135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1012 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1012  phage tail Collar  100 
 
 		 176 aa  355  2.9999999999999997e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0947871  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03557  microcystin dependent protein  51.65 
 
 		 181 aa  179  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3286  phage tail Collar  48.59 
 
 		 168 aa  164  9e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2682  phage tail collar domain-containing protein  46.63 
 
 		 169 aa  161  5.0000000000000005e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0278651  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4880  Tail Collar domain protein  48.65 
 
 		 181 aa  154  9e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382325  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2684  phage tail collar domain-containing protein  48.28 
 
 		 171 aa  153  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0111921  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3328  UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl- meso-diaminopimelate ligase  45.36 
 
 		 169 aa  151  5e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435703 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4954  tail collar domain-containing protein  47.43 
 
 		 171 aa  150  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3488  tail collar domain-containing protein  45.7 
 
 		 182 aa  149  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353729  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2641  phage tail collar domain-containing protein  47.4 
 
 		 195 aa  148  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.262211 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3173  tail collar domain-containing protein  44.51 
 
 		 179 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0996292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1336  Tail Collar domain protein  44.13 
 
 		 169 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3287  phage tail Collar  43.75 
 
 		 172 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0737  Tail Collar domain protein  47.16 
 
 		 167 aa  143  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0736  Tail Collar domain protein  43.43 
 
 		 172 aa  142  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4953  tail collar domain-containing protein  45.81 
 
 		 165 aa  142  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294288  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2607  Tail Collar domain protein  42.7 
 
 		 175 aa  141  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0184  microcystin dependent protein  44.44 
 
 		 183 aa  141  5e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1917  phage tail collar domain-containing protein  46.15 
 
 		 176 aa  138  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.319876  hitchhiker  0.0068131 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2328  hypothetical protein  44.25 
 
 		 199 aa  138  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00000000740366  normal  0.751095 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3490  tail collar domain-containing protein  44.51 
 
 		 178 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1292  Tail Collar domain protein  44.94 
 
 		 167 aa  138  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.640114 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4988  tail collar domain-containing protein  45.56 
 
 		 163 aa  137  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1098  tail collar domain-containing protein  40.74 
 
 		 183 aa  137  7.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.958881  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1455  Phage tail Collar  45 
 
 		 186 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.349612  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3326  forkhead-associated  43.33 
 
 		 176 aa  135  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3288  phage tail Collar  44.69 
 
 		 175 aa  135  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.890287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4989  tail collar domain-containing protein  45.81 
 
 		 173 aa  136  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1338  Tail Collar domain protein  40.91 
 
 		 173 aa  135  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3327  phenylacrylic acid decarboxylase  40 
 
 		 174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449816 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1337  Tail Collar domain protein  41.14 
 
 		 171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1349  phage tail collar domain-containing protein  39.34 
 
 		 181 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2009  Tail Collar domain protein  44.79 
 
 		 189 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.410779  normal  0.314034 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2640  phage tail collar domain-containing protein  42.44 
 
 		 199 aa  132  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.167373 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1982  Tail Collar domain protein  44.79 
 
 		 189 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0185  microcystin dependent protein  42.22 
 
 		 176 aa  130  9e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0165  phage tail collar domain-containing protein  43.84 
 
 		 199 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0735  Tail Collar domain protein  46.67 
 
 		 173 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0169  tail collar domain-containing protein  42.65 
 
 		 199 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0939231 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2455  phage tail Collar  39.44 
 
 		 176 aa  128  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5803  tail collar domain-containing protein  44.32 
 
 		 180 aa  129  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444578 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1099  tail collar domain-containing protein  40 
 
 		 179 aa  129  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4190  phage tail collar domain-containing protein  43.35 
 
 		 199 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3551  phage tail collar domain-containing protein  43.14 
 
 		 199 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2872  microcystin dependent  43.96 
 
 		 179 aa  128  5.0000000000000004e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000497886 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2683  phage tail collar domain-containing protein  42.33 
 
 		 163 aa  127  9.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0312734  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1097  tail collar domain-containing protein  41.94 
 
 		 181 aa  126  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.340787  normal  0.740743 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2609  Tail Collar domain protein  44.02 
 
 		 170 aa  126  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.247685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2329  hypothetical protein  39.66 
 
 		 197 aa  124  9e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000218448  normal  0.931598 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2454  phage tail Collar  43.18 
 
