More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4788 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 		 192 aa  386  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  88.48 
 
 		 192 aa  346  1e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  80.1 
 
 		 192 aa  320  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  80.1 
 
 		 192 aa  320  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  80.1 
 
 		 192 aa  320  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11032  peptidyl-tRNA hydrolase  75.39 
 
 		 191 aa  289  2e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1538  peptidyl-tRNA hydrolase  61.29 
 
 		 188 aa  224  6e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3951  peptidyl-tRNA hydrolase  60.43 
 
 		 197 aa  223  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72777  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3210  peptidyl-tRNA hydrolase  63.68 
 
 		 194 aa  221  7e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0653  peptidyl-tRNA hydrolase  60.43 
 
 		 189 aa  219  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8605  Aminoacyl-tRNA hydrolase  59.46 
 
 		 201 aa  216  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  55.98 
 
 		 209 aa  215  4e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0782  peptidyl-tRNA hydrolase  57.75 
 
 		 195 aa  209  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1944  peptidyl-tRNA hydrolase  54.74 
 
 		 196 aa  206  2e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0171  peptidyl-tRNA hydrolase  56.15 
 
 		 198 aa  205  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  59.79 
 
 		 206 aa  203  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0417  peptidyl-tRNA hydrolase  57.14 
 
 		 213 aa  201  4e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4550  peptidyl-tRNA hydrolase  60.43 
 
 		 195 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0912  peptidyl-tRNA hydrolase  55.9 
 
 		 217 aa  199  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1292  peptidyl-tRNA hydrolase  52.36 
 
 		 213 aa  196  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32390  peptidyl-tRNA hydrolase  54.26 
 
 		 199 aa  194  6e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.438107 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0735  aminoacyl-tRNA hydrolase  55.15 
 
 		 196 aa  190  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0914  peptidyl-tRNA hydrolase  57.29 
 
 		 195 aa  187  8e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0822526  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0791  aminoacyl-tRNA hydrolase  55.15 
 
 		 196 aa  186  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30140  peptidyl-tRNA hydrolase  55.73 
 
 		 202 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.601869 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05520  peptidyl-tRNA hydrolase  57.75 
 
 		 191 aa  182  3e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1220  peptidyl-tRNA hydrolase  53.12 
 
 		 194 aa  177  8e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1290  peptidyl-tRNA hydrolase  53.93 
 
 		 196 aa  177  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000493335 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1054  Aminoacyl-tRNA hydrolase  52.79 
 
 		 198 aa  172  2.9999999999999996e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3987  peptidyl-tRNA hydrolase  55.61 
 
 		 221 aa  170  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1940  peptidyl-tRNA hydrolase  51.3 
 
 		 205 aa  169  3e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03980  peptidyl-tRNA hydrolase  49.44 
 
 		 185 aa  168  4e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.469192 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  43.41 
 
 		 188 aa  166  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0990  peptidyl-tRNA hydrolase  50 
 
 		 199 aa  164  5.9999999999999996e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  hitchhiker  0.0022816 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2704  peptidyl-tRNA hydrolase  53.61 
 
 		 202 aa  159  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  41.85 
 
 		 185 aa  158  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0884  peptidyl-tRNA hydrolase  51.26 
 
 		 206 aa  158  4e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.202868 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1729  peptidyl-tRNA hydrolase  44.09 
 
 		 214 aa  157  6e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1595  peptidyl-tRNA hydrolase  46.03 
 
 		 192 aa  157  8e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03510  peptidyl-tRNA hydrolase  49.23 
 
 		 202 aa  157  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.584729 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1001  peptidyl-tRNA hydrolase  44.09 
 
 		 217 aa  156  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1290  aminoacyl-tRNA hydrolase  41.85 
 
 		 187 aa  156  2e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  43.68 
 
 		 213 aa  154  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3500  peptidyl-tRNA hydrolase  40.54 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000021188 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2056  peptidyl-tRNA hydrolase  44.26 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0656  aminoacyl-tRNA hydrolase  41.8 
 
 		 199 aa  154  1e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2002  peptidyl-tRNA hydrolase  47.51 
 
 		 191 aa  152  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000950894  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0778  peptidyl-tRNA hydrolase  41.8 
 
