191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0959 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0959  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 258 aa  523  1e-147  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00609549  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0556  Radical SAM domain protein  53.26 
 
 		 258 aa  285  5.999999999999999e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.162631  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1782  radical SAM domain-containing protein  55.35 
 
 		 281 aa  246  3e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.425379  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1829  radical SAM domain-containing protein  44.49 
 
 		 276 aa  234  9e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1926  radical SAM domain-containing protein  47.08 
 
 		 288 aa  223  2e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0235565 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1409  radical SAM domain-containing protein  44.53 
 
 		 267 aa  223  2e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47505  normal  0.209816 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0286  radical SAM domain-containing protein  43.58 
 
 		 269 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1163  radical SAM domain-containing protein  47.47 
 
 		 269 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000309895 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1167  radical SAM family protein  40.18 
 
 		 261 aa  168  9e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000379498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0327  Radical SAM domain protein  41.71 
 
 		 281 aa  158  7e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0685  radical SAM domain-containing protein  47.59 
 
 		 294 aa  149  4e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0316247 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0830  radical SAM domain-containing protein  44.57 
 
 		 242 aa  149  4e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0807  radical SAM domain-containing protein  44.57 
 
 		 242 aa  149  4e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0182  radical SAM domain-containing protein  39.05 
 
 		 256 aa  149  6e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0268  radical SAM domain-containing protein  42.7 
 
 		 301 aa  145  8.000000000000001e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.698085  normal  0.0396119 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0739  Radical SAM domain protein  39.07 
 
 		 245 aa  144  1e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.93142  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2078  hypothetical protein  40.56 
 
 		 182 aa  143  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.583376 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0196  radical SAM domain-containing protein  46.01 
 
 		 297 aa  139  3e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1991  radical SAM domain-containing protein  38.22 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1252  radical SAM domain-containing protein  43.98 
 
 		 298 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0620  radical SAM family Fe-S protein  38.66 
 
 		 350 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2906  radical SAM family protein  37.82 
 
 		 306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0630267 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1080  radical SAM family protein  38.14 
 
 		 386 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981176  normal  0.301506 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2292  Radical SAM domain protein  40.21 
 
 		 298 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.699414  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1206  radical SAM family protein  37.7 
 
 		 393 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649327 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1472  Radical SAM domain protein  34.38 
 
 		 270 aa  123  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4362  radical SAM family protein  36.82 
 
 		 387 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16102  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1469  radical SAM family protein  40.57 
 
 		 360 aa  124  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.637197 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0704  radical SAM family protein  38.86 
 
 		 384 aa  123  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.503182  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1946  radical SAM domain-containing protein  38.76 
 
 		 437 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041965 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1225  Radical SAM domain protein  36.76 
 
 		 386 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.931656  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0387  hypothetical protein  37.31 
 
 		 390 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0399  hypothetical protein  37.31 
 
 		 390 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3325  radical SAM family protein  37.32 
 
 		 368 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000113455 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3222  radical SAM family protein  37.25 
 
 		 387 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2341  hypothetical protein  36.82 
 
 		 377 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1433  Radical SAM domain protein  37.17 
 
 		 395 aa  120  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.908326 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1743  Radical SAM domain protein  38.76 
 
 		 375 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.106017  normal  0.444535 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2104  Radical SAM domain protein  36.27 
 
 		 380 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124136  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1768  radical SAM domain-containing protein  36.27 
 
 		 374 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.938086 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2123  radical SAM domain-containing protein  38.29 
 
 		 362 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0508  radical SAM domain-containing protein  35.6 
 
 		 390 aa  119  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233922  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0798  radical SAM domain-containing protein  37.71 
 
 		 362 aa  119  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.442309 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0707  radical SAM domain-containing protein  37.93 
 
 		 421 aa  118  7e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0399019  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03695  radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 356 aa  118  7.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0561  Radical SAM domain protein  38.98 
 
 		 385 aa  118  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0742  radical SAM family protein  37.82 
 
 		 361 aa  118  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.669971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1266  radical SAM family protein  38.6 
 
 		 360 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.249898 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1011  radical SAM domain-containing protein  36.57 
 
