294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4564 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4564  MgtC/SapB transporter  100 
 
 
280 aa  555  1e-157  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0111  MgtC/SapB transporter  87.46 
 
 
287 aa  446  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23695  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0469  MgtC/SapB transporter  43.15 
 
 
165 aa  119  6e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05430  uncharacterized membrane protein  46.77 
 
 
244 aa  112  6e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.264676  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28060  uncharacterized membrane protein  50 
 
 
244 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0863  MgtC family protein  35.59 
 
 
227 aa  107  1e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2643  MgtC/SapB transporter  46.67 
 
 
221 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.139935  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0271  MgtC/SapB transporter  38.92 
 
 
215 aa  105  9e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000391256  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1919  MgtC/SapB transporter  40 
 
 
232 aa  104  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000262716  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0823  MgtC/SapB transporter  46.72 
 
 
237 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.131 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0748  MgtC/SapB transporter  45.38 
 
 
133 aa  102  5e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4307  MgtC/SapB transporter  42.96 
 
 
228 aa  102  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177022  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2314  MgtC/SapB transporter  45.71 
 
 
228 aa  102  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000678509  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1805  putative Mg(2+) transport ATPase  42.11 
 
 
219 aa  102  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0175  MgtC/SapB transporter  42.96 
 
 
229 aa  102  9e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171884 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1915  putative Mg(2+) transport ATPase  42.11 
 
 
219 aa  102  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2209  putative Mg(2+) transport ATPase  42.11 
 
 
219 aa  102  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.849166  normal  0.287318 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1909  MgtC/SapB transporter  46.04 
 
 
227 aa  101  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1929  MgtC family protein  48.36 
 
 
225 aa  100  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_733  membrane protein, MgtC / SapB family  46.15 
 
 
133 aa  100  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.787081  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0141  MgtC/SapB transporter  47.86 
 
 
235 aa  100  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0531  MgtC/SapB transporter  43.61 
 
 
245 aa  99.8  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.772543  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0293  MgtC/SapB transporter  34.73 
 
 
231 aa  99.8  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0829  MgtC/SapB family membrane protein  45.38 
 
 
133 aa  99.4  6e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.439532  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03356  predicted Mg(2+) transport ATPase inner membrane protein  38.35 
 
 
215 aa  99  8e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.564701  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03309  hypothetical protein  38.35 
 
 
215 aa  99  8e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.707373  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0209  putative Mg(2+) transport ATPase  38.35 
 
 
215 aa  99  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0346212 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3710  putative Mg(2+) transport ATPase  38.35 
 
 
215 aa  99  8e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000797618  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3541  mgtC family protein  35.62 
 
 
225 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2797  MgtC/SapB transporter  47.27 
 
 
226 aa  98.2  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8016  MgtC/SapB transporter  45.67 
 
 
225 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3810  putative Mg(2+) transport ATPase  38.35 
 
 
219 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0471375 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4867  putative Mg(2+) transport ATPase  38.35 
 
 
219 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.555507 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3112  MgtC/SapB transporter  37.08 
 
 
226 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.706726  normal  0.28104 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61330  magnesium transporter, MgtC family  45.93 
 
 
234 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.568425 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5281  hypothetical protein  45.93 
 
 
235 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203967  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0407  MgtC family membrane protein  44.85 
 
 
301 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.369617  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3906  putative Mg(2+) transport ATPase  37.59 
 
 
215 aa  97.8  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1877  putative magnesium transporter  44.85 
 
 
305 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245498  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2934  MgtC/SapB transporter  53.06 
 
 
240 aa  97.8  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0626  MgtC/SapB transporter  36.72 
 
 
219 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473392  normal  0.489512 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0520  MgtC/SapB transporter  40 
 
 
233 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960712  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1969  MgtC family membrane protein  43.57 
 
 
231 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1106  mgtC family protein  33.13 
 
 
237 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1632  Mg2+ transporter  42.03 
 
 
232 aa  96.7  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3009  MgtC/SapB transporter  43.28 
 
 
226 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.794391  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2948  MgtC/SapB family transporter  51.82 
 
 
228 aa  96.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.349809  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3994  putative Mg(2+) transport ATPase  37.59 
 
 
215 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1743  MgtC/SapB transporter  42.03 
 
 
232 aa  96.7  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3637  mgtC family protein  34.16 
 