 		 165 aa  122  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.45663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1014  phage tail Collar  40.34 
 
 		 180 aa  122  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00907435  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4424  hypothetical protein  41.94 
 
 		 181 aa  121  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4955  tail collar domain-containing protein  37.29 
 
 		 170 aa  122  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0118  hypothetical protein  40 
 
 		 173 aa  121  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.595481 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1668  phage tail collar domain-containing protein  37.19 
 
 		 196 aa  121  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000114685  normal  0.438569 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4253  tail collar domain-containing protein  39.91 
 
 		 207 aa  121  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0588212  normal  0.934019 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0186  microcystin dependent protein  40.54 
 
 		 181 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4987  tail collar domain-containing protein  38.36 
 
 		 157 aa  120  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4899  Tail Collar domain protein  40.64 
 
 		 183 aa  120  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142286  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0116  hypothetical protein  39.68 
 
 		 182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.964945  normal  0.411116 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2453  phage tail Collar  36.93 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.661314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1348  phage tail collar domain-containing protein  40 
 
 		 205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3729  phage tail Collar  41.29 
 
 		 198 aa  117  9e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0351559  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0155  Phage tail Collar  41.41 
 
 		 195 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5865  Tail Collar domain protein  40.7 
 
 		 196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4900  Tail Collar domain protein  38.54 
 
 		 192 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.129965  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1293  Tail Collar domain protein  41.48 
 
 		 172 aa  114  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03558  microcystin dependent protein  42.13 
 
 		 175 aa  114  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5802  tail collar domain-containing protein  42.61 
 
 		 166 aa  114  6.9999999999999995e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435853 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1013  phage tail Collar  39.56 
 
 		 176 aa  114  8.999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0295632  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1453  Phage tail Collar  38.62 
 
 		 187 aa  112  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4047  phage tail collar domain-containing protein  38.67 
 
 		 180 aa  111  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1294  Tail Collar domain protein  37.43 
 
 		 173 aa  111  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.911705 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1454  Phage tail Collar  35.71 
 
 		 178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.809591  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5801  tail collar domain-containing protein  38.76 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334192 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0117  hypothetical protein  38.76 
 
 		 177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  0.412841 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0053  phage tail collar domain-containing protein  35.07 
 
 		 209 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03559  microcystin dependent protein  37.63 
 
 		 178 aa  109  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.536453  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1350  phage tail collar domain-containing protein  34.81 
 
 		 177 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2608  Tail Collar domain protein  35.09 
 
 		 170 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4898  Tail Collar domain protein  34.57 
 
 		 184 aa  105  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.705005  normal  0.283437 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5866  Tail Collar domain protein  39.9 
 
 		 195 aa  103  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255471  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5259  hypothetical protein  35.4 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0135116  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0674  tail collar domain-containing protein  37.19 
 
 		 195 aa  100  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.855114  hitchhiker  0.003962 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1669  phage tail collar domain-containing protein  33.65 
 
 		 206 aa  97.1  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000343584  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6119  Tail Collar domain protein  43.18 
 
 		 172 aa  97.1  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3002  phage tail Collar  32.24 
 
 		 210 aa  95.5  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.592982 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4048  phage tail collar domain-containing protein  42.94 
 
 		 179 aa  87.4  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4767  phage tail collar domain-containing protein  65 
 
 		 80 aa  84.3  8e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.428551 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0167  phage tail collar domain-containing protein  35.81 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4046  phage tail collar domain-containing protein  43.65 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4722  phage tail collar domain-containing protein  59.32 
 
 		 80 aa  76.3  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4235  phage tail collar domain-containing protein  29.7 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.296558  normal  0.173151 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0391  Tail Collar domain protein  37.96 
 
 		 304 aa  75.1  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.360825  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4236  phage tail collar domain-containing protein  28.71 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.290715  normal  0.365652 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1749  Tail Collar domain protein  36.22 
 
 		 261 aa  72  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0481  Tail Collar domain protein  45.24 
 
 		 308 aa  72  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0480  Tail Collar domain protein  44.71 
 
 		 310 aa  71.6  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2491  Tail Collar domain protein  53.23 
 
 		 80 aa  68.2  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0754  phage tail collar domain-containing protein  53.23 
 
 		 80 aa  67.4  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0440878  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>