119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2406 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2406  heavy metal binding protein  100 
 
 		 67 aa  126  9.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2118  heavy metal binding protein  98.51 
 
 		 67 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2455  Heavy metal transport/detoxification protein  45.16 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000343237  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1952  putative cation-transporting ATPase membrane protein  39.39 
 
 		 724 aa  54.7  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.51624  normal  0.45395 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0294  Heavy metal transport/detoxification protein  50.88 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0987  heavy metal translocating P-type ATPase  38.57 
 
 		 839 aa  52.4  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000433891  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1347  heavy metal translocating P-type ATPase  43.55 
 
 		 730 aa  49.3  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  41.18 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  41.18 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3299  heavy metal translocating P-type ATPase  40.91 
 
 		 1182 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741237  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1388  mercuric reductase  41.79 
 
 		 557 aa  48.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000433137  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0131  Heavy metal transport/detoxification protein  45.61 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2388  heavy-metal transporting P-type ATPase  42.62 
 
 		 819 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168329  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4520  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 97 aa  47  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 		 814 aa  47  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5366  heavy metal translocating P-type ATPase  44.07 
 
 		 1021 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475647  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  37.31 
 
 		 68 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5494  heavy metal translocating P-type ATPase  44.07 
 
 		 1021 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0117323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  39.39 
 
 		 833 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0926  Heavy metal transport/detoxification protein  46.77 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0162  copper-translocating P-type ATPase  40.62 
 
 		 1040 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4827  heavy metal translocating P-type ATPase  42.37 
 
 		 946 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0982  copper chaperone  30.99 
 
 		 76 aa  45.4  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2139  heavy metal transport/detoxification protein  35.38 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4777  heavy metal translocating P-type ATPase  44.07 
 
 		 1013 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.701128 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5373  heavy metal translocating P-type ATPase  42.37 
 
 		 937 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.698068 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  32.84 
 
 		 77 aa  45.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0571836 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3726  copper ion binding protein  43.86 
 
 		 64 aa  45.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.663439  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2132  heavy metal-binding protein, putative  34.33 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3497  copper ion binding protein  32.84 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.148374  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  37.5 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1538  Heavy metal transport/detoxification protein  44.44 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0133712 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1862  heavy metal-binding protein, putative  44.44 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0141  Heavy metal transport/detoxification protein  42.86 
 
 		 65 aa  44.7  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2344  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 100 aa  44.7  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177246  normal  0.640868 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 833 aa  44.3  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3576  copper-ion-binding protein  31.34 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000264411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3476  copper-ion-binding protein  31.34 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3488  copper-ion-binding protein  31.34 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000382962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3860  copper-ion-binding protein  31.34 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00109748  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4448  heavy metal transport/detoxification protein  37.88 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3780  copper-ion-binding protein  31.34 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441489  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3830  copper-ion-binding protein  31.34 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.42331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1471  copper-ion-binding protein  31.34 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101941  hitchhiker  0.0000119248 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3742  copper-ion-binding protein  31.34 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000142681 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2072  copper-translocating P-type ATPase  41.38 
 
 		 725 aa  43.9  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  33.9 
 
 		 894 aa  43.9  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3586  heavy metal translocating P-type ATPase  38.57 
 
 		 824 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845066  hitchhiker  0.000954776 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  31.82 
 
 		 71 aa  42.7  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1786  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 789 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.143553  normal  0.0746934 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2770  protein of unknown function DUF182  43.33 
 
 		 345 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  44.44 
 
 		 827 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  40.98 
 
 		 841 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  35.48 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1097  copper exporting ATPase  36.21 
 
 		 907 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11220  copper/silver-translocating P-type ATPase  42.86 
 
 		 925 aa  43.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.363514 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0963  Heavy metal transport/detoxification protein  37.1 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.032314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1553  heavy metal translocating P-type ATPase  40.98 
 
 		 859 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.534956  normal  0.0124284 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  41.79 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1851  copper-translocating P-type ATPase  38.24 
 
 		 1061 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.845444  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1872  heavy metal transport/detoxification protein  33.87 
 
 		 74 aa  42  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.230412  unclonable  0.0000667879 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  41.27 
 
 		 855 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0854  copper-translocating P-type ATPase  38.24 
 
 		 1061 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  37.14 
 
 		 817 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1144  copper-translocating P-type ATPase  38.24 
 
 		 1063 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1873  heavy metal translocating P-type ATPase  36.62 
 
 		 821 aa  42.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0405  cation-transporting ATPase membrane protein  38.24 
 
 		 1061 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  33.9 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0021  copper ion binding protein  33.8 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00208737  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2279  copper ion binding protein  35.71 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3759  copper-ion-binding protein  26.87 
 
 		 68 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206021  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1053  heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 		 68 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1755  copper-translocating P-type ATPase  38.24 
 
 		 1061 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.55306  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0890  mercuric reductase  38.46 
 
 		 66 aa  42  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000328424  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1043  hypothetical protein  30.43 
 
 		 75 aa  42  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000664853  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1467  heavy metal transport/detoxification protein  36.92 
 
 		 97 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  33.85 
 
 		 70 aa  42  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0316  cation-transporting ATPase membrane protein  38.24 
 
 		 1063 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.707407  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1877  heavy metal translocating P-type ATPase  35.71 
 
 		 837 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000289142  hitchhiker  0.00605245 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 		 852 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1968  heavy metal transport/detoxification protein  32.81 
 
 		 69 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.563068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  31.75 
 
 		 839 aa  42  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0439  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 867 aa  42  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0654  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  40.91 
 
 		 732 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  35.38 
 
 		 67 aa  41.2  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13340  Heavy metal transport/detoxification protein  32.31 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000868167  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2500  Heavy metal transport/detoxification protein  35.29 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.711261 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  35.38 
 
 		 68 aa  41.2  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1638  putative MerP, periplasmic heavy metal binding/chaperone protein  33.87 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.240185  hitchhiker  0.000119681 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  41.67 
 
 		 792 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  40.91 
 
 		 827 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1150  heavy metal transport/detoxification protein  35.48 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0455128  hitchhiker  0.000000264701 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3258  Heavy metal transport/detoxification protein  38.24 
 
 		 160 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0119  heavy metal translocating P-type ATPase  32.84 
 
 		 816 aa  41.2  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  36.07 
 
 		 835 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  32.35 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2464  heavy metal translocating P-type ATPase  36.11 
 
 		 689 aa  40.8  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.301674  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1546  cation transport ATPase  34.85 
 
 		 742 aa  40.8  0.007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1265  copper exporting ATPase  34.43 
 
 		 955 aa  40.8  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.057349 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>