162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2409 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2409  hydrogenase maturation protease  100 
 
 		 169 aa  332  1e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.520841 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2125  hydrogenase maturation protease  70.75 
 
 		 156 aa  198  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.295921  normal  0.0277446 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2138  peptidase M52, hydrogen uptake protein  67.97 
 
 		 137 aa  161  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.577863  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2184  peptidase M52, hydrogen uptake protein  67.97 
 
 		 137 aa  161  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.303394 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4597  hydrogenase maturation protease  53.33 
 
 		 187 aa  140  6e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08060  hydrogenase maturation protease  49.09 
 
 		 176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3819  hydrogenase maturation protease  43.75 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1940  peptidase M52, hydrogen uptake protein  46.06 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2487  hydrogenase maturation protease  45.58 
 
 		 170 aa  102  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2546  hydrogenase maturation protease  39.29 
 
 		 170 aa  91.3  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.316612  normal  0.0941351 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0522  hydrogenase maturation protease  42.57 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0477  peptidase M52, hydrogen uptake protein  38.12 
 
 		 175 aa  73.2  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1233  hydrogenase maturation protease  29.38 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2740  hydrogenase maturation protease  26.62 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112894  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3372  hypothetical protein  35.67 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0014  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  33.33 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3432  hydrogenase maturation protease  35.44 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0478  hydrogenase maturation protease  31.17 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2176  hydrogenase expression/formation protein  35.29 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0123485  normal  0.201269 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1414  hydrogenase expression/formation protein  32.39 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0051  hydrogenase maturation protease  27.4 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0212564  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3393  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  30.34 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.441153 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3494  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  30.34 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.627392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  33.33 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1153  hydrogenase expression/formation protein  33.74 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0451  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  30.26 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3399  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  30.34 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0975  hydrogenase maturation protease  26.62 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0660111  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3319  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  30.34 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00237916  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3328  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  30.34 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1165  hydrogenase expression/formation protein  29.94 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.464172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0272  hydrogenase maturation protease  32.62 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.268401 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2131  hydrogenase maturation protease  31.65 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.829671 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2175  hydrogenase maturation protease  30 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0703  hydrogenase expression/formation protein  30.34 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2331  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  30 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3173  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  30.34 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0700  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  30.34 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3279  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  30.34 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2530  hydrogenase expression/formation protein  33.33 
 
 		 169 aa  57.4  0.00000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.780336  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3462  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  30.34 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4305  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  30.34 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0499  HyaD peptidase  33.56 
 
 		 206 aa  57  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2150  hydrogenase expression/formation protein  33.56 
 
 		 206 aa  57  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133093  normal  0.20367 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02869  predicted maturation element for hydrogenase 2  29.66 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2367  hydrogenase maturation protease  35.66 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307441 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0510  hydrogenase maturation protease  36.64 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0505  hydrogenase maturation protease  36.64 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02818  hypothetical protein  29.66 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3420  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  29.66 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3101  hydrogenase expression/formation protein  33.33 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  35.71 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0777  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  29.41 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.470969  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3970  HybD peptidase  31.69 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50560  hydrogenase expression/formation protein, HoxM  31.82 
 
 		 207 aa  54.3  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00480221  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2139  hydrogenase expression/formation protein  31.17 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1139  hydrogenase maturation protease  33.33 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2879  hydrogenase maturation protease  32.14 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.980378 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1800  hydrogenase expression/formation protein  28.66 
 
 		 202 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1640  hydrogenase expression/formation protein  28.66 
 
 		 202 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1648  hydrogenase expression/formation protein  28.66 
 
 		 202 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3281  hydrogenase maturation protease  32.14 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1271  peptidase M52, hydrogen uptake protein  35.1 
 
 		 167 aa  52.4  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.813931  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1037  hydrogenase expression/formation protein  28.87 
 
 		 161 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0456714  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2322  hydrogenase expression/formation protein  30.2 
 
 		 166 aa  52.4  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.659738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04410  soluble hydrogenase processing peptidase, HoxW  33.33 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2951  hydrogenase expression/formation protein  31.88 
 
 		 170 aa  51.6  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1999  hydrogenase maturation  30.07 
 
 		 195 aa  52  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.116789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2606  hydrogenase maturation protease  31.54 
 
 		 150 aa  52  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0209681  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4092  peptidase M52, hydrogen uptake protein  30.26 
 
 		 174 aa  51.6  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783921  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1635  hydrogenase expression/formation protein  28.66 
 
 		 202 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0858  hydrogenase maturation protease  26.62 
 
 		 157 aa  51.6  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0267  hydrogenase expression/formation protein  31.29 
 
 		 165 aa  51.6  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.312911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0085  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  31.76 
 
 		 181 aa  51.6  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0501687  normal  0.0549727 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1707  hydrogenase expression/formation protein  28.03 
 
 		 202 aa  51.2  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4241  peptidase M52, hydrogen uptake protein  29.25 
 
 		 182 aa  50.8  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0335  hydrogenase expression/formation protein  38.1 
 
 		 191 aa  50.8  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00352637  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1247  hydrogenase maturation protease  25.32 
 
 		 156 aa  50.8  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.188771 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3145  hydrogenase expression/formation protein  30.26 
 
 		 159 aa  50.8  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00208925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3415  peptidase M52, hydrogen uptake protein  33.56 
 
 		 166 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100638  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  30.22 
 
 		 176 aa  50.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3478  hydrogenase maturation protease  33.56 
 
 		 166 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.314685  normal  0.0224154 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3804  hydrogenase maturation protease  33.33 
 
 		 157 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3681  hydrogenase maturation protease  32.23 
 
 		 163 aa  50.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.157783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0857  hydrogenase maturation protease  25.87 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.685665  normal  0.316463 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1762  hydrogenase expression/formation protein  30.07 
 
 		 187 aa  49.7  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  30.67 
 
 		 1053 aa  48.9  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1157  hydrogenase expression/formation protein  28.68 
 
 		 195 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.486513  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1971  hydrogenase expression/formation protein  31.17 
 
 		 223 aa  48.9  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.814536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  30.07 
 
 		 152 aa  49.3  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7262  hydrogenase expression/formation protein  31.17 
 
 		 214 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356245 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1347  hydrogenase maturation protease  35 
 
 		 153 aa  48.5  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3530  hydrogenase maturation protease  32.68 
 
 		 164 aa  48.1  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3769  hydrogenase expression/formation protein  27.78 
 
 		 209 aa  47.8  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2026  HyaD peptidase  31.03 
 
 		 208 aa  47.8  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.462165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0148  hydrogenase maturation protease  27.27 
 
 		 161 aa  47.8  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0916  hydrogenase maturation protease  31.68 
 
 		 170 aa  47.8  0.00008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.712591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1859  hydrogenase maturation protease  25.81 
 
 		 194 aa  47.8  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1555  peptidase M52, hydrogen uptake protein  29.19 
 
 		 155 aa  47.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199341  normal  0.0326576 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2030  hydrogenase expression/formation protein  29.22 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>