 		 301 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0517  Radical SAM domain protein  38.42 
 
 		 385 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.619466 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0937  hypothetical protein  37.36 
 
 		 385 aa  116  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388526  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1693  Radical SAM domain protein  38.62 
 
 		 364 aa  115  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637102  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1060  Radical SAM domain protein  39.77 
 
 		 361 aa  115  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0547  radical SAM domain-containing protein  36.7 
 
 		 362 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2600  DNA repair photolyase  36.1 
 
 		 386 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.64054  normal  0.361396 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0015  Radical SAM domain protein  37.19 
 
 		 363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.811476  hitchhiker  0.00130653 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0619  hypothetical protein  34.43 
 
 		 290 aa  113  3e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0708  radical SAM domain-containing protein  36.7 
 
 		 362 aa  113  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1419  radical SAM domain-containing protein  38.46 
 
 		 359 aa  113  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0587  radical SAM family protein  36.65 
 
 		 392 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1066  radical SAM domain-containing protein  36.65 
 
 		 392 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1025  radical SAM domain-containing protein  36.65 
 
 		 388 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2091  Radical SAM domain protein  37.17 
 
 		 295 aa  112  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000137131  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2299  radical SAM domain-containing protein  32.13 
 
 		 309 aa  112  7.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.002919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0922  radical SAM domain-containing protein  35.05 
 
 		 387 aa  112  7.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.56559  normal  0.49234 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0083  radical SAM family protein  35.63 
 
 		 352 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0946  radical SAM domain-containing protein  37.43 
 
 		 392 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4180  radical SAM family protein  38.6 
 
 		 391 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1769  Radical SAM domain protein  34.17 
 
 		 352 aa  111  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0452  radical SAM domain-containing protein  34.03 
 
 		 385 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.290609 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3135  radical SAM family protein  37.26 
 
 		 365 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.787669  normal  0.057986 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2176  radical SAM domain-containing protein  38.38 
 
 		 372 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2509  hypothetical protein  35.65 
 
 		 366 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.690045 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2237  radical SAM domain-containing protein  35.6 
 
 		 392 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2403  radical SAM domain-containing protein  37.57 
 
 		 389 aa  109  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0942  radical SAM domain-containing protein  36.84 
 
 		 392 aa  108  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1658  radical SAM domain-containing protein  36.78 
 
 		 376 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4466  radical SAM domain-containing protein  34.06 
 
 		 353 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2972  radical SAM domain-containing protein  36.78 
 
 		 385 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3675  radical SAM domain-containing protein  38.05 
 
 		 371 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.852388 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1314  Radical SAM domain protein  36.92 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.263305 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0556  Radical SAM domain protein  38.15 
 
 		 359 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6071  Radical SAM domain protein  40.8 
 
 		 372 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2549  radical SAM domain-containing protein  36.78 
 
 		 385 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22398  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0923  radical SAM domain-containing protein  36.78 
 
 		 385 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2862  radical SAM domain-containing protein  36.78 
 
 		 383 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22952  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2923  radical SAM domain-containing protein  36.78 
 
 		 385 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0224  radical SAM domain-containing protein  36.78 
 
 		 385 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1617  radical SAM family protein  36.6 
 
 		 415 aa  107  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0334  Radical SAM domain protein  34.55 
 
 		 357 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0117  radical SAM domain-containing protein  37.24 
 
 		 352 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.190485 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1083  Radical SAM domain protein  36.36 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.156196  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5254  radical SAM domain protein  35.26 
 
 		 352 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0113  radical SAM domain-containing protein  36.87 
 
 		 352 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412834 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1698  transporter  32.39 
 
 		 325 aa  106  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2803  radical SAM domain-containing protein  37.93 
 
 		 402 aa  106  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.246146 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2293  Radical SAM domain protein  37.93 
 
 		 385 aa  106  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.972622  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1721  radical SAM domain-containing protein  34.69 
 
 		 302 aa  105  5e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0406  radical SAM domain-containing protein  36.21 
 
 		 374 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3344  Radical SAM domain protein  32.98 
 
 		 362 aa  105  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000768449  normal  0.0781434 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>