More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5800 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1904  excinuclease ABC, A subunit  56.83 
 
 		 843 aa  904    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000110525 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3087  excinuclease ABC subunit A  67.47 
 
 		 838 aa  1169    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0102  excinuclease ABC, A subunit  69.86 
 
 		 894 aa  1169    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0951  ABC transporter related  58.51 
 
 		 833 aa  915    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.321909 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19620  excinuclease ABC, A subunit  55.98 
 
 		 863 aa  879    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5906  excinuclease ABC subunit A  70.74 
 
 		 897 aa  1242    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0151  ABC transporter related  91.53 
 
 		 898 aa  1615    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.160582 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6072  ABC transporter related  54.41 
 
 		 827 aa  860    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0838  excinuclease ABC, A subunit  60.49 
 
 		 844 aa  1045    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503748  normal  0.281681 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3139  excinuclease ABC subunit A  70.97 
 
 		 877 aa  1265    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0594  ABC transporter related  57.62 
 
 		 848 aa  920    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.43104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5800  ABC transporter related  100 
 
 		 899 aa  1793    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.177592  normal  0.587186 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4722  excinuclease ABC, A subunit  63.95 
 
 		 861 aa  1114    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286456  normal  0.774067 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3073  excinuclease ABC, A subunit  71.51 
 
 		 950 aa  1258    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0673699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2778  excinuclease ABC, A subunit  67.59 
 
 		 838 aa  1145    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0742019  normal  0.349743 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0918  excinuclease ABC subunit A  72.47 
 
 		 899 aa  1274    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0866  excinuclease ABC, A subunit  60.74 
 
 		 853 aa  1049    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.249589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6311  excinuclease ABC, A subunit  62.44 
 
 		 843 aa  1082    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.420844  normal  0.88955 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2496  excinuclease ABC, A subunit  67.86 
 
 		 838 aa  1177    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4773  excinuclease ABC, A subunit  63.16 
 
 		 850 aa  1080    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.235666  normal  0.0143445 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3664  excinuclease ABC, A subunit  62.49 
 
 		 832 aa  1058    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0603  ABC transporter related  57.62 
 
 		 848 aa  920    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100941  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1839  excinuclease ABC, A subunit  59.98 
 
 		 822 aa  1018    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2009  excinuclease ABC, A subunit  69 
 
 		 880 aa  1127    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0207  ABC transporter related  91.86 
 
 		 898 aa  1581    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.328362  normal  0.710281 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6320  excinuclease ABC, A subunit  71.36 
 
 		 885 aa  1238    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.687364  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03329  putative excinuclease ABC subunit A  54.02 
 
 		 834 aa  924    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3676  excinuclease ABC subunit A  58.08 
 
 		 880 aa  918    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.090284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0906  excinuclease ABC, A subunit  57.59 
 
 		 860 aa  934    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1887  excinuclease ABC, A subunit  54.36 
 
 		 776 aa  819    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.72737 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2636  excinuclease ABC, A subunit  67.47 
 
 		 838 aa  1170    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1787  ABC transporter related  54.48 
 
 		 845 aa  837    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184754  normal  0.778498 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0616  ABC transporter related  57.62 
 
 		 848 aa  920    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2085  excinuclease ABC, A subunit  56.28 
 
 		 851 aa  868    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.56515 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2123  excinuclease ABC, A subunit  70.65 
 
 		 944 aa  1144    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429692 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4737  excinuclease ABC, A subunit  67.59 
 
 		 881 aa  1131    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0337  excinuclease ABC subunit A  39.54 
 
 		 939 aa  556  1e-157  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2024  excinuclease ABC subunit A  43.4 
 
 		 945 aa  553  1e-156  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136428  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2191  excinuclease ABC, A subunit  43.91 
 
 		 946 aa  555  1e-156  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.109423  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0329  excinuclease ABC subunit A  39.14 
 
 		 939 aa  550  1e-155  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2991  excinuclease ABC subunit A  41.02 
 
 		 954 aa  548  1e-154  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.9416  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1999  excinuclease ABC subunit A  42.97 
 
 		 946 aa  545  1e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0576024  normal  0.88061 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3174  excinuclease ABC subunit A  41.55 
 
 		 955 aa  545  1e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13060  Excinuclease ABC subunit A  40.46 
 
 		 968 aa  545  1e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5271  excinuclease ABC subunit A  39.68 
 
 		 958 aa  538  1e-151  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5015  excinuclease ABC subunit A  39.68 
 
 		 958 aa  538  1e-151  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.93666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4844  excinuclease ABC subunit A  39.54 
 
 		 958 aa  537  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4859  excinuclease ABC subunit A  39.54 
 
 		 958 aa  536  1e-151  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5328  excinuclease ABC subunit A  39.54 
 
 		 958 aa  536  1e-151  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5395  excinuclease ABC subunit A  39.68 
 
 		 958 aa  538  1e-151  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5251  excinuclease ABC subunit A  39.68 
 
 		 958 aa  538  1e-151  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5285  excinuclease ABC subunit A  39.54 
 
 		 958 aa  536  1e-151  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1422  excinuclease ABC, A subunit  40.9 
 
