More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2438 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2438  3-dehydroquinate dehydratase type II  100 
 
 		 146 aa  296  4e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0996759  normal  0.483602 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2471  3-dehydroquinate dehydratase, type II  79.72 
 
 		 145 aa  213  5e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0135177 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1733  3-dehydroquinate dehydratase  65 
 
 		 161 aa  191  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  57.14 
 
 		 145 aa  164  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  57.14 
 
 		 145 aa  164  5.9999999999999996e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  55.71 
 
 		 145 aa  163  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  54.23 
 
 		 148 aa  156  9e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2272  3-dehydroquinate dehydratase  55.8 
 
 		 176 aa  155  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156045  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2433  3-dehydroquinate dehydratase  59.7 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.587468  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1397  3-dehydroquinate dehydratase  55.07 
 
 		 154 aa  154  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000192408  normal  0.601404 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3018  3-dehydroquinate dehydratase  54.35 
 
 		 151 aa  153  6e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.572032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2433  3-dehydroquinate dehydratase  53.15 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2207  3-dehydroquinate dehydratase  54.23 
 
 		 144 aa  150  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121431  normal  0.285231 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  55.71 
 
 		 155 aa  150  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.32 
 
 		 145 aa  150  5e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0045  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.77 
 
 		 144 aa  150  5.9999999999999996e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1751  3-dehydroquinate dehydratase  50.72 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.235606 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4097  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.34 
 
 		 165 aa  149  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.517045  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 146 aa  148  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5032  3-dehydroquinate dehydratase  47.97 
 
 		 151 aa  149  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2077  3-dehydroquinate dehydratase  52.86 
 
 		 150 aa  148  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.556948  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2391  3-dehydroquinate dehydratase  52.82 
 
 		 147 aa  148  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4214  3-dehydroquinate dehydratase  52.9 
 
 		 163 aa  149  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2715  3-dehydroquinate dehydratase  51.39 
 
 		 151 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2360  3-dehydroquinate dehydratase  54.2 
 
 		 149 aa  148  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.896861  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1714  3-dehydroquinate dehydratase  58.02 
 
 		 145 aa  147  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.011115  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  53.85 
 
 		 148 aa  147  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1521  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 148 aa  147  6e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5252  3-dehydroquinate dehydratase  51.8 
 
 		 146 aa  147  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.667512  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  51.49 
 
 		 152 aa  147  6e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0904  3-dehydroquinate dehydratase  52.9 
 
 		 176 aa  147  7e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0908  3-dehydroquinate dehydratase  52.9 
 
 		 157 aa  146  8e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1044  3-dehydroquinate dehydratase  53.73 
 
 		 148 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.983383  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0204  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.34 
 
 		 147 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4902  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 146 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2867  3-dehydroquinate dehydratase  52.9 
 
 		 151 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.17 
 
 		 152 aa  145  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0695  3-dehydroquinate dehydratase  49.3 
 
 		 144 aa  146  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103169  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2566  3-dehydroquinate dehydratase  49.31 
 
 		 147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2178  3-dehydroquinate dehydratase  47.92 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2187  3-dehydroquinate dehydratase  50.72 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.379626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0695  3-dehydroquinate dehydratase  47.22 
 
 		 146 aa  144  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114768  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  55.22 
 
 		 147 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50 
 
 		 145 aa  144  5e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  54.29 
 
 		 158 aa  143  6e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1456  3-dehydroquinate dehydratase  55.22 
 
 		 145 aa  143  7.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.903143  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3860  3-dehydroquinate dehydratase  58.02 
 
 		 148 aa  143  8.000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0470796 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3205  3-dehydroquinate dehydratase  50.7 
 
 		 148 aa  142  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087334 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12557  3-dehydroquinate dehydratase  52.86 
 
 		 147 aa  142  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000372311  normal  0.0899495 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2407  3-dehydroquinate dehydratase  51.75 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0668809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2104  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 148 aa  142  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3288  3-dehydroquinate dehydratase  51.75 
 
 		 152 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1610  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 148 aa  141  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0468975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15470  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 		 143 aa  141  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.363675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1276  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000824277  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1848  3-dehydroquinate dehydratase  52.9 
 
 		 143 aa  141  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2094  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50 
 
 		 142 aa  140  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2950  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.35 
 
 		 149 aa  140  6e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000135436  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  51.05 
 
 		 148 aa  140  7e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2491  3-dehydroquinate dehydratase  48.55 
 
 		 147 aa  140  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254685  normal  0.906535 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2041  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 149 aa  140  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775923 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3467  3-dehydroquinate dehydratase  45.14 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2097  3-dehydroquinate dehydratase  50.75 
 
 		 153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2302  3-dehydroquinate dehydratase  48.59 
 
 		 177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.708414  hitchhiker  0.00337586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5387  3-dehydroquinate dehydratase  52.52 
 
 		 153 aa  138  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.878433  normal  0.435849 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0544  3-dehydroquinate dehydratase  46.85 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0344  3-dehydroquinate dehydratase  51.06 
 
 		 151 aa  138  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960001  normal  0.658958 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  56.72 
 
 		 184 aa  137  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2893  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 146 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1841  3-dehydroquinate dehydratase  52.17 
 
 		 143 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.226528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5319  3-dehydroquinate dehydratase  47.59 
 
 		 149 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1913  3-dehydroquinate dehydratase  48.97 
 
 		 152 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1003  3-dehydroquinate dehydratase  52.99 
 
 		 150 aa  137  6e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0845  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50 
 
 		 145 aa  137  6e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  47.92 
 
 		 193 aa  137  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0417  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 149 aa  137  7e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4700  3-dehydroquinate dehydratase  53.23 
 
 		 130 aa  137  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0672419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1540  3-dehydroquinate dehydratase  53.73 
 
 		 156 aa  137  7e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0606879 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0610  3-dehydroquinate dehydratase  46.53 
 
 		 148 aa  137  7e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0668  3-dehydroquinate dehydratase  51.39 
 
 		 156 aa  137  7e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6532  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 		 144 aa  137  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446756  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5193  3-dehydroquinate dehydratase  51.06 
 
 		 151 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0932  3-dehydroquinate dehydratase  51.37 
 
 		 151 aa  136  7.999999999999999e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  54.48 
 
 		 147 aa  136  7.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  55.22 
 
 		 150 aa  136  8.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  54.48 
 
 		 150 aa  136  8.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38070  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 147 aa  136  8.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.633165  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2396  3-dehydroquinate dehydratase  51.47 
 
 		 145 aa  136  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0780145  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 151 aa  136  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0579  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 193 aa  135  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3376  3-dehydroquinate dehydratase  49.29 
 
 		 147 aa  136  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  52.99 
 
 		 144 aa  136  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2754  3-dehydroquinate dehydratase  48.91 
 
 		 151 aa  135  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  47.76 
 
 		 149 aa  136  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  48.59 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  51.45 
 
 		 146 aa  136  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3063  3-dehydroquinate dehydratase  51.06 
 
 		 151 aa  135  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816098  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2355  3-dehydroquinate dehydratase  51.47 
 
 		 145 aa  135  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.547527  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2402  3-dehydroquinate dehydratase  51.47 
 
 		 145 aa  135  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0545033 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5304  3-dehydroquinate dehydratase  51.06 
 
 		 151 aa  135  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0349681 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>