More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2907 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2907  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 330 aa  641    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0648917  normal  0.0454555 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1323  alcohol dehydrogenase  60.91 
 
 		 328 aa  352  7e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.872733 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1903  phosphonate catabolism associated alcohol dehydrogenase  41.3 
 
 		 387 aa  244  9.999999999999999e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3185  phosphonate catabolism associated alcohol dehydrogenase  43.98 
 
 		 367 aa  209  7e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0695592  normal  0.0163259 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2879  alcohol dehydrogenase  33.15 
 
 		 371 aa  149  6e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0472393  normal  0.953553 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0308  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.77 
 
 		 368 aa  145  9e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0299  alcohol dehydrogenase  32.77 
 
 		 368 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0318  alcohol dehydrogenase  32.77 
 
 		 368 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.407118 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2379  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.34 
 
 		 364 aa  135  8e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  31.5 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0446  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.6 
 
 		 365 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000698288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7506  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.33 
 
 		 369 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0449  L-threonine 3-dehydrogenase  32.07 
 
 		 361 aa  120  3.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3939  L-threonine 3-dehydrogenase  30.53 
 
 		 341 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27746  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4367  L-threonine 3-dehydrogenase  29.72 
 
 		 343 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2473  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.55 
 
 		 344 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000066055  normal  0.0147407 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2723  alcohol dehydrogenase  34.87 
 
 		 338 aa  113  6e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0619136  normal  0.4282 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4840  alcohol dehydrogenase  33.22 
 
 		 330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0072  L-threonine 3-dehydrogenase  25.96 
 
 		 341 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4144  L-threonine 3-dehydrogenase  25.96 
 
 		 341 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.498759  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4086  L-threonine 3-dehydrogenase  29.47 
 
 		 343 aa  110  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0066  L-threonine 3-dehydrogenase  25.96 
 
 		 341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4951  alcohol dehydrogenase  32.57 
 
 		 337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179579  normal  0.722562 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0097  L-threonine 3-dehydrogenase  29.47 
 
 		 341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0317813  hitchhiker  0.00132916 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4673  L-threonine 3-dehydrogenase  26.44 
 
 		 341 aa  109  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0062  L-threonine 3-dehydrogenase  26.55 
 
 		 340 aa  110  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0981  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.86 
 
 		 342 aa  109  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3901  L-threonine 3-dehydrogenase  26.44 
 
 		 341 aa  109  6e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00409651  normal  0.55097 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3993  L-threonine 3-dehydrogenase  26.44 
 
 		 341 aa  109  6e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00526956  normal  0.0228585 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4105  L-threonine 3-dehydrogenase  26.44 
 
 		 341 aa  109  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287848  normal  0.406165 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3902  L-threonine 3-dehydrogenase  26.44 
 
 		 341 aa  109  6e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00646337  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0513  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.41 
 
 		 360 aa  109  7.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0353  L-threonine 3-dehydrogenase  28.47 
 
 		 343 aa  109  8.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4823  L-threonine 3-dehydrogenase  27.8 
 
 		 341 aa  108  9.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000204753 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0837  L-threonine 3-dehydrogenase  29.15 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.178921  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5306  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.61 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3009  alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 		 361 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.39042  normal  0.310098 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05001  L-threonine 3-dehydrogenase  28.47 
 
 		 360 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0530  L-threonine 3-dehydrogenase  27 
 
 		 345 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3710  L-threonine 3-dehydrogenase  28.77 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0100  L-threonine 3-dehydrogenase  28.42 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.173553 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0064  L-threonine 3-dehydrogenase  28.77 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00353875  unclonable  0.000000014689 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4341  L-threonine 3-dehydrogenase  26.14 
 
 		 341 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001213  L-threonine 3-dehydrogenase  28.14 
 
 		 343 aa  106  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0614  alcohol dehydrogenase  26.37 
 
 		 318 aa  106  5e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0116847  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3944  L-threonine 3-dehydrogenase  29.01 
 
 		 342 aa  106  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4286  L-threonine 3-dehydrogenase  26.14 
 
 		 341 aa  106  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000588728 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4481  L-threonine 3-dehydrogenase  26.14 
 
 		 341 aa  106  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155025  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2931  L-threonine 3-dehydrogenase  30.24 
 
