More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1106 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1106  ribonuclease PH  100 
 
 		 238 aa  482  1e-135  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1177  ribonuclease PH  76.07 
 
 		 235 aa  372  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.217753 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3656  ribonuclease PH  48.25 
 
 		 250 aa  208  5e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00626897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0519  ribonuclease PH  44.9 
 
 		 250 aa  201  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000647915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1952  ribonuclease PH  45.89 
 
 		 258 aa  201  9.999999999999999e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00230423  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0188  ribonuclease PH  42.68 
 
 		 263 aa  199  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00190846  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0551  ribonuclease PH  43.27 
 
 		 261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0837  ribonuclease PH  42.79 
 
 		 258 aa  198  5e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5092  ribonuclease PH  45.18 
 
 		 239 aa  198  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000962489  normal  0.0400034 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2001  ribonuclease PH  46.72 
 
 		 245 aa  198  6e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0484404 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2086  ribonuclease PH  48.5 
 
 		 237 aa  197  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  50 
 
 		 239 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4386  ribonuclease PH  48.93 
 
 		 239 aa  196  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0782226 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  49.58 
 
 		 239 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3937  ribonuclease PH  47.73 
 
 		 261 aa  196  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.510656  normal  0.641897 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1525  ribonuclease PH  44.3 
 
 		 246 aa  194  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.037998  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4287  ribonuclease PH  45.61 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0705  ribonuclease PH  45.34 
 
 		 241 aa  192  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2089  ribonuclease PH  43.61 
 
 		 238 aa  192  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.504457  normal  0.102382 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3965  ribonuclease PH  45.38 
 
 		 238 aa  192  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0503837  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0857  ribonuclease PH  43.28 
 
 		 255 aa  192  5e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0105956  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15390  ribonuclease PH  46.29 
 
 		 246 aa  191  6e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.547924  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0179  ribonuclease PH  49.15 
 
 		 240 aa  191  6e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  hitchhiker  0.00000767641 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2030  ribonuclease PH  45.02 
 
 		 244 aa  191  7e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0850  ribonuclease PH  44.54 
 
 		 256 aa  191  8e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2256  ribonuclease PH  44.78 
 
 		 238 aa  191  8e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000012272  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3933  ribonuclease PH  45.38 
 
 		 238 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310122  hitchhiker  0.0000391387 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5294  ribonuclease PH  46.89 
 
 		 240 aa  190  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.475514 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4014  ribonuclease PH  45.38 
 
 		 238 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0077  ribonuclease PH  47.3 
 
 		 240 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0213  ribonuclease PH  47.3 
 
 		 240 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4060  ribonuclease PH  45.38 
 
 		 238 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.944116 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4121  ribonuclease PH  45.38 
 
 		 238 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.790075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5342  ribonuclease PH  47.3 
 
 		 240 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.452896  normal  0.0235575 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5202  ribonuclease PH  46.89 
 
 		 240 aa  190  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.883526  normal  0.399595 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0852  ribonuclease PH  46.52 
 
 		 238 aa  190  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3951  ribonuclease PH  45.38 
 
 		 238 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1338  ribonuclease PH  45.45 
 
 		 240 aa  189  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0096  ribonuclease PH  44.96 
 
 		 238 aa  190  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.50257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2536  ribonuclease PH  42.02 
 
 		 248 aa  189  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0273793  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5547  ribonuclease PH  48.72 
 
 		 240 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4395  ribonuclease PH  47.6 
 
 		 238 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00847728  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11370  ribonuclease PH  47.19 
 
 		 259 aa  189  4e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.358864 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1100  ribonuclease PH  41.74 
 
 		 241 aa  188  5e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1072  ribonuclease PH  41.74 
 
 		 239 aa  189  5e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0967941  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02850  ribonuclease PH  47.08 
 
 		 239 aa  188  5.999999999999999e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4282  ribonuclease PH  44.3 
 
 		 237 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.887311  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0595  ribonuclease PH  41.74 
 
