More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3183 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3183  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
358 aa  709    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000292304  decreased coverage  0.0000016442 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0718  family 2 glycosyl transferase  37.66 
 
 
352 aa  190  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00805458 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7649  glycosyl transferase family 2  38.48 
 
 
352 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08480  glycosyl transferase  37.46 
 
 
324 aa  175  9.999999999999999e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.525807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1349  glycosyltransferase  32.84 
 
 
343 aa  172  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3875  glycosyl transferase family 2  34.49 
 
 
331 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2541  putative glycosyl transferase  34.56 
 
 
341 aa  167  4e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4113  glycosyl transferase family 2  33.63 
 
 
343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.902695  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0838  glycosyl transferase family 2  32.52 
 
 
368 aa  144  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0722  succinoglycan biosynthesis protein ExoA  35.47 
 
 
353 aa  137  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4805  glycosyl transferase family protein  31.56 
 
 
339 aa  125  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0228  glycosyl transferase family protein  26.99 
 
 
333 aa  125  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000082788  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  28.06 
 
 
337 aa  124  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0604  putative glycosyl transferase  32.34 
 
 
340 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.781878  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1661  glycosyl transferase family protein  34.24 
 
 
316 aa  118  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4957  glycosyl transferase family protein  30.27 
 
 
330 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.083679 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4622  glycosyl transferase family protein  36.55 
 
 
355 aa  116  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0686248 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5927  succinoglycan biosynthesis protein  28.18 
 
 
341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1029  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
360 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1959  glycosyl transferase family protein  32.01 
 
 
329 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.465626 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1222  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 
329 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.966529  normal  0.285342 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3564  glycosyl transferase family protein  33.97 
 
 
389 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0657  glycosyl transferase family protein  30.12 
 
 
331 aa  109  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2563  glycosyl transferase family protein  30.59 
 
 
329 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4523  glycosyl transferase family protein  31.5 
 
 
336 aa  106  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131272  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1038  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
355 aa  103  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.378242  normal  0.03094 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05860  glycosyl transferase  30.43 
 
 
351 aa  102  1e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000181902 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  29.5 
 
 
822 aa  93.6  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  32.78 
 
 
1099 aa  90.9  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0913  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.87 
 
 
341 aa  89.7  7e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000688111  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  25.18 
 
 
528 aa  87.4  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  31.14 
 
 
398 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  30.24 
 
 
303 aa  86.7  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0140  glycosyl transferase family protein  32.23 
 
 
244 aa  82.8  0.000000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  25.71 
 
 
581 aa  82  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  29.46 
 
 
752 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  26.42 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  26.58 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  31.09 
 
 
327 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2894  hypothetical protein  27.1 
 
 
316 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0314909 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  30.9 
 
 
301 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 
1250 aa  77.8  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  31.39 
 
 
347 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 
1032 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  34.76 
 
 
704 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2718  N-glycosyltransferase  28.36 
 
 
418 aa  75.1  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  25.93 
 
 
410 aa  75.1  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0849  glycosyl transferase family 2  50.56 
 
 
336 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0621  hypothetical protein  29.27 
 
 
321 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0768751  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07275  glycosyl transferase  28.38 
 
 
296 aa  74.7  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.170431  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  23.46 
 
 
322 aa  74.3  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2011  glycosyl transferase family 2  28.26 
 
 
335 aa  74.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.814426  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1013  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 
812 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  30.65 
 
 
313 aa  73.6  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  29.66 
 
 
662 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  30.28 
 
 
328 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  27.49 
 
 
341 aa  73.2  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3111  glycosyl transferase family protein  29.7 
 
 
297 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3227  glycosyl transferase family protein  32.26 
 
 
339 aa  73.2  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000210219  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3171  glycosyl transferase family protein  29.7 
 
 
297 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675731  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  27.88 
 
 
352 aa  72.8  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0802  glycosyl transferase family 2  48.31 
 
 
338 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.865033  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  32.39 
 
 
361 aa  72.8  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  29.66 
 
 
520 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  29.66 
 
 
505 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  23.98 
 
 
927 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  32.37 
 
 
235 aa  72.4  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2763  glycosyl transferase family protein  30.45 
 
 
324 aa  72.4  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.32347  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  27.41 
 
 
300 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3517  hypothetical protein  26.84 
 
 
337 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000347699 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1781  glycosyl transferase family 2  30.55 
 
 
326 aa  71.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.456914  normal  0.601286 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1662  glycosyl transferase family protein  29.8 
 
 
345 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.363785  hitchhiker  0.00433752 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0179  N-glycosyltransferase  26.77 
 
 
451 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574055  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  29.24 
 
 
633 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  41.35 
 
 
334 aa  72  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
311 aa  70.9  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  27.17 
 
 
299 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3835  hypothetical protein  26.15 
 
 
334 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3451  hypothetical protein  30.18 
 
 
300 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0614  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  28.96 
 
 
529 aa  70.9  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.597487 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  26.4 
 
 
412 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0300  glycosyl transferase family protein  27.85 
 
 
322 aa  70.1  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  25.77 
 
 
412 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498109 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  27.09 
 
 
441 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  27.09 
 
 
441 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  27.09 
 
 
441 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  28.96 
 
 
347 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1586  glycosyl transferase family protein  27.76 
 
 
444 aa  70.1  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.807446  normal  0.639173 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  27.09 
 
 
441 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  27.09 
 
 
441 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  31.44 
 
 
353 aa  70.1  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1291  glycosyl transferase family protein  31.45 
 
 
351 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  28.72 
 
 
1015 aa  70.1  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  43.82 
 
 
386 aa  69.7  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51220  glycosyl transferase  28.45 
 
 
330 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00120111  hitchhiker  0.000215045 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  23.98 
 
 
1115 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  23.98 
 
 
1119 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0752  N-glycosyltransferase  25.86 
 
 
433 aa  69.3  0.00000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  29.63 
 
 
340 aa  69.3  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  23.98 
 
 
1115 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>