More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1417 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1417  starch synthase  100 
 
 		 564 aa  1154    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000275139  hitchhiker  0.0037483 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1965  Starch synthase  53.79 
 
 		 566 aa  609  1e-173  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00319381  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0968  starch synthase  36.04 
 
 		 482 aa  320  3e-86  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1038  starch synthase  37.27 
 
 		 484 aa  320  6e-86  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000142829 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1308  starch synthase  36.55 
 
 		 482 aa  306  7e-82  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.483213  normal  0.910545 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1878  starch synthase  34.18 
 
 		 482 aa  292  9e-78  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0792  starch synthase  27.98 
 
 		 553 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  24.95 
 
 		 391 aa  111  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  24.21 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  24.44 
 
 		 391 aa  108  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 		 391 aa  106  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  31.7 
 
 		 390 aa  104  4e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06900  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  24.14 
 
 		 478 aa  102  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5314  glycogen synthase  24.87 
 
 		 533 aa  97.4  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  31.91 
 
 		 536 aa  97.4  6e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  33.98 
 
 		 415 aa  97.4  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  26.67 
 
 		 388 aa  96.3  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2286  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  24.2 
 
 		 487 aa  94.4  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  25.68 
 
 		 404 aa  94  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0821  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  24.81 
 
 		 482 aa  90.9  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.173093 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1279  glycogen synthase  24.19 
 
 		 529 aa  90.5  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 		 414 aa  90.5  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0080  glycogen synthase  21.11 
 
 		 476 aa  90.1  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.572578  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0004  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  24.22 
 
 		 482 aa  88.2  3e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0814  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  24.23 
 
 		 488 aa  88.6  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.598674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  26.6 
 
 		 413 aa  88.2  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 		 387 aa  87.8  5e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  28.85 
 
 		 414 aa  87.8  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  36.59 
 
 		 446 aa  87.8  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0998  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  24.34 
 
 		 489 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.710197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1888  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  23.88 
 
 		 490 aa  85.9  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590252  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1798  glycogen synthase  24.5 
 
 		 486 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135455  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 		 395 aa  85.1  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3196  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  23.67 
 
 		 467 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1331  glycogen synthase  24.9 
 
 		 513 aa  84.7  0.000000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.198778  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2935  glycogen synthase  24.77 
 
 		 486 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.540363 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2043  glycogen synthase  23.84 
 
 		 486 aa  84  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.405007  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0106  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  24.32 
 
 		 493 aa  84  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0841  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  23.17 
 
 		 488 aa  83.6  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0251481 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10411  glycogen synthase  23.11 
 
 		 490 aa  83.6  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.951969 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 		 414 aa  83.2  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  38.26 
 
 		 402 aa  82.4  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5336  glycogen synthase  23.55 
 
 		 544 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0149389 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 		 397 aa  82  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0542  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  25.25 
 
 		 490 aa  82  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06741  glycogen synthase  23.12 
 
 		 483 aa  81.3  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.537732  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1890  glycogen synthase  23.48 
 
 		 487 aa  80.9  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.601172 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  36.53 
 
 		 417 aa  80.5  0.00000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  30.67 
 
 		 410 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0244  glycosyl transferase, group 1  33.09 
 
 		 393 aa  79  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.270247 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17040  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  23.73 
 
 		 491 aa  79  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.296873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 		 426 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1691  glycogen synthase  31.48 
 
 		 409 aa  79  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.533865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 		 385 aa  78.6  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4053  glycogen synthase  24 
 
 		 543 aa  78.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  36.11 
 
 		 353 aa  78.2  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3940  glycogen synthase  24 
 
 		 543 aa  78.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06351  glycogen synthase  24.06 
 
 		 483 aa  78.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.150133  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  30.98 
 
 		 413 aa  78.2  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0716  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  23.82 
 
 		 496 aa  78.2  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.692605  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  29.22 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 		 355 aa  77.8  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1538  glycosyl transferase, group 1  31.88 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3501  glycogen synthase  23.19 
 
 		 478 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06651  glycogen synthase  23.88 
 
 		 487 aa  77.8  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.400316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2245  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  24.18 
 
 		 485 aa  77.4  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_48511  predicted protein  24.76 
 
 		 567 aa  77.8  0.0000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0220313  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  38.71 
 
 		 373 aa  77.4  0.0000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18831  glycogen synthase  24.02 
 
 		 499 aa  77.4  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.575027 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1542  glycogen synthase  24.03 
 
 		 486 aa  77.4  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0609  glycogen synthase  24.26 
 
 		 483 aa  77  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.239419  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  23.75 
 
 		 485 aa  77  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3257  glycogen synthase  23.09 
 
 		 484 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0658305  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4618  glycogen synthase  20.94 
 
 		 498 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0045  glycogen synthase  23.5 
 
 		 487 aa  76.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  28.94 
 
 		 425 aa  76.6  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1982  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  23.31 
 
 		 489 aa  76.6  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  24.22 
 
 		 404 aa  76.6  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2742  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  22.1 
 
 		 473 aa  76.6  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.341368  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0858  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  22.51 
 
 		 484 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.335238  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4707  glycogen synthase  20.93 
 
 		 480 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3562  glycosyl transferase group 1  35.08 
 
 		 304 aa  75.5  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.658872 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4596  glycogen synthase  21.13 
 
 		 498 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2057  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  22.55 
 
 		 498 aa  75.5  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0784111  normal  0.49835 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0957  glycogen synthase  25.47 
 
 		 483 aa  75.5  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.220032  normal  0.273541 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 		 417 aa  75.1  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0135  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  23.63 
 
 		 475 aa  74.7  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.990604  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 		 396 aa  74.3  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  28.23 
 
 		 442 aa  74.3  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4977  glycogen synthase  20.83 
 
 		 498 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1126  glycogen synthase  23.9 
 
 		 511 aa  74.3  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.331736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0412  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  23.51 
 
 		 495 aa  73.9  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.724768  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  36 
 
 		 411 aa  73.9  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5006  glycogen synthase  20.99 
 
 		 480 aa  73.6  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4758  glycogen synthase  20.75 
 
 		 498 aa  73.6  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 		 361 aa  73.6  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1194  glycosyl transferase group 1  35.52 
 
 		 355 aa  73.6  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5120  glycogen synthase  20.71 
 
 		 476 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  28.21 
 
 		 935 aa  73.6  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  25.51 
 
 		 387 aa  73.2  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>