More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2258 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1264  ABC transporter related protein  66.84 
 
 		 600 aa  865    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.931219  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2258  putative ATPase RIL  100 
 
 		 600 aa  1221    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.306983 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0212  putative ATPase RIL  51.09 
 
 		 601 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0651  putative ATPase RIL  47.82 
 
 		 592 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1380  putative ATPase RIL  47.14 
 
 		 590 aa  570  1e-161  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0776599  normal  0.169573 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0528  putative ATPase RIL  47.22 
 
 		 590 aa  567  1e-160  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1256  putative ATPase RIL  47.07 
 
 		 590 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.811712  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1558  putative ATPase RIL  46.57 
 
 		 590 aa  555  1e-156  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000149119 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1496  putative ATPase RIL  45.47 
 
 		 590 aa  549  1e-155  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0738  putative ATPase RIL  46.17 
 
 		 604 aa  545  1e-154  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0393541 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1369  putative ATPase RIL  46.54 
 
 		 590 aa  546  1e-154  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0625  putative ATPase RIL  45.65 
 
 		 590 aa  536  1e-151  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.00000179458  hitchhiker  0.000000208503 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3509  putative ATPase RIL  46.46 
 
 		 588 aa  533  1e-150  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.358923 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1686  putative ATPase RIL  45.32 
 
 		 589 aa  534  1e-150  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000842642 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0399  ABC transporter related protein  45.3 
 
 		 586 aa  519  1e-146  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0939  putative ATPase RIL  43.91 
 
 		 589 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3503  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 604 aa  516  1.0000000000000001e-145  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1854  putative ATPase RIL  45.45 
 
 		 589 aa  513  1e-144  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.285578  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0309  putative ATPase RIL  42.34 
 
 		 609 aa  514  1e-144  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1549  ABC transporter related protein  42.52 
 
 		 604 aa  508  9.999999999999999e-143  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.547785  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29654  predicted protein  41.68 
 
 		 611 aa  504  1e-141  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0190452  normal  0.17762 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1568  putative ATPase RIL  43.5 
 
 		 589 aa  505  1e-141  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27256  predicted protein  41.68 
 
 		 611 aa  504  1e-141  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0894318 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_1048  phosphatase  42.22 
 
 		 623 aa  499  1e-140  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.495002  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1332  putative ATPase RIL  42.5 
 
 		 590 aa  499  1e-140  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.178522  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0333  putative ATPase RIL  41.15 
 
 		 610 aa  495  1e-139  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.251916  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0397  putative ATPase RIL  41.56 
 
 		 606 aa  495  1e-139  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07330  hypothetical protein  41 
 
 		 603 aa  488  1e-136  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0435  putative ATPase RIL  42.33 
 
 		 588 aa  482  1e-135  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.985617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0542  putative ATPase RIL  41.32 
 
 		 600 aa  478  1e-133  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0356445  normal  0.109277 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0007  putative ATPase RIL  43.34 
 
 		 584 aa  475  1e-133  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0295  putative ATPase RIL  41.41 
 
 		 595 aa  478  1e-133  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00910203 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01256  RNase L inhibitor of the ABC superfamily, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10310)  41.94 
 
 		 564 aa  401  9.999999999999999e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.192444 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1598  ABC transporter, ATP-binding protein  26.44 
 
 		 502 aa  121  3.9999999999999996e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  26.43 
 
 		 489 aa  118  3e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1060  putative ABC transporter ATP-binding protein  25 
 
 		 554 aa  118  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.298194  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  27.6 
 
 		 634 aa  117  5e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2700  ABC oligo/dipeptide transporter, fused ATPase subunits  23.29 
 
 		 659 aa  117  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1448  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.25 
 
 		 555 aa  117  6e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.391667  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6423  ABC transporter related  27.08 
 
 		 543 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0849413  normal  0.0525416 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08326  putative ATP-binding component of ABC transporter  26.2 
 
 		 564 aa  115  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0877  ABC transporter related protein  26.36 
 
 		 555 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  26.71 
 
 		 490 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2913  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.86 
 
