236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5544 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5544  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 
627 aa  1201    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2014  flagellar hook-associated protein  52.76 
 
 
618 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0951  flagellar hook-associated protein FlgK  53.22 
 
 
632 aa  548  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0338024 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0914  flagellar hook-associated protein FlgK  53.36 
 
 
632 aa  550  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0890  flagellar hook-associated protein FlgK  52.98 
 
 
632 aa  542  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2311  flagellar hook-associated protein FlgK  51.26 
 
 
623 aa  535  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0348946  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4185  flagellar hook-associated protein FlgK  50.96 
 
 
623 aa  512  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781196  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7241  putative flagellar hook-associated protein  44.15 
 
 
599 aa  394  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52345  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1668  flagellar hook-associated protein  37.4 
 
 
623 aa  332  8e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.121705 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4454  flagellar hook-associated protein FlgK  37.54 
 
 
623 aa  329  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3816  flagellar hook-associated protein  37.54 
 
 
623 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308813  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1332  flagellar hook-associated protein  36.36 
 
 
619 aa  325  1e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.143121  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5536  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  36.25 
 
 
611 aa  312  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1100  hypothetical protein  36.27 
 
 
622 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782435  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2543  flagellar hook-associated protein FlgK  35.74 
 
 
613 aa  297  4e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.24751  normal  0.159596 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1486  flagellar hook-associated protein  35.7 
 
 
626 aa  296  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2852  hypothetical protein  30.17 
 
 
727 aa  118  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0715  flagellar hook-associated protein FlgK  28.4 
 
 
587 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0768  flagellar hook-associated protein  28.73 
 
 
588 aa  109  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274286  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2697  flagellar hook-associated protein FlgK  29.87 
 
 
486 aa  108  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0079  flagellar hook-associated protein FlgK  30.82 
 
 
588 aa  106  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0654859 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0874  flagellar hook-associated protein  29.72 
 
 
588 aa  105  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2940  flagellar hook-associated protein FlgK  29.39 
 
 
482 aa  103  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.323756 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3556  flagellar hook-associated protein FlgK  30.91 
 
 
493 aa  102  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.83285 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1619  flagellar hook-associated protein FlgK  31.73 
 
 
690 aa  101  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  29.52 
 
 
637 aa  100  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  27.04 
 
 
647 aa  100  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3228  flagellar hook-associated protein FlgK  27.17 
 
 
531 aa  99.4  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4192  flagellar hook-associated protein FlgK  29.14 
 
 
484 aa  97.4  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  29.37 
 
 
631 aa  96.7  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3152  flagellar hook-associated protein  27.09 
 
 
696 aa  96.7  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4174  flagellar hook-associated protein FlgK  29.84 
 
 
487 aa  96.3  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1138  flagellar hook-associated protein FlgK  28.66 
 
 
484 aa  96.3  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  29.22 
 
 
546 aa  95.5  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2709  flagellar hook-associated protein FlgK  29.82 
 
 
566 aa  94.7  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  26.11 
 
 
477 aa  94  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1767  flagellar hook-associated protein FlgK  28.36 
 
 
549 aa  94  7e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0935  flagellar hook-associated protein FlgK  30.22 
 
 
640 aa  94  7e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.789193  normal  0.776781 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3378  flagellar hook-associated protein FlgK  29.28 
 
 
485 aa  93.2  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3275  flagellar hook-associated protein FlgK  31.36 
 
 
465 aa  92.4  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0192  flagellar hook-associated protein-like protein  28.21 
 
 
838 aa  91.7  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2422  flagellar hook-associated protein FlgK  28.98 
 
 
698 aa  91.3  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2236  flagellar hook-associated protein FlgK  24.7 
 
 
568 aa  91.3  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215386 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1675  flagellar hook-associated protein FlgK  26.09 
 
 
525 aa  89.4  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0765  flagellar hook-associated protein FlgK  28.25 
 
 
484 aa  89  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  27.11 
 
 
458 aa  88.6  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3962  flagellar hook-associated protein FlgK  27.13 
 
 
457 aa  87.8  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1330  flagellar hook-associated protein FlgK  26.33 
 
 
641 aa  87.4  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.493477  normal  0.0693976 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1562  flagellar hook-associated protein FlgK  29.46 
 
 
640 aa  87.8  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.776714  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0278  flagellar hook-associated protein FlgK  28.23 
 
