More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0294 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0294  Heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 
65 aa  132  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0131  Heavy metal transport/detoxification protein  72.58 
 
 
67 aa  89.4  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  54.1 
 
 
833 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0090  heavy metal transport/detoxification protein  53.97 
 
 
72 aa  66.6  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4520  heavy metal transport/detoxification protein  50.77 
 
 
97 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2344  heavy metal transport/detoxification protein  47.69 
 
 
100 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177246  normal  0.640868 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0926  Heavy metal transport/detoxification protein  54.84 
 
 
68 aa  64.7  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1538  Heavy metal transport/detoxification protein  51.67 
 
 
74 aa  63.9  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0133712 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1862  heavy metal-binding protein, putative  51.67 
 
 
74 aa  63.9  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3726  copper ion binding protein  50.85 
 
 
64 aa  63.9  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.663439  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2554  heavy metal transport/detoxification protein  52.38 
 
 
67 aa  63.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1467  heavy metal transport/detoxification protein  47.76 
 
 
97 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1031  copper-translocating P-type ATPase  50 
 
 
913 aa  62.4  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  50.82 
 
 
835 aa  62  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0165  putative mercuric reductase  51.47 
 
 
561 aa  60.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2338  putative mercuric reductase  51.47 
 
 
561 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243851  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6495  putative mercuric reductase  51.47 
 
 
561 aa  60.8  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1209  mercuric reductase  50 
 
 
565 aa  61.2  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.375903  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6174  putative mercuric reductase  51.47 
 
 
561 aa  60.8  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00111286  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6183  putative mercuric reductase  51.47 
 
 
561 aa  60.8  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00236829  unclonable  0.0000000913433 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0104  putative mercuric reductase  51.47 
 
 
561 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.57639  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3299  heavy metal translocating P-type ATPase  50 
 
 
1182 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741237  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15460  putative mercuric reductase  51.47 
 
 
561 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000698922  unclonable  2.1869799999999998e-21 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  48.39 
 
 
65 aa  60.5  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3586  heavy metal translocating P-type ATPase  46.15 
 
 
824 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845066  hitchhiker  0.000954776 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  49.18 
 
 
67 aa  59.7  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  47.46 
 
 
839 aa  59.3  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2449  Heavy metal transport/detoxification protein  46.03 
 
 
64 aa  58.9  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228051  normal  0.0680079 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0406  copper-translocating P-type ATPase  47.54 
 
 
762 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369581 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2228  putative mercuric reductase  51.47 
 
 
561 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  46.77 
 
 
855 aa  58.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2133  putative mercuric reductase  47.06 
 
 
564 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0045  putative mercuric reductase  47.06 
 
 
564 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00619698  normal  0.422186 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0577  copper exporting ATPase  45.16 
 
 
834 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0962  copper exporting ATPase  46.67 
 
 
832 aa  58.5  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.220688  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0563  copper exporting ATPase  45.16 
 
 
834 aa  58.2  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  47.54 
 
 
762 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3132  copper exporting ATPase  45.16 
 
 
834 aa  58.2  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.142794  hitchhiker  0.000000556714 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0523  copper exporting ATPase  43.08 
 
 
834 aa  58.2  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0387  copper-translocating P-type ATPase  47.54 
 
 
762 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0933  heavy metal transport/detoxification protein  45.16 
 
 
96 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0384  copper-translocating P-type ATPase  47.54 
 
 
767 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000272293 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0447  copper-translocating P-type ATPase  47.54 
 
 
762 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  5.93532e-16 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00435  copper transporter  45.16 
 
 
834 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3126  copper-translocating P-type ATPase  45.16 
 
 
834 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0419  copper exporting ATPase  45.16 
 
 
834 aa  58.2  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  45.16 
 
 
852 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00440  hypothetical protein  45.16 
 
 
834 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  48.44 
 
 
792 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3027  copper-translocating P-type ATPase  46.77 
 