 		 963 aa  533  1e-150  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0151035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1437  excinuclease ABC, A subunit  39.33 
 
 		 942 aa  533  1e-150  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3709  excinuclease ABC subunit A  38.96 
 
 		 956 aa  535  1e-150  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3003  excinuclease ABC subunit A  41.89 
 
 		 973 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.855569  normal  0.034696 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2178  excinuclease ABC subunit A  41.82 
 
 		 965 aa  535  1e-150  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5672  excinuclease ABC subunit A  39.41 
 
 		 958 aa  534  1e-150  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11280  excinuclease ABC subunit A  42.02 
 
 		 994 aa  533  1e-150  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.259511  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4958  excinuclease ABC subunit A  38.87 
 
 		 959 aa  534  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1722  excinuclease ABC subunit A  40.74 
 
 		 941 aa  534  1e-150  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1109  excinuclease ABC subunit A  42.49 
 
 		 947 aa  535  1e-150  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.57709  normal  0.229428 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10450  Excinuclease ABC subunit A  39.65 
 
 		 960 aa  534  1e-150  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0436929  hitchhiker  0.0000000651145 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2524  excinuclease ABC subunit A  40.99 
 
 		 1019 aa  534  1e-150  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.247426  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3111  excinuclease ABC subunit A  41.89 
 
 		 987 aa  531  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400929  normal  0.194384 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2343  excinuclease ABC, A subunit  42.73 
 
 		 1004 aa  530  1e-149  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.684635  decreased coverage  0.00406706 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2057  excinuclease ABC subunit A  42.82 
 
 		 965 aa  529  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0577341  normal  0.730418 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1631  excinuclease ABC subunit A  42.76 
 
 		 976 aa  531  1e-149  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.978501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2988  excinuclease ABC subunit A  42.54 
 
 		 973 aa  532  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2016  excinuclease ABC subunit A  42.26 
 
 		 923 aa  530  1e-149  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3137  excinuclease ABC, A subunit  40.52 
 
 		 961 aa  531  1e-149  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.484359  normal  0.0493947 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3339  excinuclease ABC subunit A  41.91 
 
 		 987 aa  531  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.535422  hitchhiker  0.000450974 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3032  excinuclease ABC subunit A  42.54 
 
 		 973 aa  532  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.69865 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4419  excinuclease ABC, A subunit  41.27 
 
 		 1043 aa  526  1e-148  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.834068  normal  0.3832 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0168  excinuclease ABC subunit A  38.85 
 
 		 921 aa  528  1e-148  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0427  excinuclease ABC subunit A  41.32 
 
 		 1011 aa  527  1e-148  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0659788  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0384  excinuclease ABC subunit A  39.71 
 
 		 954 aa  528  1e-148  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000942847  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0255  excinuclease ABC subunit A  41.69 
 
 		 971 aa  528  1e-148  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1949  excinuclease ABC, A subunit  43.2 
 
 		 957 aa  526  1e-148  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0876147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2882  excinuclease ABC, A subunit  41.58 
 
 		 964 aa  528  1e-148  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3065  excinuclease ABC, A subunit  40.05 
 
 		 956 aa  524  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000246359  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1406  excinuclease ABC, A subunit  38.63 
 
 		 935 aa  524  1e-147  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2119  excinuclease ABC, A subunit  38.45 
 
 		 942 aa  523  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000168396  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2038  excinuclease ABC, A subunit  41.71 
 
 		 963 aa  523  1e-147  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225095  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3438  excinuclease ABC, A subunit  40.77 
 
 		 1040 aa  524  1e-147  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160486 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2940  excinuclease ABC subunit A  43.58 
 
 		 995 aa  524  1e-147  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0374  excinuclease ABC subunit A  39.84 
 
 		 952 aa  523  1e-147  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6045  excinuclease ABC subunit A  41.57 
 
 		 946 aa  525  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.834052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3339  excinuclease ABC subunit A  42.24 
 
 		 967 aa  523  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818177 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3028  excinuclease ABC, A subunit  38.52 
 
 		 1976 aa  519  1e-146  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.500259  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1251  excinuclease ABC subunit A  41.84 
 
 		 971 aa  520  1e-146  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07070  Excinuclease ABC subunit A  40.1 
 
 		 954 aa  521  1e-146  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.478607 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1053  excinuclease ABC, A subunit  37.28 
 
 		 927 aa  521  1e-146  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00826345  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2823  excinuclease ABC, A subunit  40.99 
 
 		 980 aa  519  1e-146  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.179729  normal  0.122251 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3548  excinuclease ABC subunit A  42.11 
 
 		 967 aa  520  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.658203  normal  0.309926 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0816  excinuclease ABC, A subunit  40.37 
 
 		 983 aa  522  1e-146  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3747  UvrA family protein  38.52 
 
 		 1941 aa  520  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0596  excinuclease ABC, A subunit  36.25 
 
 		 943 aa  518  1.0000000000000001e-145  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.56752e-16 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0411  excinuclease ABC, A subunit  40.05 
 
 		 957 aa  516  1.0000000000000001e-145  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0572  excinuclease ABC, A subunit  43.2 
 
 		 976 aa  517  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.114911  normal  0.199492 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>