298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2563 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2563  MgtC/SapB transporter  100 
 
 
238 aa  474  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173995 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2310  MgtC/SapB transporter  70.34 
 
 
238 aa  335  5e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.163338  normal  0.143975 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1179  MgtC/SapB transporter  65.25 
 
 
238 aa  315  5e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0848  MgtC/SapB transporter  67.23 
 
 
240 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.219331 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4554  MgtC/SapB transporter  65.97 
 
 
240 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0931  MgtC/SapB transporter  65.97 
 
 
240 aa  300  1e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1330  putative MgtC-magnesium transport family protein  62.13 
 
 
238 aa  289  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0787  MgtC/SapB transporter  64.13 
 
 
239 aa  284  8e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0269913 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6766  MgtC/SapB transporter  61.86 
 
 
238 aa  278  4e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0200103  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1996  MgtC/SapB transporter  58.82 
 
 
240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.03442  normal  0.0396859 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4309  MgtC/SapB transporter  61.43 
 
 
236 aa  270  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.894063  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1861  MgtC/SapB transporter  58.65 
 
 
238 aa  260  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1228  MgtC/SapB transporter  54.66 
 
 
238 aa  248  6e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6569  MgtC/SapB transporter  55.93 
 
 
213 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.244488  normal  0.0372547 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3566  MgtC/SapB transporter  55.71 
 
 
238 aa  239  2e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1410  MgtC/SapB transporter  52.38 
 
 
240 aa  239  4e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000273538  normal  0.129974 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1346  MgtC/SapB transporter  52.38 
 
 
240 aa  238  5e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.340819  normal  0.0449923 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0820  MgtC/SapB transporter  61.74 
 
 
238 aa  237  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0695819  normal  0.1933 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0861  MgtC/SapB transporter  61.74 
 
 
238 aa  237  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0306936  normal  0.0426117 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0957  MgtC family protein  52.5 
 
 
238 aa  236  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0790763  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1591  MgtC/SapB transporter  49.79 
 
 
238 aa  232  4.0000000000000004e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5334  MgtC/SapB family transporter  55.74 
 
 
240 aa  225  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000795901  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0155  MgtC/SapB transporter  52.89 
 
 
234 aa  221  9e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0651  MgtC/SapB transporter  54.66 
 
 
238 aa  219  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1461  putative transporter transmembrane protein  50.42 
 
 
240 aa  218  6e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2137  MgtC/SapB transporter  48.73 
 
 
245 aa  212  2.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3514  MgtC/SapB transporter  49.16 
 
 
242 aa  193  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1557  putative MgtC-magnesium transport family protein  44.05 
 
 
232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0695267 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0040  MgtC family protein  41.74 
 
 
238 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0035  MgtC family protein  41.3 
 
 
238 aa  165  6.9999999999999995e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.395003  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3244  magnesium transporter MgtC family protein  40 
 
 
237 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.998946  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2517  MgtC/SapB transporter  40 
 
 
237 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.769904  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5281  hypothetical protein  39.19 
 
 
235 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203967  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61330  magnesium transporter, MgtC family  39.19 
 
 
234 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.568425 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2666  MgtC/SapB transporter  40.44 
 
 
237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2567  MgtC/SapB transporter  38.33 
 
 
230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000119179  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2648  MgtC/SapB transporter  40.36 
 
 
237 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.496907 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3323  MgtC/SapB transporter  40 
 
 
240 aa  145  5e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2831  Mg2+ transporter  38.43 
 
 
232 aa  145  7.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.262591  normal  0.261086 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1632  Mg2+ transporter  37.99 
 
 
232 aa  143  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1743  MgtC/SapB transporter  37.99 
 
 
232 aa  143  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11841  Mg2+ transport P-type ATPase C mgtC  38.74 
 
 
234 aa  143  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3045  MgtC/SapB transporter  39.64 
 
 
232 aa  142  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4255  MgtC family protein  37.67 
 
 
234 aa  137  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0280908  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2688  MgtC/SapB transporter  36.16 
 
 
235 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.269856 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4213  MgtC family protein  37.67 
 
 
233 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00310704  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4094  hypothetical protein  41.06 
 
 
225 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3989  protein MgtC  40.58 
 
 
225 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4157  hypothetical protein  40.1 
 