 		 555 aa  112  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.010089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4500  ABC transporter related  26.25 
 
 		 543 aa  111  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.670508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0428  ABC transporter related  27.98 
 
 		 863 aa  110  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1466  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.5 
 
 		 558 aa  110  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000105508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2430  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.6 
 
 		 595 aa  109  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1013  ABC transporter component  26.05 
 
 		 610 aa  109  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3159  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.91 
 
 		 555 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146292 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2810  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.91 
 
 		 555 aa  110  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.923334 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1357  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  23.8 
 
 		 659 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28594  normal  0.0160708 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2216  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.25 
 
 		 547 aa  108  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.885012  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2152  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.9 
 
 		 556 aa  108  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0875259  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2114  ABC transporter related  26.61 
 
 		 504 aa  108  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  25.65 
 
 		 539 aa  108  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1998  putative ABC transporter ATP-binding protein  23.02 
 
 		 563 aa  108  4e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.237018  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1049  ABC transporter, ATP-binding protein  26.88 
 
 		 513 aa  107  5e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000311302  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1403  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.1 
 
 		 556 aa  107  5e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.595923  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3380  ABC transporter related  25.48 
 
 		 651 aa  107  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0154  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  24.85 
 
 		 613 aa  107  9e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3221  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.99 
 
 		 589 aa  107  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2924  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.57 
 
 		 555 aa  105  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.570812  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0060  ABC transporter related protein  24.45 
 
 		 534 aa  105  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.721414  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  25.52 
 
 		 649 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  25.33 
 
 		 649 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5475  L-arabinose transporter ATP-binding protein  25.66 
 
 		 520 aa  106  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0511877 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1987  hypothetical protein  25.46 
 
 		 617 aa  105  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  26.15 
 
 		 647 aa  105  3e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1845  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.36 
 
 		 556 aa  105  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000460921 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0497  ABC transporter, ATP-binding protein  26.29 
 
 		 514 aa  105  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1799  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.4 
 
 		 554 aa  104  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.255837 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0671  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.76 
 
 		 555 aa  104  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1259  ABC transporter ATPase  25.51 
 
 		 512 aa  104  4e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4832  putative ABC transporter ATP-binding protein  23.94 
 
 		 555 aa  104  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.218638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5076  ABC transporter related  28.25 
 
 		 538 aa  104  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.058273  normal  0.492539 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3678  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.54 
 
 		 555 aa  104  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7201  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  27.15 
 
 		 543 aa  103  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0277171  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4920  L-arabinose transporter ATP-binding protein  25.68 
 
 		 519 aa  104  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.671617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5591  ABC transporter related  26.42 
 
 		 551 aa  103  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.395056 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0840  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.45 
 
 		 553 aa  103  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0252  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  25.15 
 
 		 613 aa  103  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  26 
 
 		 493 aa  103  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4939  putative ABC transporter ATP-binding protein  23.94 
 
 		 555 aa  103  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4993  putative ABC transporter ATP-binding protein  23.94 
 
 		 555 aa  103  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4905  putative ABC transporter ATP-binding protein  23.94 
 
 		 555 aa  103  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3872  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.14 
 
 		 555 aa  103  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0797074  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1982  hypothetical protein  25.56 
 
 		 617 aa  103  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5003  ABC transporter related  26.02 
 
 		 551 aa  103  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.185107 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  23.99 
 
 		 586 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4939  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.54 
 
 		 555 aa  102  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4991  putative ABC transporter ATP-binding protein  23.94 
 
 		 555 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0379  ABC transporter related  23.46 
 
 		 464 aa  103  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04267  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  24.54 
 
 		 555 aa  102  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3606  ABC transporter related protein  24.54 
 
 		 555 aa  102  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1225  ABC transporter, ATP-binding protein  24.86 
 
 		 623 aa  102  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.701491 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5906  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.54 
 
 		 555 aa  102  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0495  ABC transporter, ATP-binding protein  25.88 
 
 		 514 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04232  hypothetical protein  24.54 
 
 		 555 aa  102  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3074  ABC transporter related  26.97 
 
 		 552 aa  102  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.0994868 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>