244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3268 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3115  cobaltochelatase subunit CobN  46.02 
 
 		 1109 aa  811    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3286  cobaltochelatase subunit CobN  47.34 
 
 		 1126 aa  833    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201105  normal  0.898928 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3144  cobaltochelatase subunit CobN  48.77 
 
 		 1140 aa  912    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1714  cobaltochelatase subunit CobN  45.04 
 
 		 1143 aa  796    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185329  decreased coverage  0.00608846 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2827  cobaltochelatase subunit CobN  44.51 
 
 		 1078 aa  794    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1518  cobaltochelatase subunit CobN  44.06 
 
 		 1078 aa  796    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0624953  normal  0.136834 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2149  cobaltochelatase subunit CobN  45.87 
 
 		 1103 aa  759    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304993  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2438  cobaltochelatase subunit CobN  46.98 
 
 		 1099 aa  762    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.621018  normal  0.167912 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1436  cobaltochelatase subunit CobN  45.24 
 
 		 1144 aa  811    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.11738  normal  0.80922 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0342  cobaltochelatase subunit CobN  44.08 
 
 		 1094 aa  819    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2931  cobaltochelatase subunit CobN  42.97 
 
 		 1090 aa  847    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.347121  hitchhiker  0.00673529 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1889  cobaltochelatase subunit CobN  46.23 
 
 		 1108 aa  886    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.62162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2210  cobaltochelatase subunit CobN  42.69 
 
 		 1081 aa  804    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3268  cobaltochelatase, CobN subunit  100 
 
 		 1115 aa  2234    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0228816 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0158  cobaltochelatase  39.17 
 
 		 1235 aa  762    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.75394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3507  cobaltochelatase, CobN subunit  56.83 
 
 		 1104 aa  1214    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.11583  normal  0.546877 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2532  cobaltochelatase subunit CobN  43.74 
 
 		 1056 aa  813    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.310665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1439  cobaltochelatase subunit CobN  44.97 
 
 		 1143 aa  805    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.293615  normal  0.816429 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1468  cobaltochelatase subunit CobN  44.33 
 
 		 1078 aa  791    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.428547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3426  cobaltochelatase subunit CobN  33.42 
 
 		 1205 aa  567  1e-160  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.127026  normal  0.438589 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2533  cobaltochelatase subunit CobN  33 
 
 		 1198 aa  554  1e-156  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2496  cobaltochelatase subunit CobN  33 
 
 		 1198 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315782  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2541  cobaltochelatase subunit CobN  33 
 
 		 1198 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0816  cobaltochelatase, CobN subunit  35.11 
 
 		 1175 aa  544  1e-153  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3112  cobaltochelatase subunit CobN  33.28 
 
 		 1213 aa  543  1e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2482  cobaltochelatase, CobN subunit  32.99 
 
 		 1203 aa  522  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.440822  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0319  cobaltochelatase subunit CobN  32.15 
 
 		 1209 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12098  cobaltochelatase subunit CobN  32.68 
 
 		 1194 aa  515  1e-144  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000146421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1759  cobaltochelatase subunit CobN  40.05 
 
 		 1273 aa  509  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193122  normal  0.0775991 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1269  cobaltochelatase subunit CobN  41.23 
 
 		 1263 aa  510  1e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1306  cobaltochelatase subunit CobN  41.09 
 
 		 1263 aa  507  9.999999999999999e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2647  cobaltochelatase CobN subunit  40.79 
 
 		 1260 aa  505  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.844431  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1877  cobaltochelatase subunit CobN  40.11 
 
 		 1263 aa  503  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0787  cobaltochelatase subunit CobN  42.58 
 
 		 1249 aa  489  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3366  cobaltochelatase subunit CobN  41.98 
 
 		 1240 aa  484  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0738  cobaltochelatase subunit CobN  41.48 
 
 		 1286 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1167  cobaltochelatase subunit CobN  37.5 
 
 		 1288 aa  468  9.999999999999999e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0636  cobaltochelatase subunit CobN  40.96 
 
 		 1247 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5746  cobaltochelatase, CobN subunit  38.63 
 
 		 1273 aa  442  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000307872 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0441  cobaltochelatase  31 
 
 		 1192 aa  442  9.999999999999999e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3301  cobaltochelatase, CobN subunit  36.4 
 
 		 1247 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0562  cobaltochelatase subunit CobN  34.62 
 
 		 1290 aa  437  1e-121  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2219  cobaltochelatase subunit CobN  38.64 
 
 		 1248 aa  435  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2131  cobaltochelatase subunit CobN  37.05 
 
 		 1330 aa  436  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0808058  normal  0.0966772 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2089  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  28.51 
 
 		 1152 aa  434  1e-120  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3098  cobaltochelatase subunit CobN  36.7 
 
 		 1257 aa  431  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.391048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4806  cobaltochelatase subunit CobN  39.39 
 
 		 1269 aa  430  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3152  cobaltochelatase subunit CobN  37.69 
 
 		 1267 aa  430  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25970  cobaltochelatase subunit CobN  38.49 
 