 
225 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3543  mgtC family protein  35 
 
 
225 aa  95.9  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.82916  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2666  MgtC/SapB transporter  43.04 
 
 
237 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0515  MgtC/SapB transporter  39.43 
 
 
233 aa  95.9  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.14823  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2886  MgtC/SapB transporter  40.14 
 
 
226 aa  95.5  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0361104  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1856  MgtC family protein  49.07 
 
 
231 aa  95.5  9e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.306879  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1748  MgtC family protein  49.07 
 
 
231 aa  95.5  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.840494  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1150  MgtC family protein  49.07 
 
 
231 aa  95.5  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0397  MgtC family membrane protein  49.07 
 
 
243 aa  95.5  9e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3244  magnesium transporter MgtC family protein  41.77 
 
 
237 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.998946  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2517  MgtC/SapB transporter  41.77 
 
 
237 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.769904  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0307  MgtC family membrane protein  49.07 
 
 
243 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.808223  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2176  MgtC family protein  49.07 
 
 
231 aa  95.1  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.373098  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0487  MgtC/SapB transporter  40.25 
 
 
232 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2831  Mg2+ transporter  42.03 
 
 
232 aa  94.7  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.262591  normal  0.261086 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0862  MgtC family protein  49.07 
 
 
243 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2051  MgtC/SapB transporter  41.18 
 
 
216 aa  95.1  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2126  MgtC family protein  49.07 
 
 
243 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1679  mgtC family protein  34.38 
 
 
225 aa  94  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00131484  hitchhiker  2.42161e-20 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2811  MgtC/SapB transporter  42.57 
 
 
227 aa  94.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3324  mgtC family protein  35 
 
 
225 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.230158  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5378  MgtC/SapB transporter  48.62 
 
 
232 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.368068 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3585  mgtC family protein  35 
 
 
225 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4773  MgtC/SapB transporter  48.62 
 
 
232 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.347441 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3539  mgtC family protein  35 
 
 
225 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.980840000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5362  MgtC/SapB transporter  48.62 
 
 
232 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0134811  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4832  MgtC/SapB transporter  48.62 
 
 
232 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5498  MgtC/SapB transporter  48.62 
 
 
232 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178344  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6903  MgtC/SapB transporter  50 
 
 
228 aa  94  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.275178 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1861  MgtC/SapB transporter  43.28 
 
 
238 aa  94  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1981  MgtC/SapB transporter  45.97 
 
 
225 aa  93.6  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0166435  normal  0.0845453 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3295  MgtC/SapB transporter  49.07 
 
 
231 aa  93.2  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0387472 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0202  MgtC/SapB transporter  39.16 
 
 
226 aa  93.2  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000128946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3287  MgtC/SapB family membrane protein  34.38 
 
 
225 aa  92.8  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0155  MgtC/SapB transporter  45.8 
 
 
234 aa  92  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3045  MgtC/SapB transporter  42.31 
 
 
232 aa  92  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0572  MgtC family protein  39.01 
 
 
240 aa  91.7  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3323  MgtC/SapB transporter  44.44 
 
 
240 aa  91.3  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3239  MgtC/SapB family membrane protein  34.38 
 
 
225 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2993  MgtC/SapB transporter  37.59 
 
 
225 aa  91.3  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2216  MgtC/SapB transporter  38.64 
 
 
225 aa  90.9  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000668009  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0558  cation transport ATPase yqgG  38.3 
 
 
240 aa  90.5  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1344  hypothetical protein  36.88 
 
 
245 aa  90.1  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.753659  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3230  MgtC/SapB transporter  33.75 
 
 
225 aa  90.5  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1155  MgtC/SapB transporter  40.69 
 
 
235 aa  90.5  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.100649  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1728  Mg2+ transporter  40 
 
 
223 aa  90.1  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0882538  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2648  MgtC/SapB transporter  37.39 
 
 
237 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.496907 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0894  MgtC family protein  42.42 
 
 
221 aa  89.4  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00160229  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0957  MgtC family protein  39.19 
 
 
238 aa  89.4  7e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0790763  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1410  MgtC/SapB transporter  44.35 
 
 
240 aa  89  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000273538  normal  0.129974 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1346  MgtC/SapB transporter  44.35 
 
 
240 aa  89  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.340819  normal  0.0449923 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>