
 		 530 aa  489  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0631  malonyl-CoA synthase  52.28 
 
 		 507 aa  489  1e-137  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2752  malonyl-CoA synthase  52.22 
 
 		 547 aa  489  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0433908 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3119  malonyl-CoA synthase  53.88 
 
 		 485 aa  472  1e-132  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.646837  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  41.79 
 
 		 502 aa  350  4e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  41.98 
 
 		 507 aa  344  2e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  41.32 
 
 		 504 aa  340  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  37.7 
 
 		 507 aa  297  3e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.73 
 
 		 514 aa  292  1e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2136  AMP-dependent synthetase and ligase  34.92 
 
 		 493 aa  289  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2184  AMP-dependent synthetase and ligase  34.92 
 
 		 493 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.944129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  37.22 
 
 		 508 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  36.93 
 
 		 516 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1330  AMP-dependent synthetase and ligase  36.53 
 
 		 502 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.982491 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.4 
 
 		 512 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0297  AMP-dependent synthetase and ligase  37.53 
 
 		 498 aa  281  1e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  37.47 
 
 		 510 aa  278  2e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  36.81 
 
 		 508 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0079  AMP-dependent synthetase and ligase  36.42 
 
 		 553 aa  275  2.0000000000000002e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.737985 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.14 
 
 		 510 aa  274  3e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1553  AMP-dependent synthetase and ligase  34.5 
 
 		 495 aa  273  4.0000000000000004e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.215812  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.94 
 
 		 510 aa  273  6e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.68 
 
 		 510 aa  272  9e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  35.73 
 
 		 508 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.38 
 
 		 513 aa  271  2e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.68 
 
 		 510 aa  271  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.47 
 
 		 510 aa  270  5e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.74 
 
 		 510 aa  270  5e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  35.19 
 
 		 518 aa  270  5e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.47 
 
 		 510 aa  270  5e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.74 
 
 		 510 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.54 
 
 		 510 aa  269  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.47 
 
 		 510 aa  268  1e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  34.4 
 
 		 521 aa  268  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  34.81 
 
 		 512 aa  265  1e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  37.53 
 
 		 508 aa  265  1e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  33.54 
 
 		 539 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6769  AMP-dependent synthetase and ligase  37.97 
 
 		 507 aa  263  6e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147424  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2474  AMP-dependent synthetase and ligase  35.83 
 
 		 522 aa  263  8e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  34.85 
 
 		 505 aa  262  1e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6735  AMP-dependent synthetase and ligase  36.83 
 
 		 503 aa  259  7e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2335  AMP-dependent synthetase and ligase  37.45 
 
 		 509 aa  258  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  37.09 
 
 		 529 aa  258  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  35.05 
 
 		 499 aa  257  4e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.2 
 
 		 510 aa  257  4e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  34.8 
 
 		 527 aa  256  6e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  32.93 
 
 		 508 aa  256  6e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  36.84 
 
 		 5154 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  33.14 
 
 		 520 aa  255  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3638  AMP-dependent synthetase and ligase  32.36 
 
 		 543 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  33.07 
 
 		 569 aa  254  2.0000000000000002e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22810  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  34.38 
 
 		 500 aa  254  2.0000000000000002e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  37.58 
 
 		 510 aa  254  3e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  34.06 
 
 		 499 aa  254  3e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21680  acyl-CoA synthetase  37.4 
 
 		 480 aa  253  4.0000000000000004e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.656623 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  32.37 
 
 		 518 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00562  peroxisomal AMP binding enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11340)  34.52 
 
 		 533 aa  253  6e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  32.85 
 
 		 513 aa  253  6e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.92 
 
 		 525 aa  252  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>