 		 1248 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.359324  normal  0.429696 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3507  cobaltochelatase subunit CobN  37.38 
 
 		 1253 aa  429  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3015  cobaltochelatase subunit CobN  37.08 
 
 		 1254 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.270973 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2099  cobaltochelatase subunit CobN  39.33 
 
 		 1281 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662171  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0097  cobaltochelatase subunit CobN  36.83 
 
 		 1263 aa  428  1e-118  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1954  cobaltochelatase subunit CobN  39.33 
 
 		 1281 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.68761  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1938  cobaltochelatase subunit CobN  39.33 
 
 		 1281 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.812521  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2269  cobaltochelatase subunit CobN  37.38 
 
 		 1253 aa  429  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2422  cobaltochelatase subunit CobN  37.24 
 
 		 1253 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.842189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4586  cobaltochelatase subunit CobN  37.11 
 
 		 1248 aa  426  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1377  cobaltochelatase, CobN subunit  36.52 
 
 		 1293 aa  424  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.376222  normal  0.163745 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2773  cobaltochelatase subunit CobN  37.16 
 
 		 1253 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5001  cobaltochelatase subunit CobN  37.08 
 
 		 1269 aa  424  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0676394  decreased coverage  0.00000811844 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2815  cobaltochelatase, CobN subunit  36.83 
 
 		 1247 aa  426  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.265823 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1177  cobaltochelatase subunit CobN  38.85 
 
 		 1269 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1657  cobaltochelatase subunit CobN  38.85 
 
 		 1269 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1582  cobaltochelatase subunit CobN  39.53 
 
 		 1269 aa  421  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0866134 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5234  cobaltochelatase, CobN subunit  35.9 
 
 		 1261 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34386 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3149  cobN/magnesium chelatase family protein  35.99 
 
 		 1254 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206272  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1576  cobaltochelatase subunit CobN  38.73 
 
 		 1270 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.104948  normal  0.435931 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1646  cobaltochelatase subunit CobN  37.12 
 
 		 1267 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244329  normal  0.0408694 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1631  cobaltochelatase subunit CobN  38.38 
 
 		 1269 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.498133  normal  0.0450481 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1557  cobaltochelatase subunit CobN  38.59 
 
 		 1270 aa  416  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462367  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2407  cobaltochelatase subunit CobN  39.01 
 
 		 1278 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2371  cobaltochelatase subunit CobN  48.36 
 
 		 1388 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.408289  normal  0.0205166 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0132  cobaltochelatase subunit CobN  32.88 
 
 		 1363 aa  398  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.305949  normal  0.0126467 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2900  cobaltochelatase, CobN subunit  36.91 
 
 		 1348 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0109  cobaltochelatase subunit CobN  26.25 
 
 		 1229 aa  387  1e-106  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.317213  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4488  cobaltochelatase, CobN subunit  32.92 
 
 		 1253 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.036895 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0376  cobaltochelatase  29.67 
 
 		 1187 aa  382  1e-104  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0314903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0228  cobaltochelatase  29.77 
 
 		 1187 aa  382  1e-104  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2340  cobaltochelatase  27.87 
 
 		 1318 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1658  cobaltochelatase  27.52 
 
 		 1551 aa  373  1e-101  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1232  cobaltochelatase  27.43 
 
 		 1340 aa  364  6e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3671  Cobaltochelatase  27.42 
 
 		 1366 aa  362  3e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3099  cobaltochelatase  27.63 
 
 		 1243 aa  360  9e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723092 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2525  magnesium chelatase, H subunit  29.63 
 
 		 1250 aa  360  9.999999999999999e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0401032  normal  0.169261 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6415  magnesium chelatase subunit H  30.99 
 
 		 1197 aa  359  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1517  cobaltochelatase subunit CobN  25.78 
 
 		 1758 aa  357  5e-97  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.254627  hitchhiker  0.000129618 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0756  cobaltochelatase subunit CobN  26.19 
 
 		 2168 aa  357  5.999999999999999e-97  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1732  magnesium chelatase subunit H  28.62 
 
 		 1248 aa  355  4e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1315  magnesium chelatase subunit H  29.32 
 
 		 1247 aa  353  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.285643 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0774  cobaltochelatase  27.41 
 
 		 1323 aa  352  3e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1481  cobaltochelatase  26.48 
 
 		 2110 aa  351  5e-95  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3979  magnesium chelatase subunit H  28.46 
 
 		 1248 aa  349  2e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.426085  normal  0.16908 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3734  magnesium chelatase subunit H  28.51 
 
 		 1248 aa  348  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0107251 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1635  magnesium chelatase subunit H  28.72 
 
 		 1249 aa  347  7e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.28996  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1275  Cobaltochelatase  29.13 
 
 		 1250 aa  347  8.999999999999999e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3536  magnesium chelatase subunit H  29.97 
 
 		 1194 aa  346  2e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0621  magnesium chelatase subunit H  28.84 
 
 		 1242 aa  344  5.999999999999999e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5359  magnesium chelatase subunit H  28.53 
 
 		 1241 aa  341  5e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.877456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  28.44 
 
 		 1812 aa  340  9e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>