More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1961 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1961  dihydroorotase  100 
 
 		 383 aa  785    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.608866 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1675  amidohydrolase  55.84 
 
 		 384 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.717756  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1448  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.19 
 
 		 399 aa  151  1e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1734  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.73 
 
 		 422 aa  150  4e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.409452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1159  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.92 
 
 		 431 aa  145  2e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.120119  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0488  dihydroorotase  27.84 
 
 		 442 aa  143  6e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.04796 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0848  dihydroorotase, multifunctional complex type  27.67 
 
 		 421 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0540  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.98 
 
 		 431 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0914716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  28.76 
 
 		 441 aa  139  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1082  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.43 
 
 		 377 aa  137  2e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0950128 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1019  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.08 
 
 		 412 aa  137  5e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00940822  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  28.8 
 
 		 446 aa  136  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  29.97 
 
 		 442 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1118  dihydroorotase  28.5 
 
 		 444 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0814  dihydroorotase  28.61 
 
 		 445 aa  134  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000170879 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  27.83 
 
 		 445 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  28.34 
 
 		 446 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  28.53 
 
 		 465 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  27.6 
 
 		 444 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  28.08 
 
 		 446 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  29.95 
 
 		 446 aa  130  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  27.96 
 
 		 444 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  27.35 
 
 		 442 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  28.57 
 
 		 444 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4303  dihydroorotase  28.26 
 
 		 445 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  29.3 
 
 		 456 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2147  amidohydrolase  31.96 
 
 		 383 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  28.3 
 
 		 440 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  29.3 
 
 		 456 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  29.3 
 
 		 456 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  27.49 
 
 		 441 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4419  dihydroorotase  27.19 
 
 		 437 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1320  dihydroorotase  29.07 
 
 		 423 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4018  dihydroorotase  27.47 
 
 		 464 aa  126  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0224  dihydroorotase  30.63 
 
 		 395 aa  125  9e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0386009 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0784  amidohydrolase  30.25 
 
 		 407 aa  125  9e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.84947 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  27.73 
 
 		 444 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4483  dihydroorotase  26.95 
 
 		 437 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  28.57 
 
 		 444 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.61 
 
 		 433 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1306  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.61 
 
 		 431 aa  123  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1965  amidohydrolase  31.12 
 
 		 378 aa  124  4e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0906256  hitchhiker  0.000000000345538 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0154  dihydroorotase (DHOase)  27.66 
 
 		 425 aa  123  5e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0741809  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2040  chaperone protein HtpG (heat shock protein htpG; high temperatureprotein G)  27.39 
 
 		 425 aa  123  5e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.245772  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  29.25 
 
 		 458 aa  122  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.13 
 
 		 436 aa  122  9e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  28.95 
 
 		 429 aa  122  9e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  28.3 
 
 		 444 aa  122  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0816  dihydroorotase, multifunctional complex type  27.67 
 
 		 424 aa  122  9.999999999999999e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0292  dihydroorotase, multifunctional complex type  27.91 
 
 		 442 aa  122  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  28.3 
 
 		 444 aa  122  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0757  dihydroorotase  28.03 
 
 		 455 aa  119  6e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.405973  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  28 
 
 		 445 aa  119  7e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2936  dihydroorotase  27.82 
 
 		 453 aa  119  7e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0120  dihydroorotase  26.21 
 
 		 439 aa  119  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4692  dihydroorotase  25.47 
 
 		 439 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.92 
 
 		 429 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  26.82 
 
 		 468 aa  117  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2177  dihydroorotase  25.97 
 
 		 443 aa  117  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06413  dihydroorotase  26.67 
 
 		 444 aa  117  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1476  dihydroorotase  28.46 
 
 		 426 aa  117  3.9999999999999997e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.379941  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4541  dihydroorotase  28.01 
 
 		 446 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11860  dihydroorotase, multifunctional complex type  27.78 
 
 		 430 aa  115  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0270101  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0363  hypothetical protein  28.37 
 
 		 421 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  28.61 
 
 		 427 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0266  dihydroorotase  27.89 
 
 		 442 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  26.7 
 
 		 426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0326  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.31 
 
 		 425 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.622278  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1285  dihydroorotase  27.42 
 
 		 425 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1260  dihydroorotase  27.42 
 
 		 425 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0553  dihydroorotase  25.53 
 
 		 446 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0259  dihydroorotase  27.7 
 
 		 430 aa  114  2.0000000000000002e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.212286  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0251  dihydroorotase, multifunctional complex type  26.4 
 
 		 418 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  27.01 
 
 		 441 aa  114  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1255  dihydroorotase  26.2 
 
 		 428 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.329387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0660  dihydroorotase, multifunctional complex type  27.53 
 
 		 398 aa  114  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1209  dihydroorotase  25.89 
 
 		 425 aa  114  3e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.242155  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1673  dihydroorotase, multifunctional complex type  27.7 
 
 		 430 aa  113  4.0000000000000004e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.557372  normal  0.0225661 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3986  dihydroorotase  26.54 
 
 		 428 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4357  dihydroorotase  26.61 
 
 		 444 aa  114  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1007  dihydroorotase  25.52 
 
 		 443 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240193  normal  0.0965208 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4426  dihydroorotase  26.78 
 
 		 440 aa  113  5e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0411696  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  26.27 
 
 		 428 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4027  dihydroorotase  26.27 
 
 		 428 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.010656  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  26.01 
 
 		 428 aa  113  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3902  dihydroorotase  26.27 
 
 		 428 aa  113  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000925562 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  28.69 
 
 		 432 aa  113  6e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3933  dihydroorotase  26.27 
 
 		 428 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00841625  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3647  dihydroorotase  26.27 
 
 		 428 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  27.75 
 
 		 425 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3937  dihydroorotase  26.27 
 
 		 428 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00122495  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  24.33 
 
 		 418 aa  112  8.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1650  dihydroorotase, multifunctional complex type  26.13 
 
 		 418 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.549095  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5663  dihydroorotase  29.17 
 
 		 445 aa  112  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  28.19 
 
 		 431 aa  112  9e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3630  dihydroorotase  26.27 
 
 		 428 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0903342  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.16 
 
 		 432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0373  dihydroorotase, multifunctional complex type  26.82 
 
 		 447 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0824446  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1574  dihydroorotase, multifunctional complex type  26.44 
 
 		 431 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  26.54 
 
 		 428 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>