More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0415 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0415  exodeoxyribonuclease III  100 
 
 		 265 aa  551  1e-156  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1001  exodeoxyribonuclease III  45.77 
 
 		 259 aa  241  1e-62  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0471864  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0371  exodeoxyribonuclease III  43.84 
 
 		 279 aa  225  6e-58  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.226435  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0675  exodeoxyribonuclease III  43.53 
 
 		 281 aa  225  7e-58  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.107108  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  41.18 
 
 		 256 aa  194  9e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0685  hypothetical protein  41.18 
 
 		 256 aa  193  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1447  exodeoxyribonuclease III  41.47 
 
 		 258 aa  192  4e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1637  exodeoxyribonuclease III Xth  40.54 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4997  exodeoxyribonuclease III  39.53 
 
 		 258 aa  186  5e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3266  exodeoxyribonuclease III Xth  38.02 
 
 		 263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1817  exodeoxyribonuclease III  39.69 
 
 		 275 aa  183  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.170882  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1194  exodeoxyribonuclease III Xth  39.53 
 
 		 258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118144  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3564  exodeoxyribonuclease III  38.4 
 
 		 261 aa  183  3e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05411  exodeoxyribonuclease III  39.69 
 
 		 275 aa  182  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.186769 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2700  exodeoxyribonuclease III Xth  37.74 
 
 		 270 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0988  exodeoxyribonuclease III  38.02 
 
 		 262 aa  182  7e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  39.23 
 
 		 277 aa  182  7e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1114  exodeoxyribonuclease III Xth  39.15 
 
 		 258 aa  182  7e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1017  exodeoxyribonuclease III  38.02 
 
 		 262 aa  182  7e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.869599 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4240  exodeoxyribonuclease III Xth  37.25 
 
 		 262 aa  181  8.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2983  exodeoxyribonuclease III  41.44 
 
 		 274 aa  180  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.385795  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04851  exodeoxyribonuclease III  39.31 
 
 		 277 aa  180  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.416527  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1189  exodeoxyribonuclease III  39.18 
 
 		 265 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.642421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0929  exodeoxyribonuclease III Xth  36.5 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0172  exodeoxyribonuclease III  40.7 
 
 		 255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000298085 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2776  exodeoxyribonuclease III Xth  40.15 
 
 		 260 aa  178  5.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0418103 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2071  exodeoxyribonuclease III  40.15 
 
 		 256 aa  178  8e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.663777 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2496  exodeoxyribonuclease III  35.66 
 
 		 267 aa  178  9e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0083215  normal  0.338343 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2283  exodeoxyribonuclease III Xth  37.5 
 
 		 267 aa  176  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703686  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1195  exodeoxyribonuclease III Xth  37.25 
 
 		 259 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206462  normal  0.651553 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2758  exodeoxyribonuclease III  35.29 
 
 		 276 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139698  normal  0.30939 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3018  exodeoxyribonuclease III Xth  37.69 
 
 		 261 aa  177  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176682  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1820  exodeoxyribonuclease III  39.08 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.458905  hitchhiker  0.00350077 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1952  exodeoxyribonuclease III Xth  39.33 
 
 		 269 aa  176  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  0.0243221 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3202  exodeoxyribonuclease III Xth  36.08 
 
 		 263 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.840556  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3127  exodeoxyribonuclease III Xth  37.83 
 
 		 262 aa  176  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1624  exodeoxyribonuclease III Xth  38.95 
 
 		 269 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1246  exodeoxyribonuclease III Xth  39.76 
 
 		 254 aa  176  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0137674 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5112  exodeoxyribonuclease III  39.31 
 
 		 260 aa  176  5e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.130446  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2804  exodeoxyribonuclease III  34.51 
 
 		 263 aa  175  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.96481  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2687  exodeoxyribonuclease III  38.55 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1738  exodeoxyribonuclease III  38.55 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2765  exodeoxyribonuclease III  38.55 
 
 		 322 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2247  exodeoxyribonuclease III  38.55 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1520  exodeoxyribonuclease III  38.55 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746689  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3071  exodeoxyribonuclease III  38.55 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2631  exodeoxyribonuclease III  38.55 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223347  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1402  exodeoxyribonuclease III  37.98 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  0.632012 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1886  putative Exodeoxyribonuclease III  36.68 
 
