More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1697 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1697  PfkB domain-containing protein  100 
 
 
337 aa  671    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5700  PfkB domain protein  56.93 
 
 
335 aa  394  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.738338  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1617  hypothetical protein  38.35 
 
 
628 aa  233  3e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1622  hypothetical protein  38.35 
 
 
628 aa  232  5e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7803  PfkB domain protein  39.77 
 
 
640 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2315  ribokinase-like domain-containing protein  38.57 
 
 
636 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0076  myo-inositol catabolism IolC protein  38.04 
 
 
634 aa  213  3.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1676  ribokinase-like domain-containing protein  39.26 
 
 
635 aa  212  9e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3547  ribokinase-like domain-containing protein  38.9 
 
 
646 aa  209  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3837  ribokinase-like domain-containing protein  37.68 
 
 
633 aa  209  8e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27619  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50040  myo-inositol catabolism protein IolC  39.12 
 
 
647 aa  202  5e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3562  ribokinase-like domain-containing protein  36.99 
 
 
655 aa  200  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.249096 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  36.34 
 
 
642 aa  194  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1594  ribokinase-like domain-containing protein  34.27 
 
 
652 aa  192  5e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3334  PfkB domain protein  34.97 
 
 
647 aa  192  5e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0303  myo-inositol catabolism protein  34.49 
 
 
636 aa  192  6e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1341  PfkB domain protein  35.26 
 
 
634 aa  191  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0065  ribokinase-like domain-containing protein  36.03 
 
 
674 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4660  ribokinase-like domain-containing protein  33.91 
 
 
642 aa  190  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2996  Protein of unknown function DUF2090  34.97 
 
 
634 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0662  PfkB domain-containing protein  37.73 
 
 
327 aa  189  7e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478793  normal  0.638402 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3500  iolC protein  35.95 
 
 
645 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.782212  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2969  PfkB family kinase  34.1 
 
 
654 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2333  iolC protein  34.76 
 
 
332 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2296  myo-inositol catabolism protein  34.76 
 
 
332 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.192741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2512  myo-inositol catabolism protein IolC  34.76 
 
 
332 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3041  ribokinase-like domain-containing protein  33.82 
 
 
656 aa  187  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3274  carbohydrate kinase, PfkB  35.95 
 
 
645 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0475711  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4711  PfkB domain protein  34.57 
 
 
643 aa  185  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00995478  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  33.54 
 
 
338 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0300  myo-inositol catabolism protein  33.84 
 
 
332 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2252  carbohydrate kinase; myo-inositol catabolism protein  33.84 
 
 
332 aa  182  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.608064  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1240  transferase kinase protein  36.63 
 
 
650 aa  180  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1870  PfkB family kinase  33.82 
 
 
625 aa  181  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0201058 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0982  PfkB domain protein  35.26 
 
 
644 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1303  ribokinase-like domain-containing protein  37.32 
 
 
651 aa  179  7e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  35.33 
 
 
645 aa  179  8e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1342  ribokinase-like domain-containing protein  37.03 
 
 
651 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1135  PfkB domain protein  35.65 
 
 
644 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.488845 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0820  ribokinase-like domain-containing protein  34.23 
 
 
364 aa  177  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1600  ribokinase-like domain-containing protein  34.21 
 
 
670 aa  177  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161608  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4542  PfkB domain protein  35.54 
 
 
317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3703  PfkB  34.91 
 
 
630 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830468  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1892  ribokinase-like domain-containing protein  37.72 
 
 
651 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.333312 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2809  PfkB domain protein  34.3 
 
 
681 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760381  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1326  putative myo-inositol catabolism LolC protein  34.59 
 
 
680 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4567  PfkB family carbohydrate kinase  36.34 
 
 
652 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1803  ribokinase-like domain-containing protein  35.24 
 
 
349 aa  171  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.453248 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3314  ribokinase-like domain-containing protein  35.59 
 
 
646 aa  171  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1401  ribokinase-like domain-containing protein  36.34 
 
 
651 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0941  PfkB  36.34 
 
 
651 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00555431  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1423  ribokinase-like domain-containing protein  36.34 
 
 
651 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0937  PfkB domain protein  34.41 
 
 
338 aa  170  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2647  iolC protein  37.36 
 
 
666 aa  169  9e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146165  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0913  iolC protein  37.07 
 
 
666 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1831  iolC protein  37.07 
 
 
666 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.463805  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0985  ribokinase-like domain-containing protein  34.59 
 
 
659 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1444  iolC protein  37.07 
 
 
666 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.640476  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0436  iolC protein  37.07 
 
 
666 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.171756  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1655  iolC protein  37.07 
 
 
666 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1677  iolC protein  37.07 
 
 
666 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0726  iolC protein  37.07 
 
 
666 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179784  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4016  ribokinase-like domain-containing protein  34.53 
 
 
322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.213483 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5563  ribokinase-like domain-containing protein  35.89 
 
 
320 aa  166  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4018  PfkB domain protein  31.07 
 
 
338 aa  166  5e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00301504  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5449  PfkB domain protein  35.29 
 
 
312 aa  165  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443082  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4488  PfkB domain protein  35.65 
 
 
314 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3303  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8494  ribokinase-like domain-containing protein  36.47 
 
 
321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.57227 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2602  ribokinase-like domain-containing protein  34.45 
 
 
323 aa  162  9e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.386766  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3605  PfkB domain protein  33.53 
 
 
336 aa  161  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3078  PfkB domain-containing protein  37.39 
 
 
314 aa  158  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4189  PfkB domain protein  33.53 
 
 
317 aa  154  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1365  PfkB domain protein  34.76 
 
 
321 aa  153  5e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3349  PfkB  31.9 
 
 
324 aa  152  7e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0814732  normal  0.201328 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4059  PfkB domain protein  34.74 
 
 
325 aa  150  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.867831 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2742  PfkB domain protein  35.87 
 
 
320 aa  150  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0725  PfkB domain protein  34.67 
 
 
322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1268  PfkB domain protein  31.6 
 
 
333 aa  134  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.63046  normal  0.760626 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  29.25 
 
 
320 aa  121  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  29 
 
 
308 aa  120  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  27.63 
 
 
319 aa  118  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  31.31 
 
 
329 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  29.39 
 
 
320 aa  116  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1419  PfkB  30.24 
 
 
326 aa  115  7.999999999999999e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.204315  normal  0.109001 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  28.2 
 
 
326 aa  115  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2528  protein IolC  34.31 
 
 
207 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000240198 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  27.58 
 
 
315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  30.23 
 
 
337 aa  114  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6848  PfkB domain protein  33.54 
 
 
323 aa  113  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.71176  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  31.58 
 
 
323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  33.33 
 
 
319 aa  110  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  27.27 
 
 
315 aa  109  6e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  28.57 
 
 
323 aa  108  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  27.51 
 
 
322 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  26.47 
 
 
323 aa  107  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4085  PfkB domain protein  26.27 
 
 
322 aa  106  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.212948  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0025  ribokinase-like domain-containing protein  24.92 
 
 
307 aa  105  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.112625  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  31.1 
 
 
306 aa  105  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  27.24 
 
 
319 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  24.62 
 
 
323 aa  103  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>