 		 199 aa  153  2e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.881763  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2256  aminoacyl-tRNA hydrolase  45.16 
 
 		 205 aa  151  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.281218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2073  peptidyl-tRNA hydrolase  42.62 
 
 		 195 aa  151  7e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2760  peptidyl-tRNA hydrolase  45.86 
 
 		 185 aa  150  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  39.46 
 
 		 187 aa  150  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2121  Aminoacyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 		 190 aa  149  2e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.062679 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1474  peptidyl-tRNA hydrolase  45.41 
 
 		 188 aa  149  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0138891 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0310  aminoacyl-tRNA hydrolase  41.08 
 
 		 206 aa  149  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2766  peptidyl-tRNA hydrolase  44.62 
 
 		 188 aa  148  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.720663  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2402  peptidyl-tRNA hydrolase  44.02 
 
 		 210 aa  148  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.919622  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  42.7 
 
 		 186 aa  148  6e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13420  peptidyl-tRNA hydrolase  50.79 
 
 		 204 aa  147  7e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1854  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2474  peptidyl-tRNA hydrolase  44.02 
 
 		 210 aa  147  7e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2697  peptidyl-tRNA hydrolase  44.02 
 
 		 210 aa  147  7e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1510  Aminoacyl-tRNA hydrolase  38.67 
 
 		 193 aa  147  7e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1291  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 204 aa  147  9e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  43.01 
 
 		 191 aa  147  9e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0675  peptidyl-tRNA hydrolase  42.08 
 
 		 198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000361482  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2414  peptidyl-tRNA hydrolase  42.47 
 
 		 194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.294546  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  41.08 
 
 		 207 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  41.08 
 
 		 207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  41.08 
 
 		 207 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5242  peptidyl-tRNA hydrolase  48.11 
 
 		 203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0071  aminoacyl-tRNA hydrolase  44.62 
 
 		 195 aa  146  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.287226  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  41.08 
 
 		 186 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  41.08 
 
 		 186 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  41.08 
 
 		 186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0394  peptidyl-tRNA hydrolase  40.53 
 
 		 192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000248474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  41.08 
 
 		 186 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  41.08 
 
 		 207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0897  peptidyl-tRNA hydrolase  38.59 
 
 		 230 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  44.38 
 
 		 186 aa  145  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1675  peptidyl-tRNA hydrolase  46.24 
 
 		 192 aa  145  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.224876  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  40.54 
 
 		 207 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0010  peptidyl-tRNA hydrolase  39.43 
 
 		 188 aa  145  4.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0079  peptidyl-tRNA hydrolase  44.39 
 
 		 190 aa  145  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.110658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2522  peptidyl-tRNA hydrolase  43.01 
 
 		 192 aa  144  6e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0149301  normal  0.177259 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  41.08 
 
 		 210 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1416  peptidyl-tRNA hydrolase  42.39 
 
 		 201 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.827174  normal  0.882647 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2819  aminoacyl-tRNA hydrolase  37.57 
 
 		 193 aa  143  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112866  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0770  peptidyl-tRNA hydrolase  37.89 
 
 		 205 aa  142  3e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1560  peptidyl-tRNA hydrolase  40.21 
 
 		 201 aa  142  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0200988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4125  peptidyl-tRNA hydrolase  44.02 
 
 		 202 aa  142  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2511  peptidyl-tRNA hydrolase  42.39 
 
 		 202 aa  142  4e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3102  peptidyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 		 204 aa  142  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0339  peptidyl-tRNA hydrolase  39.78 
 
 		 179 aa  142  4e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0126  peptidyl-tRNA hydrolase  47.28 
 
 		 192 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0137  peptidyl-tRNA hydrolase  47.28 
 
 		 192 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5435  peptidyl-tRNA hydrolase  39.78 
 
 		 207 aa  141  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4839  peptidyl-tRNA hydrolase  42.39 
 
 		 206 aa  141  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881086  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1058  peptidyl-tRNA hydrolase  42.02 
 
 		 187 aa  141  6e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0054523  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3227  peptidyl-tRNA hydrolase  39.13 
 
 		 232 aa  140  9e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.783936 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0949  peptidyl-tRNA hydrolase  38.38 
 
 		 216 aa  140  9e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.803923  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>