 
939 aa  58.2  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0890  mercuric reductase  50.85 
 
 
66 aa  58.2  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000328424  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0527  copper exporting ATPase  45.16 
 
 
834 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  50 
 
 
814 aa  57  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1916  copper-translocating P-type ATPase  50.79 
 
 
791 aa  57  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  46.88 
 
 
792 aa  57  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3543  heavy metal translocating P-type ATPase  50 
 
 
740 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0545  copper exporting ATPase  46.67 
 
 
833 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0547  copper exporting ATPase  46.67 
 
 
833 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0562  copper exporting ATPase  46.67 
 
 
833 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.304776  normal  0.828863 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  51.67 
 
 
841 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0323  heavy metal transport/detoxification protein  49.21 
 
 
66 aa  56.6  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.228429  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4145  copper-translocating P-type ATPase  42.86 
 
 
778 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.418825  normal  0.147287 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0552  copper exporting ATPase  46.67 
 
 
833 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2388  heavy-metal transporting P-type ATPase  49.21 
 
 
819 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168329  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0606  copper exporting ATPase  46.67 
 
 
833 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0439  heavy metal translocating P-type ATPase  46.15 
 
 
867 aa  56.2  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2139  heavy metal transport/detoxification protein  42.11 
 
 
66 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2317  heavy metal translocating P-type ATPase  46.97 
 
 
829 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1213  putative mercuric reductase  48.53 
 
 
561 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0143  Heavy metal transport/detoxification protein  45.31 
 
 
65 aa  55.5  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.816482  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2118  heavy metal binding protein  50.88 
 
 
67 aa  56.2  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4345  putative mercuric reductase  48.53 
 
 
561 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3243  heavy metal translocating P-type ATPase  47.69 
 
 
841 aa  55.5  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1212  Heavy metal transport/detoxification protein  43.55 
 
 
78 aa  55.1  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3217  heavy metal translocating P-type ATPase  49.21 
 
 
741 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1291  Heavy metal transport/detoxification protein  45.31 
 
 
69 aa  54.7  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0090  putative mercuric reductase  46.88 
 
 
560 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0987  heavy metal translocating P-type ATPase  42.37 
 
 
839 aa  54.7  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000433891  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5373  heavy metal translocating P-type ATPase  46.67 
 
 
937 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.698068 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0162  copper-translocating P-type ATPase  48.39 
 
 
1040 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4827  heavy metal translocating P-type ATPase  46.67 
 
 
946 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2455  Heavy metal transport/detoxification protein  50.82 
 
 
108 aa  54.3  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000343237  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2406  heavy metal binding protein  50.88 
 
 
67 aa  54.7  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4311  putative mercuric reductase  46.77 
 
 
551 aa  54.7  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  48.33 
 
 
833 aa  54.3  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  47.37 
 
 
826 aa  54.3  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2074  Heavy metal transport/detoxification protein  53.23 
 
 
68 aa  53.9  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  38.33 
 
 
65 aa  53.9  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5366  heavy metal translocating P-type ATPase  46.77 
 
 
1021 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5494  heavy metal translocating P-type ATPase  46.77 
 
 
1021 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0117323  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2448  heavy metal-binding protein, putative  53.23 
 
 
68 aa  53.9  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4316  heavy metal translocating P-type ATPase  44.62 
 
 
835 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1265  copper exporting ATPase  46.77 
 
 
955 aa  53.9  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.057349 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1097  copper exporting ATPase  45.16 
 
 
907 aa  53.9  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3027  copper exporting ATPase  46.77 
 
 
955 aa  53.9  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4777  heavy metal translocating P-type ATPase  46.77 
 
 
1013 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.701128 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3165  copper exporting ATPase  46.77 
 
 
961 aa  53.5  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.517155  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1340  putative mercuric reductase  43.94 
 
 
562 aa  53.5  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.657387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  39.68 
 
 
67 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  39.68 
 
 
67 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0422606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>