 
225 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.926737  normal  0.782611 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4043  Mg(2+) transport ATPase protein C  40.1 
 
 
225 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.085999 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3971  protein MgtC  40.1 
 
 
225 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.877159  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1053  MgtC/SapB transporter  36.94 
 
 
235 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000026259  normal  0.291199 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2677  protein MgtC  34.58 
 
 
230 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0157204  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0963  MgtC family protein  37.22 
 
 
238 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0606  MgtC family protein  37.22 
 
 
238 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.289635  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1224  putative magnesium transporter  37.22 
 
 
238 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1344  MgtC family protein  37.22 
 
 
238 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.945606  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2486  MgtC family protein  37.22 
 
 
238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0168  MgtC/SapB transporter  39.29 
 
 
257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0240664  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1509  MgtC family protein  37.22 
 
 
238 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0099302  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1296  putative magnesium transporter  37.22 
 
 
238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.397149  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0328  MgtC family protein  37.22 
 
 
238 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3972  MgtC/SapB transporter  36.49 
 
 
235 aa  126  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0712404  normal  0.0780346 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4115  MgtC/SapB transporter  36.49 
 
 
235 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140688  normal  0.0238534 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4580  MgtC/SapB transporter  36.49 
 
 
235 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000052429  hitchhiker  0.00000214874 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31460  putative transport protein  33.64 
 
 
230 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000370245  hitchhiker  0.00000000416187 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5577  MgtC/SapB transporter  36.49 
 
 
235 aa  124  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000861867  hitchhiker  0.00823603 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3644  MgtC/SapB transporter  36.49 
 
 
235 aa  124  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00528341  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4723  MgtC/SapB transporter  36.49 
 
 
235 aa  124  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000431441  hitchhiker  0.00163781 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1858  Mg2+ transporter  36.41 
 
 
235 aa  122  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596662  normal  0.0859376 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4802  MgtC/SapB transporter  35.91 
 
 
235 aa  115  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167342  hitchhiker  0.000205656 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3916  MgtC/SapB transporter  49.14 
 
 
140 aa  113  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0980  MgtC family protein  35.53 
 
 
204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4342  MgtC/SapB transporter  42.68 
 
 
238 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.200608 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4111  MgtC/SapB transporter  42.68 
 
 
238 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.654772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4187  MgtC/SapB transporter  42.68 
 
 
238 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.222565  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2436  MgtC/SapB transporter  32.2 
 
 
239 aa  105  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05375  Mg(2+) transport protein C, mgtC family protein  41.09 
 
 
141 aa  99.8  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.229985  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05430  uncharacterized membrane protein  41.38 
 
 
244 aa  96.7  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.264676  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5458  MgtC/SapB transporter  45.92 
 
 
212 aa  90.9  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28060  uncharacterized membrane protein  42.14 
 
 
244 aa  89.4  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0823  MgtC/SapB transporter  41.98 
 
 
237 aa  88.6  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.131 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3541  mgtC family protein  31.82 
 
 
225 aa  88.6  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3637  mgtC family protein  31.28 
 
 
225 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1679  mgtC family protein  33.67 
 
 
225 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00131484  hitchhiker  2.42161e-20 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0863  MgtC family protein  34.27 
 
 
227 aa  87  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0531  MgtC/SapB transporter  40.85 
 
 
245 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.772543  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1919  MgtC/SapB transporter  45.3 
 
 
232 aa  86.7  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000262716  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0293  MgtC/SapB transporter  37.93 
 
 
231 aa  85.9  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2287  MgtC/SapB transporter  37.14 
 
 
158 aa  85.5  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.920046  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1302  MgtC/SapB transporter  35 
 
 
210 aa  85.1  9e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0515  MgtC/SapB transporter  36.36 
 
 
233 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.14823  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0520  MgtC/SapB transporter  36.36 
 
 
233 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960712  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2233  MgtC/SapB transporter  43.22 
 
 
172 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1915  putative Mg(2+) transport ATPase  40.31 
 
 
219 aa  83.2  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3541  Mg2+ transporter  44.07 
 
 
172 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3287  MgtC/SapB family membrane protein  30.91 
 
 
225 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3539  mgtC family protein  30.4 
 
 
225 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.980840000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3585  mgtC family protein  30.4 
 
 
225 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4564  MgtC/SapB transporter  40.16 
 
 
280 aa  83.6  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>