 		 343 aa  106  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.217588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0050  L-threonine 3-dehydrogenase  30.43 
 
 		 347 aa  106  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0057  L-threonine 3-dehydrogenase  26.14 
 
 		 341 aa  106  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0451496  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  27.33 
 
 		 344 aa  105  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0175  L-threonine 3-dehydrogenase  29.15 
 
 		 341 aa  105  8e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348381  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0121  L-threonine 3-dehydrogenase  28.42 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3280  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.69 
 
 		 368 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3364  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.81 
 
 		 367 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0600954 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  32.59 
 
 		 342 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0106  L-threonine 3-dehydrogenase  28.07 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.588963  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3793  L-threonine 3-dehydrogenase  26.01 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00257874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0345  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.95 
 
 		 347 aa  104  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0049  L-threonine 3-dehydrogenase  29.43 
 
 		 347 aa  104  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000160501 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3448  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.75 
 
 		 371 aa  104  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0006  L-threonine 3-dehydrogenase  29.37 
 
 		 343 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00067  L-threonine 3-dehydrogenase  26.55 
 
 		 341 aa  105  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0007  L-threonine 3-dehydrogenase  29.04 
 
 		 343 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.237262  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0006  L-threonine 3-dehydrogenase  29.04 
 
 		 343 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1512  L-threonine 3-dehydrogenase  29.04 
 
 		 343 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0841527  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1853  L-threonine 3-dehydrogenase  27.16 
 
 		 344 aa  104  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.981388  normal  0.0441816 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0006  L-threonine 3-dehydrogenase  29.04 
 
 		 343 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1152  L-threonine 3-dehydrogenase  29.04 
 
 		 343 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1432  L-threonine 3-dehydrogenase  29.04 
 
 		 343 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.263737  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0006  L-threonine 3-dehydrogenase  29.04 
 
 		 343 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.936478  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0639  alcohol dehydrogenase  31.47 
 
 		 322 aa  103  4e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00000239851  hitchhiker  0.000149204 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2101  alcohol dehydrogenase  32.54 
 
 		 340 aa  103  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0244583 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1967  alcohol dehydrogenase  35.65 
 
 		 344 aa  103  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2083  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.22 
 
 		 362 aa  103  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.6772  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4160  L-threonine 3-dehydrogenase  28.81 
 
 		 342 aa  103  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  32.22 
 
 		 342 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3256  alcohol dehydrogenase  25.52 
 
 		 345 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2367  alcohol dehydrogenase  32.55 
 
 		 344 aa  103  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4187  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.61 
 
 		 335 aa  103  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0089  L-threonine 3-dehydrogenase  27.46 
 
 		 341 aa  103  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1403  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  30.22 
 
 		 361 aa  102  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0304986  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.62 
 
 		 333 aa  102  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3616  L-threonine 3-dehydrogenase  26.14 
 
 		 342 aa  102  7e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00121447  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3582  alcohol dehydrogenase  31.58 
 
 		 337 aa  102  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7003  L-threonine 3-dehydrogenase  28.47 
 
 		 343 aa  102  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5870  alcohol dehydrogenase  31.45 
 
 		 341 aa  102  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.801122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2439  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  31.58 
 
 		 332 aa  102  8e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00520029 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3212  alcohol dehydrogenase  33.12 
 
 		 347 aa  102  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2396  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  31.29 
 
 		 361 aa  102  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.516126 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0633  alcohol dehydrogenase  26.92 
 
 		 317 aa  102  9e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  30.66 
 
 		 342 aa  102  9e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03474  L-threonine 3-dehydrogenase  27.12 
 
 		 341 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0601715  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4044  L-threonine 3-dehydrogenase  27.12 
 
 		 341 aa  102  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.100127  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03425  hypothetical protein  27.12 
 
 		 341 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3920  L-threonine 3-dehydrogenase  25.82 
 
 		 350 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344166  normal  0.087716 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3953  L-threonine 3-dehydrogenase  27.12 
 
 		 341 aa  102  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0503034  normal  0.824331 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3828  L-threonine 3-dehydrogenase  27.12 
 
 		 341 aa  102  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0092  L-threonine 3-dehydrogenase  27.12 
 
 		 341 aa  102  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.212636  normal  0.425053 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>