More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1887 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2636  excinuclease ABC, A subunit  56.59 
 
 		 838 aa  891    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1887  excinuclease ABC, A subunit  100 
 
 		 776 aa  1547    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.72737 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03329  putative excinuclease ABC subunit A  49.52 
 
 		 834 aa  809    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3087  excinuclease ABC subunit A  57.07 
 
 		 838 aa  904    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5800  ABC transporter related  52.73 
 
 		 899 aa  797    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.177592  normal  0.587186 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3664  excinuclease ABC, A subunit  58.79 
 
 		 832 aa  928    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19620  excinuclease ABC, A subunit  58.14 
 
 		 863 aa  898    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4722  excinuclease ABC, A subunit  57.06 
 
 		 861 aa  904    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286456  normal  0.774067 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0838  excinuclease ABC, A subunit  56.55 
 
 		 844 aa  900    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503748  normal  0.281681 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5906  excinuclease ABC subunit A  54.31 
 
 		 897 aa  886    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2496  excinuclease ABC, A subunit  57.04 
 
 		 838 aa  892    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3139  excinuclease ABC subunit A  55.36 
 
 		 877 aa  917    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0102  excinuclease ABC, A subunit  55.78 
 
 		 894 aa  865    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6072  ABC transporter related  58.64 
 
 		 827 aa  875    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0951  ABC transporter related  62.21 
 
 		 833 aa  930    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.321909 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0918  excinuclease ABC subunit A  53.66 
 
 		 899 aa  840    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2009  excinuclease ABC, A subunit  55.66 
 
 		 880 aa  840    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0866  excinuclease ABC, A subunit  56.93 
 
 		 853 aa  906    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.249589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6320  excinuclease ABC, A subunit  53.7 
 
 		 885 aa  858    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.687364  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4773  excinuclease ABC, A subunit  56.25 
 
 		 850 aa  893    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.235666  normal  0.0143445 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3073  excinuclease ABC, A subunit  54.79 
 
 		 950 aa  889    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0673699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0603  ABC transporter related  59.95 
 
 		 848 aa  924    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100941  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1839  excinuclease ABC, A subunit  54.88 
 
 		 822 aa  871    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0151  ABC transporter related  54.71 
 
 		 898 aa  861    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.160582 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05010  Excinuclease ATPase subunit  52.21 
 
 		 875 aa  723    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0906  excinuclease ABC, A subunit  59.81 
 
 		 860 aa  938    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1904  excinuclease ABC, A subunit  60.56 
 
 		 843 aa  926    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000110525 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3676  excinuclease ABC subunit A  64.65 
 
 		 880 aa  639    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.090284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0207  ABC transporter related  54.6 
 
 		 898 aa  859    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.328362  normal  0.710281 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6311  excinuclease ABC, A subunit  57.06 
 
 		 843 aa  936    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.420844  normal  0.88955 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0616  ABC transporter related  59.95 
 
 		 848 aa  924    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2085  excinuclease ABC, A subunit  59.16 
 
 		 851 aa  896    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.56515 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2123  excinuclease ABC, A subunit  55.23 
 
 		 944 aa  842    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429692 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4737  excinuclease ABC, A subunit  53.08 
 
 		 881 aa  824    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2778  excinuclease ABC, A subunit  56.88 
 
 		 838 aa  878    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0742019  normal  0.349743 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0594  ABC transporter related  60.31 
 
 		 848 aa  929    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.43104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1787  ABC transporter related  65.18 
 
 		 845 aa  633  1e-180  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184754  normal  0.778498 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13060  Excinuclease ABC subunit A  48.16 
 
 		 968 aa  613  9.999999999999999e-175  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2024  excinuclease ABC subunit A  49.56 
 
 		 945 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136428  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1999  excinuclease ABC subunit A  48.68 
 
 		 946 aa  598  1e-169  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0576024  normal  0.88061 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2191  excinuclease ABC, A subunit  49.26 
 
 		 946 aa  591  1e-167  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.109423  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0337  excinuclease ABC subunit A  43.57 
 
 		 939 aa  591  1e-167  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3339  excinuclease ABC subunit A  48.19 
 
 		 987 aa  586  1e-166  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.535422  hitchhiker  0.000450974 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1109  excinuclease ABC subunit A  47.65 
 
 		 947 aa  586  1e-166  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.57709  normal  0.229428 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0329  excinuclease ABC subunit A  43.13 
 
 		 939 aa  584  1.0000000000000001e-165  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1437  excinuclease ABC, A subunit  44.66 
 
 		 942 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3111  excinuclease ABC subunit A  47.75 
 
 		 987 aa  579  1e-164  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400929  normal  0.194384 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0976  excinuclease ABC subunit A  44.87 
 
 		 931 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.177637  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3018  excinuclease ABC, A subunit  48.53 
 
 		 948 aa  575  1.0000000000000001e-162  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.244171  normal  0.490973 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1422  excinuclease ABC, A subunit  46.32 
 
 		 963 aa  573  1.0000000000000001e-162  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0151035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6045  excinuclease ABC subunit A  47.78 
 
 		 946 aa  575  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.834052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0885  excinuclease ABC, A subunit  46.39 
 
 		 947 aa  575  1.0000000000000001e-162  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2524  excinuclease ABC subunit A  46.76 
 