 
487 aa  87  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0616827  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3459  flagellar hook-associated protein FlgK  27.13 
 
 
457 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1251  flagellar hook-associated protein FlgK  30.61 
 
 
553 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.294007 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1295  flagellar hook-associated protein FlgK  30.61 
 
 
553 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.216547  hitchhiker  0.000168062 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1280  flagellar hook-associated protein FlgK  30.61 
 
 
553 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.227106  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2005  flagellar hook-associated protein FlgK  30.61 
 
 
553 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00869488  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2189  flagellar hook-associated protein FlgK  30.61 
 
 
553 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000358653 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0109  flagellar hook-associated protein FlgK  26.67 
 
 
485 aa  86.3  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1486  flagellar hook-associated protein  26.06 
 
 
665 aa  85.5  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0841  flagellar hook-associated protein FlgK  22.56 
 
 
858 aa  85.1  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  22.15 
 
 
858 aa  85.5  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  26.46 
 
 
477 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0624  flagellar hook-associated protein FlgK  27.11 
 
 
642 aa  85.1  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2961  flagellar hook-associated protein FlgK  27.79 
 
 
548 aa  85.5  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  28.98 
 
 
920 aa  84.7  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000731  flagellar hook-associated protein FlgK  28.46 
 
 
457 aa  84.7  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  26.79 
 
 
478 aa  84.3  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0272  lateral flagellar hook associated protein 1  29.67 
 
 
458 aa  84.3  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.508781 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2046  flagellar hook-associated protein FlgK  28.18 
 
 
547 aa  83.6  0.000000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.147605  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1205  flagellar hook-associated protein FlgK  27.88 
 
 
547 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0984648  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2007  flagellar hook-associated protein FlgK  28.26 
 
 
554 aa  83.6  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2416  flagellar hook-associated protein FlgK  28.26 
 
 
554 aa  83.6  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.524278  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1205  flagellar hook-associated protein FlgK  27.88 
 
 
547 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223316  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2518  flagellar hook-associated protein FlgK  27.88 
 
 
547 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.38905  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3362  flagellar hook-associated protein FlgK  29.27 
 
 
458 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1461  flagellar hook-associated protein FlgK  27.88 
 
 
547 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.597207  hitchhiker  0.00000199333 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2243  flagellar hook-associated protein FlgK  27.88 
 
 
547 aa  83.6  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39076  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2314  flagellar hook-associated protein FlgK  28.26 
 
 
554 aa  83.6  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2588  flagellar hook-associated protein FlgK  25.71 
 
 
641 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01078  flagellar hook-associated protein K  27.88 
 
 
547 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0929939  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2564  flagellar hook-associated protein FlgK  27.88 
 
 
547 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141155  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4195  flagellar hook-associated protein FlgK  27.65 
 
 
583 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1465  hypothetical protein  29.65 
 
 
630 aa  82.4  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0746  flagellar hook-associated protein FlgK  28.44 
 
 
486 aa  82.4  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01086  hypothetical protein  27.88 
 
 
547 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0870613  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6507  flagellar hook-associated protein FlgK  29.97 
 
 
483 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0419399 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3031  flagellar hook-associated protein FlgK  24.11 
 
 
541 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1233  flagellar hook-associated protein FlgK  28.21 
 
 
649 aa  82  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3722  flagellar hook-associated protein FlgK  29.74 
 
 
682 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912504  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24090  flagellar hook-associated protein  28.57 
 
 
541 aa  82  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  25.23 
 
 
456 aa  82  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1233  flagellar hook-associated protein FlgK  28.21 
 
 
649 aa  81.3  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  24.34 
 
 
480 aa  81.3  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1628  flagellar hook-associated protein FlgK  30.99 
 
 
629 aa  80.5  0.00000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.770281 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1121  flagellar hook-associated protein FlgK  23.68 
 
 
456 aa  80.5  0.00000000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1944  flagellar hook-associated protein FlgK  31.05 
 
 
686 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0163464  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0691  flagellar hook-associated protein FlgK  29.34 
 
 
713 aa  80.1  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.805138 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1111  flagellar hook-associated protein FlgK  29.32 
 
 
688 aa  79.3  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0676298  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2001  flagellar hook-associated protein FlgK  25.86 
 
 
715 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0532033  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2964  flagellar hook-associated protein FlgK  27.71 
 
 
481 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2239  flagellar hook-associated protein FlgK  27.81 
 
 
464 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>