 		 231 aa  188  5.999999999999999e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4106  ribonuclease PH  48.08 
 
 		 238 aa  188  5.999999999999999e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0374298  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00648  ribonuclease PH  44.12 
 
 		 240 aa  188  5.999999999999999e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0957  ribonuclease PH  46.12 
 
 		 246 aa  188  7e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.88797  normal  0.461387 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0518  ribonuclease PH  46.12 
 
 		 246 aa  188  7e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0997  ribonuclease PH  46.12 
 
 		 246 aa  188  7e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0869  ribonuclease PH  45.69 
 
 		 246 aa  188  8e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001827  ribonuclease PH  44.12 
 
 		 238 aa  187  8e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0308379  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4361  ribonuclease PH  43.93 
 
 		 239 aa  188  8e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  hitchhiker  0.00892611 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0857  ribonuclease PH  45.69 
 
 		 246 aa  188  8e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08370  RNAse PH  45.26 
 
 		 254 aa  187  9e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03500  ribonuclease PH  44.96 
 
 		 238 aa  187  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0681369  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1289  ribonuclease PH  42.17 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3978  ribonuclease PH  44.96 
 
 		 238 aa  187  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.055913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0068  ribonuclease PH  44.96 
 
 		 238 aa  187  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  hitchhiker  0.000000182868 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4105  ribonuclease PH  45.26 
 
 		 243 aa  187  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12332  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3852  ribonuclease PH  44.96 
 
 		 238 aa  187  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0309904  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4068  ribonuclease PH  44.96 
 
 		 238 aa  187  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.010474  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1339  ribonuclease PH  45.38 
 
 		 243 aa  187  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1204  ribonuclease PH  45.92 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0276527  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5013  ribonuclease PH  44.96 
 
 		 238 aa  187  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4144  ribonuclease PH  44.96 
 
 		 238 aa  187  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00364124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0062  ribonuclease PH  44.96 
 
 		 238 aa  186  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2600  ribonuclease PH  41.15 
 
 		 255 aa  186  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03452  hypothetical protein  48.56 
 
 		 230 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0505808  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1584  ribonuclease PH  45.15 
 
 		 243 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1629  ribonuclease PH  44.35 
 
 		 243 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230363  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2951  ribonuclease PH  44.73 
 
 		 243 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.304043  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0320  ribonuclease PH  45.15 
 
 		 237 aa  186  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3425  ribonuclease PH  45.8 
 
 		 238 aa  185  4e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0903  ribonuclease PH  42.92 
 
 		 246 aa  185  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.398117  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2098  ribonuclease PH  44.3 
 
 		 243 aa  185  6e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2646  ribonuclease PH  44.3 
 
 		 243 aa  185  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3051  ribonuclease PH  44.3 
 
 		 243 aa  185  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0153  ribonuclease PH  44.12 
 
 		 238 aa  185  6e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1966  ribonuclease PH  44.3 
 
 		 243 aa  185  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.211424  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3017  ribonuclease PH  44.3 
 
 		 243 aa  185  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109379  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0813  ribonuclease PH  44.3 
 
 		 243 aa  185  6e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.696355  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4256  ribonuclease PH  46.88 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0056  ribonuclease PH  49.02 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.187742  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0049  ribonuclease PH  49.02 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0477  RNAse PH  46.93 
 
 		 244 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2074  ribonuclease PH  46.35 
 
 		 243 aa  184  1.0000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0456  ribonuclease PH  47.32 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1352  ribonuclease PH  42.49 
 
 		 240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000399193  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2240  ribonuclease PH  40.34 
 
 		 248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000519616  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3836  ribonuclease PH  49.04 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1294  ribonuclease PH  47.62 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4160  ribonuclease PH  49.02 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40103  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3070  ribonuclease PH  45.49 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000996913 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0523  ribonuclease PH  43.48 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04048  ribonuclease PH  44.3 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2671  ribonuclease PH  42.98 
 
 		 247 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>