More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4556 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4556  putative cytochrome P450  100 
 
 		 442 aa  891    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4420  putative cytochrome P450  46.35 
 
 		 440 aa  317  3e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.968326  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4334  putative cytochrome P450  36.8 
 
 		 484 aa  257  3e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.686964 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4583  putative cytochrome P450  35.8 
 
 		 471 aa  237  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2751  putative cytochrome P450-family protein  36.25 
 
 		 426 aa  225  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.581871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1747  putative cytochrome P450  36 
 
 		 454 aa  224  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0264528  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2803  putative cytochrome P450-family protein  33.92 
 
 		 414 aa  216  7e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.348302  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33530  cytochrome P450  33.77 
 
 		 410 aa  215  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.101916  normal  0.234343 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2975  putative cytochrome P450  33.64 
 
 		 452 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1433  Cytochrome P450-like protein  35.52 
 
 		 424 aa  212  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.667112  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4184  cytochrome P450 monooxygenase  36.06 
 
 		 406 aa  194  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.1685  normal  0.411679 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4812  cytochrome P450-family protein  31.34 
 
 		 446 aa  185  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2597  Cytochrome P450  35.38 
 
 		 500 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0573143  normal  0.048774 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5491  putative cytochrome P450  35.32 
 
 		 488 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.767325  normal  0.292754 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1142  putative cytochrome P450  32.41 
 
 		 421 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5490  putative cytochrome P450  29.98 
 
 		 437 aa  166  9e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0347822  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3959  Cytochrome P450-like protein  29.62 
 
 		 465 aa  155  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2724  cytochrome P450  30.35 
 
 		 409 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.118546  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6983  cytochrome P450-family protein  29.82 
 
 		 416 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.355238 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1748  cytochrome P450-family protein  30.5 
 
 		 373 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.794769  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  26.7 
 
 		 410 aa  126  7e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  27.52 
 
 		 411 aa  126  9e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4555  cytochrome P450  32.22 
 
 		 366 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2802  putative cytochrome P450  27.2 
 
 		 409 aa  125  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4949  cytochrome P450  26.94 
 
 		 412 aa  124  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2750  cytochrome P450  28.92 
 
 		 416 aa  123  8e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1432  cytochrome P450  30.64 
 
 		 408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.675359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  31.41 
 
 		 411 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4185  cytochrome P450  27.91 
 
 		 412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059363  normal  0.410694 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  28.15 
 
 		 405 aa  116  8.999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  29.38 
 
 		 396 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  28.06 
 
 		 400 aa  114  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  28.46 
 
 		 419 aa  114  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  30.56 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  29.48 
 
 		 410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  23.65 
 
 		 420 aa  111  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  27.48 
 
 		 398 aa  110  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  26.15 
 
 		 399 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8715  cytochrome P450-family protein  28.12 
 
 		 409 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  28.54 
 
 		 436 aa  106  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  27.83 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0512  cytochrome P450  27.2 
 
 		 398 aa  104  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.13559  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  28.19 
 
 		 400 aa  103  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  29.03 
 
 		 400 aa  103  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  26.71 
 
 		 426 aa  103  7e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2024  cytochrome P450  30.18 
 
 		 424 aa  103  9e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00720801  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  23.66 
 
 		 411 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  28.8 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  26.72 
 
 		 436 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  28.42 
 
 		 407 aa  101  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  23.49 
 
 		 411 aa  101  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  22.94 
 
 		 411 aa  101  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4902  cytochrome P450  31.32 
 
 		 376 aa  100  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  31.72 
 
 		 423 aa  100  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  27.34 
 
 		 417 aa  100  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3533  cytochrome P450  27.54 
 
 		 432 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0869  cytochrome P450  27.32 
 
 		 415 aa  100  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610072  normal  0.98941 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4427  cytochrome P450  31.32 
 
 		 382 aa  100  7e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  27.79 
 
 		 401 aa  99.8  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  27.81 
 
 		 417 aa  98.2  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  23.84 
 
 		 411 aa  97.4  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3776  cytochrome P450  26.21 
 
 		 413 aa  97.4  5e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  26.59 
 
 		 407 aa  97.1  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3059  cytochrome P450  26.38 
 
 		 417 aa  96.7  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.222659  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  26.75 
 
 		 401 aa  96.7  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2116  cytochrome P450  32.78 
 
 		 389 aa  95.9  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0425  cytochrome P450  27.92 
 
 		 406 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0314572  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2115  cytochrome P450  32.17 
 
 		 430 aa  95.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3600  cytochrome P450  27.72 
 
 		 402 aa  95.5  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5282  cytochrome P450  25.61 
 
 		 424 aa  94  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2976  cytochrome P450-family protein  26 
 
 		 367 aa  94.4  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  27.6 
 
 		 413 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  27.46 
 
 		 414 aa  94.4  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2832  cytochrome P450  27.44 
 
 		 402 aa  94  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.738798 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  24.76 
 
 		 407 aa  93.2  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  28.92 
 
 		 399 aa  93.2  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  28.13 
 
 		 418 aa  93.2  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  27.14 
 
 		 412 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0246  cytochrome P450  29.15 
 
 		 406 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463204  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  28.26 
 
 		 414 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3576  cytochrome P450  26.89 
 
 		 439 aa  92.8  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  26.24 
 
 		 399 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  27.97 
 
 		 402 aa  92.4  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  27.64 
 
 		 404 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  26.37 
 
 		 407 aa  91.3  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  25.31 
 
 		 408 aa  90.9  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  26.12 
 
 		 412 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5013  cytochrome P450  26.75 
 
 		 404 aa  90.9  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4631  cytochrome P450  26.75 
 
 		 404 aa  90.5  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4719  cytochrome P450  26.75 
 
 		 404 aa  90.5  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  27.01 
 
 		 403 aa  90.1  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  26.72 
 
 		 398 aa  89.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3656  cytochrome P450  28.12 
 
 		 418 aa  89  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300661  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  25.14 
 
 		 405 aa  89.4  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  25.75 
 
 		 412 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  23.17 
 
 		 411 aa  89  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  27.98 
 
 		 410 aa  88.6  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5217  cytochrome P450  26.16 
 
 		 402 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17810  cytochrome P450  23.28 
 
 		 423 aa  87.4  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.859475 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1541  cytochrome P450  25.53 
 
 		 403 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>