 		 1019 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.247426  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0411  excinuclease ABC, A subunit  46.07 
 
 		 957 aa  574  1.0000000000000001e-162  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2119  excinuclease ABC, A subunit  43.34 
 
 		 942 aa  571  1e-161  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000168396  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0294  excinuclease ABC, A subunit  48.3 
 
 		 946 aa  570  1e-161  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2851  excinuclease ABC, A subunit  47.98 
 
 		 960 aa  571  1e-161  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.149004  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2710  excinuclease ABC subunit A  43.26 
 
 		 1008 aa  567  1e-160  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00698098 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1949  excinuclease ABC, A subunit  49.78 
 
 		 957 aa  568  1e-160  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0876147  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2422  excinuclease ABC, A subunit  47.83 
 
 		 952 aa  568  1e-160  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1542  excinuclease ABC, A subunit  47.82 
 
 		 965 aa  565  1e-160  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.464882  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2178  excinuclease ABC subunit A  47.97 
 
 		 965 aa  568  1e-160  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1322  excinuclease ABC, A subunit  45.33 
 
 		 934 aa  568  1e-160  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0124703  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11654  excinuclease ABC subunit A  48.25 
 
 		 972 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.550141 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0816  excinuclease ABC, A subunit  44.86 
 
 		 983 aa  565  1.0000000000000001e-159  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1053  excinuclease ABC, A subunit  43.39 
 
 		 927 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00826345  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3548  excinuclease ABC subunit A  47.31 
 
 		 967 aa  564  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.658203  normal  0.309926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2988  excinuclease ABC subunit A  47.19 
 
 		 973 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10450  Excinuclease ABC subunit A  44.84 
 
 		 960 aa  563  1.0000000000000001e-159  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0436929  hitchhiker  0.0000000651145 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3032  excinuclease ABC subunit A  47.19 
 
 		 973 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.69865 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3339  excinuclease ABC subunit A  47.61 
 
 		 967 aa  564  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818177 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3003  excinuclease ABC subunit A  47.19 
 
 		 973 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.855569  normal  0.034696 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1158  excinuclease ABC subunit A  43.35 
 
 		 941 aa  561  1e-158  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1084  excinuclease ABC, A subunit  44.13 
 
 		 936 aa  560  1e-158  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.293507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0168  excinuclease ABC subunit A  43.9 
 
 		 921 aa  560  1e-158  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0374  excinuclease ABC subunit A  43.7 
 
 		 952 aa  560  1e-158  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0260  excinuclease ABC, A subunit  44.08 
 
 		 947 aa  562  1e-158  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0669187  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0311  excinuclease ABC subunit A  46.17 
 
 		 942 aa  560  1e-158  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00463978  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20120  Excinuclease ABC subunit A  48.59 
 
 		 982 aa  555  1e-157  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.578838  normal  0.503443 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16220  excinuclease ABC, A subunit  43.84 
 
 		 941 aa  557  1e-157  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.266346  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3065  excinuclease ABC, A subunit  44.66 
 
 		 956 aa  556  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000246359  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1750  excinuclease ABC, A subunit  42.01 
 
 		 951 aa  556  1e-157  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.173115 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1631  excinuclease ABC subunit A  47.87 
 
 		 976 aa  556  1e-157  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.978501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2016  excinuclease ABC subunit A  48.3 
 
 		 923 aa  558  1e-157  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3956  excinuclease ABC, A subunit  46.53 
 
 		 963 aa  555  1e-156  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000293672  hitchhiker  0.00020375 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2038  excinuclease ABC, A subunit  46.91 
 
 		 963 aa  555  1e-156  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225095  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1820  excinuclease ABC subunit A  46.52 
 
 		 973 aa  553  1e-156  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137397 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1251  excinuclease ABC subunit A  47.56 
 
 		 971 aa  553  1e-156  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2057  excinuclease ABC subunit A  46.91 
 
 		 965 aa  553  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0577341  normal  0.730418 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2036  Excinuclease ABC subunit A  41.95 
 
 		 944 aa  554  1e-156  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0663505  hitchhiker  0.000130956 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2991  excinuclease ABC subunit A  44.05 
 
 		 954 aa  554  1e-156  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.9416  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3848  excinuclease ABC, A subunit  47.08 
 
 		 975 aa  554  1e-156  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00424286  unclonable  0.0000162445 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0853  excinuclease ABC subunit A  41.86 
 
 		 954 aa  554  1e-156  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0427  excinuclease ABC subunit A  46.68 
 
 		 1011 aa  554  1e-156  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0659788  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3137  excinuclease ABC, A subunit  46.67 
 
 		 961 aa  555  1e-156  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.484359  normal  0.0493947 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25750  excinuclease ABC subunit A  48.09 
 
 		 953 aa  550  1e-155  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0255  excinuclease ABC subunit A  46.73 
 
 		 971 aa  551  1e-155  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07070  Excinuclease ABC subunit A  45.69 
 
 		 954 aa  551  1e-155  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.478607 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2882  excinuclease ABC, A subunit  45.39 
 
 		 964 aa  552  1e-155  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2079  excinuclease ABC subunit A  45.8 
 
 		 975 aa  550  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.224045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>