 		 259 aa  174  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0111436  normal  0.144129 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1911  exodeoxyribonuclease III Xth  37.64 
 
 		 264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal  0.517852 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5454  exodeoxyribonuclease III  37.4 
 
 		 258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2467  exodeoxyribonuclease III  37.25 
 
 		 257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184552 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2232  exodeoxyribonuclease III Xth  37.5 
 
 		 264 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1847  exodeoxyribonuclease III  38.17 
 
 		 258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1956  exodeoxyribonuclease III Xth  37.5 
 
 		 264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0751549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1993  exodeoxyribonuclease III (xth)  38.08 
 
 		 260 aa  172  5e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0563751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1126  exodeoxyribonuclease III Xth  38.4 
 
 		 272 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00222533  normal  0.38819 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2815  exodeoxyribonuclease III  34.77 
 
 		 261 aa  171  7.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0879261  normal  0.730816 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4438  exodeoxyribonuclease III  35.69 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1460  exodeoxyribonuclease III Xth  39.31 
 
 		 254 aa  171  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178949  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2435  exodeoxyribonuclease III  37.11 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.147349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2559  exodeoxyribonuclease III  37.4 
 
 		 260 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2163  exodeoxyribonuclease III Xth  39.02 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.924471  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3070  exodeoxyribonuclease III  37.69 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1315  exodeoxyribonuclease III  35.69 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1755  exodeoxyribonuclease III (xth)  34.63 
 
 		 266 aa  170  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06981  exodeoxyribonuclease III  38.26 
 
 		 279 aa  169  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5932  exodeoxyribonuclease III (xth)  37.79 
 
 		 258 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342329  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1686  exodeoxyribonuclease III  35.52 
 
 		 262 aa  169  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2145  exodeoxyribonuclease III Xth  37.79 
 
 		 258 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1297  exodeoxyribonuclease III  37.13 
 
 		 275 aa  169  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.295102  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2657  exodeoxyribonuclease III  35.29 
 
 		 259 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.107023  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1180  exodeoxyribonuclease III  38.37 
 
 		 264 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.346551  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3648  exodeoxyribonuclease III  37.8 
 
 		 254 aa  169  5e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1749  exodeoxyribonuclease III  36.4 
 
 		 259 aa  169  6e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2607  exodeoxyribonuclease III  37.26 
 
 		 265 aa  168  7e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0881671 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2331  exodeoxyribonuclease III Xth  38.1 
 
 		 265 aa  168  8e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2680  exonuclease III  36.12 
 
 		 264 aa  168  9e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112967  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1526  exodeoxyribonuclease III  38.78 
 
 		 258 aa  168  9e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541899  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2611  exodeoxyribonuclease III Xth  38.78 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.458401 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1478  exodeoxyribonuclease III Xth  37.55 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2055  exodeoxyribonuclease III Xth  37.59 
 
 		 271 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0007  exodeoxyribonuclease III  37.6 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.454244  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2622  exodeoxyribonuclease III Xth  36.82 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128111  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2182  exodeoxyribonuclease III Xth  37.59 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1810  exodeoxyribonuclease III xth  34.24 
 
 		 266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.962919 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1683  exodeoxyribonuclease III  40.16 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.122396 
 
 
-
 
NC_004310  BR0873  exodeoxyribonuclease III  34.22 
 
 		 260 aa  165  5.9999999999999996e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1479  exodeoxyribonuclease III Xth  33.33 
 
 		 263 aa  165  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.688806 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0864  exodeoxyribonuclease III  34.22 
 
 		 279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4594  exodeoxyribonuclease III Xth  37.59 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1593  exodeoxyribonuclease III protein  37.45 
 
 		 269 aa  163  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.224473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0065  exodeoxyribonuclease III Xth  38.61 
 
 		 259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0485  exodeoxyribonuclease III  36.7 
 
 		 281 aa  162  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229415  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1677  exodeoxyribonuclease III Xth  32.95 
 
 		 263 aa  162  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05401  exodeoxyribonuclease III  37.08 
 
 		 281 aa  161  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.889276  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2355  exodeoxyribonuclease III Xth  34.09 
 
 		 260 aa  161  9e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.936665  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2921  exodeoxyribonuclease III Xth  39.16 
 
 		 264 aa  161  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4446  exodeoxyribonuclease III Xth  39.15 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1609  exodeoxyribonuclease III Xth  40.75 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.456361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>